FuNGI

A0A1Y1V6E7

Protein Details

Accession

A0A1Y1V6E7

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-119	NNNSSQKILDPKKRKIKKESKTTATNES	Hydrophilic
125-153	DIALSKRRKTTPLKKVKKEIKTEIKKEIE	Hydrophilic
163-217	EIKTEEPKKATKRTRVKKEEDDEKPSKKKKTTAKVKEEKVSKKKKKEEEEDEVFR	Basic
702-722	EKELEKKKAKLERDNEKRKID	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
102-110	PKKRKIKKE
130-208	KRRKTTPLKKVKKEIKTEIKKEIETEIKREIKREIKTEEPKKATKRTRVKKEEDDEKPSKKKKTTAKVKEEKVSKKKKK
679-691	KKKKPELGRLSRG
702-720	EKELEKKKAKLERDNEKRK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011010 DNA_brk_join_enz IPR013034 DNA_topo_DNA_db_N_dom1 IPR013030 DNA_topo_DNA_db_N_dom2 IPR001631 TopoI IPR018521 TopoI_AS IPR025834 TopoI_C_dom IPR014711 TopoI_cat_a-hlx-sub_euk IPR014727 TopoI_cat_a/b-sub_euk IPR013500 TopoI_cat_euk IPR008336 TopoI_DNA-bd_euk IPR036202 TopoI_DNA-bd_euk_N_sf IPR013499 TopoI_euk
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005730 C:nucleolus GO:0031298 C:replication fork protection complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006271 P:DNA strand elongation involved in DNA replication GO:0006265 P:DNA topological change GO:0007076 P:mitotic chromosome condensation GO:0007097 P:nuclear migration GO:0000183 P:rDNA heterochromatin formation GO:0000019 P:regulation of mitotic recombination GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0009303 P:rRNA transcription GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14370 Topo_C_assoc PF01028 Topoisom_I PF02919 Topoisom_I_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00176 TOPOISOMERASE_I_EUK
CDD	cd00659 Topo_IB_C cd00660 Topoisomer_IB_N

Amino Acid Sequences

MSNSDQSYFDSEEEIQEQENNPELIKTNEIVEDSDSDSDSEDDVPISQRRTKLNSTTSSISDATLINDKINSHSSSSSDSDSDQPLSKRMPNNNSSQKILDPKKRKIKKESKTTATNESSDSEDDIALSKRRKTTPLKKVKKEIKTEIKKEIETEIKREIKREIKTEEPKKATKRTRVKKEEDDEKPSKKKKTTAKVKEEKVSKKKKKEEEEDEVFRWWDNEKEDDSIKWTTLEHQGPYFPPEYVSHGIKMKYKGEPIDLVPECEEVANFYAQVIGTDWGENPTFRKNFFKDFLKVIKKKQPNCPIKKFEDCDFTPLTEYFTEQKEKRKAMTKEEKEVIKKEKQEIEDKYGWALLDERKEKVGNFRIEPPGLFRGRGEHPKTGTLKYRVYPESVTINIGKNAKIPEPPEGHKWGKIIHDNTVTWLAMWKENVNDSFKYVWLAAGSSLKGQSDFKKFEKARELKKHIGKIREEYTLELKDKLMATRQRATALYFIDKLALRAGNEKGDDVADTVGCCSLRYEHVTLEPPNRVIFDFLGKDSIRYYNEVEVSKQVYKNIEIFKRAPKKEGDMLFDRLNTTILNKYLQKSMKGLTAKVFRTYNASYTFQEELKKTVKNSTMNEKLLAYNRANRQVAILCNHQRAVSKNHSDQLKRIQDKILTSKYQRYLVSKEMLELDPTLKKKKPELGRLSRGITKEFIKSYEEKELEKKKAKLERDNEKRKIDGKELLTLEDMEKAKRQPSMERLQKQYDTLSKRIKAQQVLLIDKDENKATALGTSKINYIDPRISAAWCYKYDVPIEKIFNKSLRNKFKWAVEVDENFVF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.17
3	0.18
4	0.2
5	0.19
6	0.23
7	0.21
8	0.19
9	0.2
10	0.21
11	0.2
12	0.22
13	0.2
14	0.18
15	0.19
16	0.2
17	0.2
18	0.2
19	0.19
20	0.19
21	0.19
22	0.17
23	0.15
24	0.15
25	0.15
26	0.14
27	0.13
28	0.11
29	0.1
30	0.11
31	0.15
32	0.18
33	0.21
34	0.25
35	0.3
36	0.35
37	0.42
38	0.47
39	0.52
40	0.57
41	0.58
42	0.6
43	0.59
44	0.54
45	0.52
46	0.45
47	0.37
48	0.3
49	0.24
50	0.21
51	0.23
52	0.22
53	0.18
54	0.19
55	0.2
56	0.21
57	0.25
58	0.25
59	0.21
60	0.22
61	0.23
62	0.27
63	0.29
64	0.28
65	0.24
66	0.24
67	0.25
68	0.27
69	0.28
70	0.28
71	0.26
72	0.28
73	0.31
74	0.36
75	0.4
76	0.46
77	0.52
78	0.52
79	0.61
80	0.68
81	0.67
82	0.65
83	0.59
84	0.55
85	0.56
86	0.6
87	0.6
88	0.59
89	0.66
90	0.73
91	0.8
92	0.84
93	0.85
94	0.87
95	0.86
96	0.88
97	0.88
98	0.86
99	0.86
100	0.82
101	0.8
102	0.73
103	0.64
104	0.55
105	0.46
106	0.4
107	0.32
108	0.29
109	0.2
110	0.16
111	0.14
112	0.14
113	0.16
114	0.19
115	0.22
116	0.25
117	0.31
118	0.35
119	0.42
120	0.51
121	0.59
122	0.64
123	0.72
124	0.78
125	0.8
126	0.88
127	0.9
128	0.88
129	0.86
130	0.86
131	0.85
132	0.85
133	0.82
134	0.81
135	0.77
136	0.68
137	0.61
138	0.57
139	0.55
140	0.47
141	0.46
142	0.45
143	0.47
144	0.47
145	0.48
146	0.49
147	0.48
148	0.5
149	0.52
150	0.49
151	0.51
152	0.61
153	0.67
154	0.69
155	0.67
156	0.7
157	0.71
158	0.75
159	0.74
160	0.75
161	0.77
162	0.78
163	0.83
164	0.85
165	0.86
166	0.86
167	0.86
168	0.85
169	0.81
170	0.8
171	0.76
172	0.75
173	0.77
174	0.74
175	0.73
176	0.69
177	0.7
178	0.7
179	0.74
180	0.77
181	0.78
182	0.81
183	0.83
184	0.84
185	0.84
186	0.83
187	0.83
188	0.82
189	0.82
190	0.81
191	0.82
192	0.85
193	0.86
194	0.87
195	0.87
196	0.86
197	0.84
198	0.82
199	0.78
200	0.7
201	0.62
202	0.52
203	0.41
204	0.33
205	0.24
206	0.2
207	0.16
208	0.18
209	0.18
210	0.21
211	0.22
212	0.22
213	0.24
214	0.22
215	0.2
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.23
220	0.25
221	0.22
222	0.22
223	0.24
224	0.24
225	0.27
226	0.25
227	0.17
228	0.16
229	0.16
230	0.2
231	0.22
232	0.23
233	0.22
234	0.25
235	0.27
236	0.3
237	0.33
238	0.31
239	0.31
240	0.32
241	0.31
242	0.3
243	0.31
244	0.27
245	0.32
246	0.29
247	0.27
248	0.24
249	0.22
250	0.2
251	0.17
252	0.16
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.07
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.17
271	0.18
272	0.19
273	0.26
274	0.27
275	0.33
276	0.38
277	0.42
278	0.37
279	0.41
280	0.49
281	0.52
282	0.53
283	0.54
284	0.59
285	0.61
286	0.65
287	0.7
288	0.71
289	0.72
290	0.77
291	0.8
292	0.78
293	0.76
294	0.77
295	0.7
296	0.63
297	0.6
298	0.51
299	0.46
300	0.39
301	0.33
302	0.27
303	0.24
304	0.22
305	0.15
306	0.16
307	0.14
308	0.16
309	0.21
310	0.21
311	0.3
312	0.35
313	0.37
314	0.39
315	0.46
316	0.47
317	0.51
318	0.6
319	0.57
320	0.57
321	0.6
322	0.61
323	0.55
324	0.57
325	0.53
326	0.47
327	0.46
328	0.45
329	0.45
330	0.44
331	0.48
332	0.46
333	0.47
334	0.44
335	0.4
336	0.35
337	0.3
338	0.27
339	0.19
340	0.18
341	0.13
342	0.17
343	0.19
344	0.19
345	0.2
346	0.21
347	0.21
348	0.26
349	0.31
350	0.29
351	0.29
352	0.33
353	0.35
354	0.35
355	0.34
356	0.3
357	0.28
358	0.25
359	0.23
360	0.18
361	0.19
362	0.23
363	0.31
364	0.32
365	0.3
366	0.3
367	0.36
368	0.39
369	0.37
370	0.4
371	0.36
372	0.35
373	0.33
374	0.37
375	0.32
376	0.32
377	0.29
378	0.24
379	0.23
380	0.2
381	0.2
382	0.16
383	0.16
384	0.17
385	0.17
386	0.16
387	0.15
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.17
392	0.2
393	0.23
394	0.25
395	0.26
396	0.31
397	0.31
398	0.3
399	0.3
400	0.26
401	0.26
402	0.3
403	0.28
404	0.25
405	0.27
406	0.25
407	0.26
408	0.25
409	0.21
410	0.15
411	0.15
412	0.12
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.09
417	0.11
418	0.13
419	0.14
420	0.14
421	0.14
422	0.14
423	0.14
424	0.14
425	0.12
426	0.11
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.1
437	0.14
438	0.19
439	0.23
440	0.24
441	0.34
442	0.34
443	0.38
444	0.47
445	0.49
446	0.53
447	0.59
448	0.65
449	0.63
450	0.69
451	0.72
452	0.66
453	0.66
454	0.59
455	0.54
456	0.5
457	0.46
458	0.41
459	0.35
460	0.34
461	0.31
462	0.29
463	0.25
464	0.21
465	0.19
466	0.19
467	0.18
468	0.21
469	0.21
470	0.25
471	0.29
472	0.3
473	0.3
474	0.3
475	0.3
476	0.26
477	0.24
478	0.21
479	0.17
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.15
484	0.14
485	0.13
486	0.11
487	0.14
488	0.16
489	0.15
490	0.15
491	0.15
492	0.13
493	0.12
494	0.12
495	0.09
496	0.09
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.1
506	0.14
507	0.15
508	0.14
509	0.18
510	0.21
511	0.24
512	0.26
513	0.26
514	0.23
515	0.22
516	0.22
517	0.19
518	0.17
519	0.15
520	0.14
521	0.14
522	0.13
523	0.18
524	0.17
525	0.17
526	0.17
527	0.2
528	0.17
529	0.18
530	0.19
531	0.19
532	0.23
533	0.23
534	0.22
535	0.22
536	0.24
537	0.26
538	0.25
539	0.24
540	0.22
541	0.23
542	0.27
543	0.32
544	0.31
545	0.31
546	0.33
547	0.41
548	0.49
549	0.48
550	0.47
551	0.43
552	0.45
553	0.48
554	0.49
555	0.45
556	0.39
557	0.42
558	0.39
559	0.38
560	0.33
561	0.26
562	0.22
563	0.17
564	0.14
565	0.13
566	0.13
567	0.16
568	0.18
569	0.2
570	0.26
571	0.29
572	0.29
573	0.28
574	0.28
575	0.32
576	0.31
577	0.3
578	0.3
579	0.35
580	0.34
581	0.37
582	0.35
583	0.29
584	0.34
585	0.34
586	0.32
587	0.29
588	0.31
589	0.27
590	0.3
591	0.32
592	0.27
593	0.3
594	0.26
595	0.26
596	0.27
597	0.29
598	0.27
599	0.32
600	0.37
601	0.39
602	0.42
603	0.47
604	0.51
605	0.49
606	0.49
607	0.44
608	0.4
609	0.39
610	0.4
611	0.33
612	0.32
613	0.36
614	0.43
615	0.42
616	0.39
617	0.37
618	0.36
619	0.37
620	0.34
621	0.37
622	0.34
623	0.36
624	0.36
625	0.35
626	0.34
627	0.34
628	0.38
629	0.39
630	0.41
631	0.42
632	0.47
633	0.52
634	0.51
635	0.52
636	0.55
637	0.56
638	0.52
639	0.51
640	0.5
641	0.47
642	0.5
643	0.54
644	0.51
645	0.46
646	0.47
647	0.52
648	0.52
649	0.54
650	0.51
651	0.48
652	0.45
653	0.44
654	0.46
655	0.38
656	0.36
657	0.34
658	0.32
659	0.28
660	0.24
661	0.22
662	0.23
663	0.26
664	0.31
665	0.3
666	0.34
667	0.39
668	0.47
669	0.53
670	0.58
671	0.66
672	0.7
673	0.74
674	0.76
675	0.75
676	0.71
677	0.63
678	0.54
679	0.47
680	0.39
681	0.36
682	0.32
683	0.3
684	0.29
685	0.31
686	0.32
687	0.39
688	0.38
689	0.35
690	0.43
691	0.5
692	0.54
693	0.6
694	0.6
695	0.58
696	0.65
697	0.71
698	0.72
699	0.72
700	0.74
701	0.77
702	0.84
703	0.83
704	0.79
705	0.76
706	0.72
707	0.69
708	0.64
709	0.61
710	0.53
711	0.53
712	0.49
713	0.46
714	0.4
715	0.35
716	0.3
717	0.28
718	0.26
719	0.2
720	0.23
721	0.25
722	0.27
723	0.3
724	0.32
725	0.34
726	0.42
727	0.51
728	0.56
729	0.62
730	0.65
731	0.68
732	0.68
733	0.62
734	0.6
735	0.58
736	0.54
737	0.55
738	0.57
739	0.53
740	0.58
741	0.64
742	0.64
743	0.61
744	0.59
745	0.56
746	0.55
747	0.56
748	0.5
749	0.45
750	0.4
751	0.37
752	0.35
753	0.31
754	0.24
755	0.2
756	0.19
757	0.16
758	0.18
759	0.19
760	0.18
761	0.2
762	0.21
763	0.22
764	0.23
765	0.25
766	0.24
767	0.26
768	0.27
769	0.25
770	0.28
771	0.28
772	0.27
773	0.28
774	0.32
775	0.32
776	0.3
777	0.35
778	0.33
779	0.34
780	0.39
781	0.42
782	0.41
783	0.43
784	0.49
785	0.48
786	0.5
787	0.52
788	0.52
789	0.53
790	0.58
791	0.62
792	0.66
793	0.67
794	0.7
795	0.7
796	0.72
797	0.71
798	0.65
799	0.62
800	0.59
801	0.57

A0A1Y1V6E7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer