Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EDI9

Protein Details
Accession H0EDI9    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-230VQGDSTQKKKKKSGKGPKEPNPLAVHydrophilic
257-283PSGTIESGGKRKRRRKPKSSTEGAAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-191TKFRAGLKRGSGSLKRKR
213-238KKKKKSGKGPKEPNPLAVKKSKKSKS
265-274GKRKRRRKPK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRGKRAKQYKKLMQQYGLSYGFREPYQVLVDSGILRDADKFKMDLVGGLERTLQGQVKPMITQCSMRHLYAASSEPGVSYLIDKAKTYERRRCGHRPEEYPEPLSEQDCLASVVDPKNNKTNKNCYVVASQEIDVRKHMRGVMGVPLVYIARSVMIMEPMADATSDNREREERTKFRAGLKRGSGSLKRKREDDPDEGGEGKTDGVQGDSTQKKKKKSGKGPKEPNPLAVKKSKKSKSVESGESKKAEDVESSNPDPSGTIESGGKRKRRRKPKSSTEGAAADGSEAVNEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.7
3 0.67
4 0.59
5 0.49
6 0.4
7 0.35
8 0.32
9 0.26
10 0.24
11 0.17
12 0.17
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.16
19 0.16
20 0.14
21 0.11
22 0.1
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.15
41 0.11
42 0.16
43 0.19
44 0.19
45 0.21
46 0.22
47 0.24
48 0.24
49 0.28
50 0.24
51 0.3
52 0.31
53 0.3
54 0.29
55 0.25
56 0.24
57 0.22
58 0.24
59 0.16
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.09
66 0.08
67 0.1
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.23
73 0.32
74 0.39
75 0.45
76 0.5
77 0.56
78 0.64
79 0.71
80 0.72
81 0.71
82 0.72
83 0.69
84 0.67
85 0.69
86 0.65
87 0.57
88 0.48
89 0.43
90 0.35
91 0.3
92 0.24
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.08
98 0.07
99 0.09
100 0.11
101 0.14
102 0.16
103 0.17
104 0.25
105 0.28
106 0.33
107 0.36
108 0.43
109 0.46
110 0.5
111 0.49
112 0.44
113 0.43
114 0.39
115 0.35
116 0.28
117 0.22
118 0.2
119 0.2
120 0.18
121 0.17
122 0.18
123 0.16
124 0.15
125 0.15
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.07
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.1
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.23
158 0.31
159 0.3
160 0.35
161 0.41
162 0.42
163 0.5
164 0.54
165 0.53
166 0.52
167 0.51
168 0.47
169 0.43
170 0.46
171 0.45
172 0.47
173 0.53
174 0.54
175 0.53
176 0.53
177 0.55
178 0.58
179 0.57
180 0.53
181 0.5
182 0.44
183 0.43
184 0.41
185 0.37
186 0.28
187 0.22
188 0.16
189 0.1
190 0.08
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.15
196 0.21
197 0.26
198 0.34
199 0.39
200 0.45
201 0.54
202 0.63
203 0.66
204 0.72
205 0.78
206 0.81
207 0.87
208 0.91
209 0.92
210 0.93
211 0.83
212 0.79
213 0.76
214 0.68
215 0.62
216 0.61
217 0.59
218 0.55
219 0.65
220 0.64
221 0.64
222 0.66
223 0.71
224 0.72
225 0.72
226 0.74
227 0.72
228 0.73
229 0.71
230 0.67
231 0.58
232 0.5
233 0.43
234 0.35
235 0.28
236 0.24
237 0.25
238 0.29
239 0.3
240 0.3
241 0.28
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.22
246 0.16
247 0.16
248 0.18
249 0.23
250 0.32
251 0.39
252 0.46
253 0.51
254 0.61
255 0.69
256 0.77
257 0.83
258 0.85
259 0.89
260 0.92
261 0.92
262 0.92
263 0.86
264 0.82
265 0.73
266 0.64
267 0.53
268 0.42
269 0.32
270 0.23
271 0.17