FuNGI

A0A1Y1VM54

Protein Details

Accession

A0A1Y1VM54

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
191-210	VYNSKPKTRKTIMNRFKPKE	Hydrophilic
382-406	VKEIEREKSKARKPKKNELENLERD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
387-397	REKSKARKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002755 DNA_primase_S IPR014052 DNA_primase_ssu_euk/arc
Gene Ontology	GO:0005658 C:alpha DNA polymerase:primase complex GO:0000785 C:chromatin GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003896 F:DNA primase activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006270 P:DNA replication initiation
Pfam	View protein in Pfam PF01896 DNA_primase_S
CDD	cd04860 AE_Prim_S

Amino Acid Sequences

MDNSMDVDEVEIQDALIKDATEDVNNLNISENTEQLKDDDEFGDDNLDDIDIDEDDIKFLMSPQPGKTMKMSTQSNSTNLNFNSTQNSIINSNTRVTSINSSVSQKFLNLSIEDKKFLDNLKNYYEFFFPIKKYYKWLSYGNVDKDYFTHREFSFTLHPEVYLRFQSFETEKEFKEKLLEYIPKKIDIGAVYNSKPKTRKTIMNRFKPKEKELVFDIDMTDYDDIRTCCTGGNICKKCWTFMTISIKIIDRALRDDFGFKKILWVYSGRRGVHCWVCDNRARKLSESARKAIVSYLEIIKGGEQQSRKVKLPKILHPSLNYAYDIIKQYFPKLILEDMDIFNKEEYYENLLSIIPYEDIRNNLRNSWKNSIHSPQNKWNEFVKEIEREKSKARKPKKNELENLERDIIFQYTYPRLDFNVSLHLNHLLKSPFCIHPGTGRVCVPINPENCDDFNPFDVPTLNELCEEIDSRRENGISPSPNDLQNNTAIAPYIKQFSDFVKSLEDEINQMRIIKREISERNLDY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.12
4	0.11
5	0.1
6	0.13
7	0.15
8	0.13
9	0.14
10	0.14
11	0.18
12	0.18
13	0.18
14	0.17
15	0.16
16	0.19
17	0.2
18	0.21
19	0.19
20	0.2
21	0.2
22	0.18
23	0.22
24	0.19
25	0.2
26	0.17
27	0.17
28	0.17
29	0.16
30	0.18
31	0.14
32	0.13
33	0.11
34	0.1
35	0.08
36	0.08
37	0.08
38	0.06
39	0.07
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.08
47	0.13
48	0.16
49	0.19
50	0.21
51	0.3
52	0.31
53	0.34
54	0.36
55	0.36
56	0.37
57	0.42
58	0.44
59	0.38
60	0.45
61	0.46
62	0.45
63	0.45
64	0.42
65	0.41
66	0.37
67	0.4
68	0.33
69	0.31
70	0.33
71	0.28
72	0.3
73	0.24
74	0.26
75	0.21
76	0.23
77	0.25
78	0.22
79	0.23
80	0.21
81	0.21
82	0.2
83	0.22
84	0.24
85	0.23
86	0.24
87	0.25
88	0.29
89	0.29
90	0.29
91	0.27
92	0.22
93	0.21
94	0.19
95	0.2
96	0.16
97	0.19
98	0.25
99	0.26
100	0.28
101	0.27
102	0.26
103	0.25
104	0.27
105	0.31
106	0.29
107	0.31
108	0.35
109	0.37
110	0.37
111	0.37
112	0.35
113	0.29
114	0.27
115	0.27
116	0.23
117	0.27
118	0.31
119	0.3
120	0.35
121	0.38
122	0.41
123	0.4
124	0.43
125	0.41
126	0.43
127	0.5
128	0.48
129	0.48
130	0.43
131	0.38
132	0.36
133	0.37
134	0.33
135	0.26
136	0.27
137	0.22
138	0.26
139	0.26
140	0.28
141	0.3
142	0.29
143	0.31
144	0.25
145	0.26
146	0.23
147	0.24
148	0.23
149	0.19
150	0.17
151	0.16
152	0.16
153	0.19
154	0.19
155	0.2
156	0.24
157	0.24
158	0.23
159	0.27
160	0.28
161	0.24
162	0.27
163	0.26
164	0.21
165	0.26
166	0.32
167	0.29
168	0.38
169	0.38
170	0.36
171	0.35
172	0.33
173	0.28
174	0.21
175	0.22
176	0.18
177	0.2
178	0.2
179	0.26
180	0.26
181	0.28
182	0.3
183	0.29
184	0.34
185	0.36
186	0.44
187	0.49
188	0.59
189	0.65
190	0.72
191	0.8
192	0.77
193	0.8
194	0.76
