Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V685

Protein Details
Accession A0A1Y1V685    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSSSSSRHPHQHHHSQHQHHSQHHHydrophilic
140-161NDEFEKRKKRSVRPQVSWLRRTHydrophilic
362-388FYNVIKSKLSLRKKRARSKYATQVEFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-378RKKRAR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSSSSSRHPHQHHHSQHQHHSQHHSQSQHASQSHHHSLHHHRKPGSGFLCRQKFQNNLPEIPFNPKLVEFPFPRDRLYSFKNSQLIENAPYKMFPPDNELGIPLNLIDMKVFDEGPENRFINPTEPPPVHEDDKILLISNDEFEKRKKRSVRPQVSWLRRTEYISNEVSNKFLKNNEFTEVKMGLSVAKDEAIKDVDLSVNGQIKSITRTFKIINETDLFNIKHPTKSHLKAVEIFPIFPDFVRWPNTYSHVQYNSSPINNNDGKDALEKVDEITSTQLSNAILKPMQNPLDPSETFLSYFKPSVETAKKIKRSREDSDDEEIDDEEQEFNFVRDFEYDTNTDSKKNKKIFFTFNPEQGGAFYNVIKSKLSLRKKRARSKYATQVEFDKPNRIELTKREFTSAEEQERRSKLKSILTKDRIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.86
4 0.86
5 0.84
6 0.79
7 0.78
8 0.75
9 0.75
10 0.72
11 0.65
12 0.59
13 0.6
14 0.59
15 0.58
16 0.53
17 0.46
18 0.46
19 0.52
20 0.56
21 0.51
22 0.47
23 0.46
24 0.54
25 0.62
26 0.64
27 0.63
28 0.57
29 0.61
30 0.63
31 0.66
32 0.61
33 0.58
34 0.57
35 0.59
36 0.66
37 0.61
38 0.61
39 0.59
40 0.58
41 0.57
42 0.6
43 0.55
44 0.51
45 0.54
46 0.54
47 0.49
48 0.51
49 0.46
50 0.37
51 0.33
52 0.29
53 0.28
54 0.26
55 0.31
56 0.26
57 0.31
58 0.39
59 0.38
60 0.39
61 0.39
62 0.39
63 0.39
64 0.43
65 0.44
66 0.39
67 0.45
68 0.48
69 0.46
70 0.46
71 0.43
72 0.39
73 0.34
74 0.35
75 0.3
76 0.25
77 0.25
78 0.24
79 0.25
80 0.23
81 0.19
82 0.23
83 0.23
84 0.25
85 0.24
86 0.25
87 0.21
88 0.2
89 0.19
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.13
101 0.15
102 0.17
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.23
107 0.23
108 0.2
109 0.21
110 0.22
111 0.23
112 0.23
113 0.25
114 0.28
115 0.31
116 0.31
117 0.29
118 0.27
119 0.21
120 0.23
121 0.21
122 0.17
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.16
131 0.26
132 0.28
133 0.36
134 0.44
135 0.52
136 0.62
137 0.71
138 0.77
139 0.74
140 0.81
141 0.83
142 0.82
143 0.78
144 0.69
145 0.62
146 0.54
147 0.51
148 0.45
149 0.38
150 0.34
151 0.31
152 0.3
153 0.29
154 0.27
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.2
162 0.22
163 0.24
164 0.23
165 0.22
166 0.25
167 0.22
168 0.18
169 0.15
170 0.13
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.13
196 0.16
197 0.17
198 0.2
199 0.24
200 0.22
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.2
205 0.22
206 0.19
207 0.15
208 0.19
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.24
213 0.27
214 0.3
215 0.35
216 0.35
217 0.36
218 0.36
219 0.37
220 0.39
221 0.32
222 0.29
223 0.23
224 0.21
225 0.19
226 0.15
227 0.16
228 0.09
229 0.12
230 0.17
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.24
235 0.25
236 0.26
237 0.29
238 0.28
239 0.29
240 0.27
241 0.31
242 0.29
243 0.27
244 0.26
245 0.21
246 0.26
247 0.26
248 0.26
249 0.22
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.15
273 0.19
274 0.21
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.27
279 0.26
280 0.27
281 0.24
282 0.22
283 0.23
284 0.21
285 0.21
286 0.17
287 0.18
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.22
292 0.26
293 0.29
294 0.36
295 0.45
296 0.53
297 0.57
298 0.64
299 0.65
300 0.68
301 0.7
302 0.7
303 0.67
304 0.63
305 0.64
306 0.57
307 0.48
308 0.41
309 0.34
310 0.25
311 0.2
312 0.15
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.24
328 0.24
329 0.28
330 0.31
331 0.38
332 0.43
333 0.5
334 0.54
335 0.57
336 0.64
337 0.67
338 0.71
339 0.72
340 0.69
341 0.66
342 0.64
343 0.56
344 0.48
345 0.4
346 0.35
347 0.27
348 0.23
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.2
353 0.2
354 0.18
355 0.25
356 0.33
357 0.43
358 0.5
359 0.58
360 0.67
361 0.78
362 0.87
363 0.89
364 0.89
365 0.87
366 0.87
367 0.88
368 0.88
369 0.8
370 0.72
371 0.68
372 0.64
373 0.64
374 0.57
375 0.55
376 0.45
377 0.48
378 0.49
379 0.44
380 0.44
381 0.43
382 0.51
383 0.5
384 0.5
385 0.48
386 0.45
387 0.47
388 0.51
389 0.5
390 0.51
391 0.49
392 0.51
393 0.56
394 0.61
395 0.6
396 0.54
397 0.53
398 0.49
399 0.53
400 0.59
401 0.6
402 0.66