Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VE87

Protein Details
Accession A0A1Y1VE87    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-260SVSSYGHSSKRRKKLNSTSSENMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MSSNLTEQELTTVCFRDPQWLALNPLLIENVIEYFSYSQFYDKTCNNETIKMQSRFNQFDLAEMNKGLHDMTGIEYEVTLSMPPQLFVIAKQNRKSPTSASPIQYYYVINGTIYQAPNAYMLFANRIITSLHLINISFKEAFKSVRFDPDKGYWWSTDEKTDKEMINEIEEIENTNISYINQQESRIYQMRIDDRIAESVSKPIEIEEKVEEEKIKKTKPTALEDKLIVKEKKHSTSSVSSYGHSSKRRKKLNSTSSENMNSLSSKSGSYSSLNSSSISKSIKHETNGNISHHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.25
4 0.26
5 0.28
6 0.32
7 0.34
8 0.38
9 0.36
10 0.38
11 0.29
12 0.28
13 0.24
14 0.17
15 0.14
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.15
28 0.19
29 0.21
30 0.27
31 0.28
32 0.35
33 0.36
34 0.39
35 0.39
36 0.44
37 0.5
38 0.47
39 0.47
40 0.46
41 0.52
42 0.52
43 0.51
44 0.47
45 0.37
46 0.36
47 0.37
48 0.32
49 0.26
50 0.22
51 0.21
52 0.15
53 0.15
54 0.13
55 0.09
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.06
67 0.04
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.2
76 0.24
77 0.3
78 0.33
79 0.38
80 0.41
81 0.43
82 0.43
83 0.38
84 0.38
85 0.39
86 0.42
87 0.39
88 0.39
89 0.38
90 0.37
91 0.34
92 0.27
93 0.2
94 0.16
95 0.13
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.16
131 0.14
132 0.23
133 0.25
134 0.25
135 0.27
136 0.28
137 0.31
138 0.3
139 0.31
140 0.22
141 0.22
142 0.25
143 0.22
144 0.25
145 0.23
146 0.22
147 0.22
148 0.25
149 0.24
150 0.21
151 0.23
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.08
166 0.07
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.19
176 0.23
177 0.26
178 0.27
179 0.27
180 0.23
181 0.2
182 0.21
183 0.21
184 0.17
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.14
192 0.13
193 0.15
194 0.13
195 0.16
196 0.16
197 0.18
198 0.19
199 0.17
200 0.24
201 0.28
202 0.3
203 0.31
204 0.34
205 0.39
206 0.44
207 0.51
208 0.53
209 0.51
210 0.52
211 0.5
212 0.51
213 0.49
214 0.5
215 0.43
216 0.36
217 0.4
218 0.43
219 0.47
220 0.46
221 0.43
222 0.41
223 0.47
224 0.5
225 0.49
226 0.44
227 0.38
228 0.39
229 0.43
230 0.44
231 0.45
232 0.51
233 0.53
234 0.61
235 0.7
236 0.73
237 0.78
238 0.82
239 0.85
240 0.84
241 0.83
242 0.78
243 0.76
244 0.73
245 0.62
246 0.52
247 0.43
248 0.35
249 0.27
250 0.25
251 0.18
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.21
258 0.23
259 0.26
260 0.26
261 0.26
262 0.26
263 0.26
264 0.28
265 0.28
266 0.25
267 0.27
268 0.35
269 0.39
270 0.4
271 0.45
272 0.46
273 0.53
274 0.56