195	0.69
196	0.67
197	0.59
198	0.51
199	0.43
200	0.44
201	0.36
202	0.31
203	0.28
204	0.19
205	0.17
206	0.15
207	0.13
208	0.07
209	0.07
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.1
217	0.13
218	0.16
219	0.27
220	0.28
221	0.29
222	0.35
223	0.35
224	0.35
225	0.33
226	0.3
227	0.22
228	0.27
229	0.35
230	0.31
231	0.31
232	0.31
233	0.31
234	0.28
235	0.27
236	0.21
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.16
243	0.16
244	0.17
245	0.17
246	0.14
247	0.17
248	0.17
249	0.17
250	0.15
251	0.17
252	0.18
253	0.24
254	0.3
255	0.27
256	0.26
257	0.28
258	0.31
259	0.32
260	0.3
261	0.26
262	0.23
263	0.26
264	0.31
265	0.33
266	0.33
267	0.35
268	0.35
269	0.32
270	0.38
271	0.42
272	0.46
273	0.46
274	0.44
275	0.41
276	0.4
277	0.38
278	0.32
279	0.24
280	0.17
281	0.14
282	0.13
283	0.11
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.12
288	0.12
289	0.14
290	0.13
291	0.18
292	0.26
293	0.3
294	0.33
295	0.36
296	0.39
297	0.44
298	0.5
299	0.53
300	0.54
301	0.55
302	0.55
303	0.51
304	0.52
305	0.45
306	0.4
307	0.32
308	0.24
309	0.2
310	0.2
311	0.2
312	0.17
313	0.18
314	0.17
315	0.18
316	0.2
317	0.2
318	0.18
319	0.16
320	0.16
321	0.13
322	0.15
323	0.16
324	0.14
325	0.15
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.12
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.15
334	0.15
335	0.14
336	0.15
337	0.15
338	0.14
339	0.14
340	0.13
341	0.07
342	0.07
343	0.09
344	0.09
345	0.12
346	0.16
347	0.21
348	0.21
349	0.25
350	0.33
351	0.38
352	0.43
353	0.48
354	0.49
355	0.47
356	0.51
357	0.55
358	0.56
359	0.58
360	0.58
361	0.59
362	0.64
363	0.62
364	0.6
365	0.59
366	0.53
367	0.47
368	0.44
369	0.4
370	0.38
371	0.39
372	0.42
373	0.4
374	0.38
375	0.44
376	0.5
377	0.53
378	0.55
379	0.63
380	0.67
381	0.72
382	0.81
383	0.85
384	0.85
385	0.85
386	0.84
387	0.84
388	0.78
389	0.74
390	0.66
391	0.55
392	0.46
393	0.38
394	0.3
395	0.2
396	0.16
397	0.16
398	0.17
399	0.18
400	0.18
401	0.18
402	0.19
403	0.21
404	0.22
405	0.19
406	0.24
407	0.24
408	0.23
409	0.24
410	0.28
411	0.25
412	0.25
413	0.27
414	0.21
415	0.2
416	0.23
417	0.27
418	0.23
419	0.25
420	0.26
421	0.23
422	0.27
423	0.33
424	0.34
425	0.33
426	0.31
427	0.31
428	0.31
429	0.31
430	0.31
431	0.32
432	0.3
433	0.31
434	0.33
435	0.34
436	0.34
437	0.35
438	0.32
439	0.28
440	0.28
441	0.25
442	0.22
443	0.2
444	0.21
445	0.19
446	0.21
447	0.21
448	0.18
449	0.17
450	0.17
451	0.17
452	0.17
453	0.17
454	0.14
455	0.19
456	0.21
457	0.23
458	0.25
459	0.24
460	0.24
461	0.28
462	0.35
463	0.33
464	0.33
465	0.38
466	0.38
467	0.42
468	0.43
469	0.39
470	0.33
471	0.31
472	0.3
473	0.24
474	0.22
475	0.18
476	0.17
477	0.17
478	0.17
479	0.18
480	0.16
481	0.17
482	0.18
483	0.21
484	0.27
485	0.27
486	0.25
487	0.26
488	0.27
489	0.28
490	0.3
491	0.27
492	0.24
493	0.26
494	0.27
495	0.24
496	0.26
497	0.25
498	0.26
499	0.28
500	0.29
501	0.29
502	0.36
503	0.42
504	0.45

A0A1Y1VM54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer