Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VLP4

Protein Details
Accession A0A1Y1VLP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-265LSDLRPNKLLARKIRRKKFLEMEEEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
251-256RKIRRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16651  SPL-RING_NSE2  
Amino Acid Sequences MDTNSMENMVMVNKLSAILNEQYKLMTDMQNSLNHIKELAADKLDYTELYQDKSDSNKEKFNVDDYEKKYITQLNYIEDLTVQKKAIEEIKQKLNLDEDIGSVTREYNDILEKEKDHFNNQPKYKRYAANKEFKEFRETLWDVKSEGKTMPSLLIYTRQKYAYDDDDMTMDTVEDEDDDIVITNRQESFKCPITKRIMTDPLISRRCEHSYSSIIKEMINKSQERRIECPVAGCIHFVTLSDLRPNKLLARKIRRKKFLEMEEEMEEREKYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.12
5 0.16
6 0.18
7 0.19
8 0.19
9 0.18
10 0.19
11 0.22
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.22
16 0.25
17 0.28
18 0.31
19 0.31
20 0.3
21 0.27
22 0.26
23 0.21
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.15
33 0.12
34 0.16
35 0.15
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.22
41 0.29
42 0.3
43 0.33
44 0.37
45 0.38
46 0.4
47 0.39
48 0.39
49 0.38
50 0.36
51 0.41
52 0.39
53 0.45
54 0.42
55 0.41
56 0.39
57 0.38
58 0.34
59 0.32
60 0.3
61 0.25
62 0.27
63 0.27
64 0.24
65 0.2
66 0.21
67 0.16
68 0.16
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.18
74 0.23
75 0.27
76 0.31
77 0.37
78 0.41
79 0.41
80 0.4
81 0.37
82 0.3
83 0.26
84 0.21
85 0.14
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.09
96 0.09
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.16
101 0.21
102 0.21
103 0.23
104 0.29
105 0.34
106 0.42
107 0.48
108 0.53
109 0.51
110 0.55
111 0.56
112 0.55
113 0.55
114 0.56
115 0.58
116 0.6
117 0.59
118 0.58
119 0.58
120 0.52
121 0.51
122 0.4
123 0.32
124 0.31
125 0.3
126 0.27
127 0.25
128 0.24
129 0.2
130 0.24
131 0.24
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.26
149 0.21
150 0.22
151 0.21
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.12
157 0.09
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.13
175 0.19
176 0.26
177 0.33
178 0.33
179 0.4
180 0.47
181 0.5
182 0.51
183 0.53
184 0.52
185 0.47
186 0.51
187 0.49
188 0.51
189 0.51
190 0.48
191 0.43
192 0.41
193 0.43
194 0.39
195 0.35
196 0.31
197 0.34
198 0.38
199 0.39
200 0.38
201 0.35
202 0.34
203 0.38
204 0.35
205 0.35
206 0.36
207 0.35
208 0.34
209 0.41
210 0.44
211 0.44
212 0.45
213 0.45
214 0.45
215 0.43
216 0.42
217 0.39
218 0.38
219 0.32
220 0.29
221 0.22
222 0.18
223 0.17
224 0.15
225 0.17
226 0.15
227 0.17
228 0.24
229 0.26
230 0.26
231 0.28
232 0.3
233 0.31
234 0.36
235 0.42
236 0.45
237 0.54
238 0.64
239 0.73
240 0.82
241 0.85
242 0.83
243 0.85
244 0.84
245 0.82
246 0.8
247 0.75
248 0.7
249 0.64
250 0.6
251 0.51
252 0.43