Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V6C2

Protein Details
Accession A0A1Y1V6C2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-26QKTIKILKKSVKKTPLTPKLLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018799  TRAF3IP1  
IPR041476  TRAF3IP1_C  
IPR040468  TRAF3IP1_N  
IPR042576  TRAF3IP1_N_sf  
Gene Ontology GO:0008017  F:microtubule binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10243  MIP-T3  
PF17749  MIP-T3_C  
Amino Acid Sequences MDVVIQKTIKILKKSVKKTPLTPKLLGKPPFRYLHDIISEIIRNTGFAKELYNDEEKQSSNKDKEGKIKYLTKIINVVGILTNQSLKINPLKVVAGMEPDQTNIFLQLLGEVAITKVEESKDIVKRVLNGETMKKAPKTSTSQKKLSDGKLHTSNPKLADSKEKLAKTSKTDSKTKQATAVSSSSKHHSSSSQAAAANQKKLSNTQATSKGAQKSNESLSNYSASTQSLSQQNSSKKLPETSTNINTGSNQNNIDANVAKELHVENDKEDSSNEERKSIKTVTNKIASDNNVTSQNLDDMNINANNGNIAEPVQKVSSNDSNNGNERPRSRSQQNQQKTHTSKSSDTNVGGINENIPEANPDDQIDVAIEQETIVSHIIANSRYRERPASARPPPPKQRHTNIIQESPVKVVTPIVIQETSQQQDEEEENEYLIINQDNQDSNTNKSQLTKNDTKGNDQFGGLVQHILDTKKDLEGESNENVSSTLNKNENESKDMIHAKKDINSLRESIQFLCRNTNPLGKTMDYIQEDFDSMTKELEGWRSESIKYSNMLKTEVEITEETLKPLQEQLKEVEQNIAEELERINSQNATIIRNKEKIDKLLQSIVHPIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.71
3 0.73
4 0.72
5 0.77
6 0.81
7 0.82
8 0.79
9 0.77
10 0.75
11 0.75
12 0.78
13 0.76
14 0.72
15 0.69
16 0.7
17 0.71
18 0.66
19 0.65
20 0.59
21 0.59
22 0.55
23 0.49
24 0.42
25 0.4
26 0.37
27 0.3
28 0.29
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.15
34 0.13
35 0.15
36 0.15
37 0.18
38 0.23
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.3
43 0.28
44 0.3
45 0.35
46 0.39
47 0.38
48 0.43
49 0.48
50 0.51
51 0.6
52 0.63
53 0.62
54 0.61
55 0.65
56 0.62
57 0.64
58 0.6
59 0.53
60 0.5
61 0.44
62 0.39
63 0.31
64 0.29
65 0.21
66 0.19
67 0.18
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.14
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.22
80 0.24
81 0.21
82 0.19
83 0.18
84 0.19
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.12
91 0.11
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.19
108 0.25
109 0.27
110 0.29
111 0.28
112 0.31
113 0.34
114 0.34
115 0.31
116 0.29
117 0.31
118 0.34
119 0.36
120 0.37
121 0.36
122 0.35
123 0.33
124 0.36
125 0.4
126 0.46
127 0.53
128 0.56
129 0.61
130 0.63
131 0.69
132 0.69
133 0.67
134 0.66
135 0.59
136 0.58
137 0.59
138 0.59
139 0.57
140 0.54
141 0.51
142 0.44
143 0.46
144 0.4
145 0.34
146 0.4
147 0.39
148 0.43
149 0.46
150 0.44
151 0.42
152 0.46
153 0.49
154 0.45
155 0.5
156 0.49
157 0.48
158 0.55
159 0.57
160 0.6
161 0.62
162 0.57
163 0.54
164 0.49
165 0.45
166 0.41
167 0.4
168 0.34
169 0.3
170 0.31
171 0.28
172 0.28
173 0.27
174 0.24
175 0.22
176 0.23
177 0.27
178 0.28
179 0.27
180 0.26
181 0.27
182 0.34
183 0.36
184 0.36
185 0.31
186 0.3
187 0.27
188 0.29
189 0.32
190 0.3
191 0.28
192 0.3
193 0.35
194 0.36
195 0.38
196 0.41
197 0.43
198 0.4
199 0.4
200 0.37
201 0.34
202 0.36
203 0.38
204 0.35
205 0.3
206 0.28
207 0.28
208 0.25
209 0.22
210 0.18
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.13
215 0.17
216 0.18
217 0.2
218 0.25
219 0.28
220 0.31
221 0.33
222 0.32
223 0.29
224 0.31
225 0.31
226 0.3
227 0.33
228 0.35
229 0.37
230 0.36
231 0.35
232 0.31
233 0.31
234 0.29
235 0.25
236 0.21
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.11
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.18
259 0.24
260 0.24
261 0.25
262 0.26
263 0.27
264 0.31
265 0.29
266 0.29
267 0.3
268 0.35
269 0.37
270 0.42
271 0.42
272 0.39
273 0.4
274 0.36
275 0.33
276 0.28
277 0.24
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.14
282 0.14
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.13
304 0.18
305 0.18
306 0.2
307 0.22
308 0.24
309 0.26
310 0.29
311 0.27
312 0.24
313 0.25
314 0.29
315 0.3
316 0.34
317 0.37
318 0.43
319 0.5
320 0.58
321 0.65
322 0.66
323 0.66
324 0.69
325 0.68
326 0.63
327 0.58
328 0.51
329 0.46
330 0.43
331 0.44
332 0.37
333 0.33
334 0.3
335 0.27
336 0.24
337 0.22
338 0.17
339 0.12
340 0.1
341 0.1
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.07
366 0.09
367 0.11
368 0.14
369 0.18
370 0.2
371 0.22
372 0.24
373 0.25
374 0.3
375 0.36
376 0.43
377 0.47
378 0.55
379 0.59
380 0.66
381 0.74
382 0.76
383 0.76
384 0.74
385 0.73
386 0.72
387 0.7
388 0.71
389 0.66
390 0.6
391 0.55
392 0.49
393 0.43
394 0.37
395 0.32
396 0.22
397 0.17
398 0.13
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.13
406 0.17
407 0.17
408 0.17
409 0.16
410 0.14
411 0.16
412 0.17
413 0.16
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.06
423 0.08
424 0.1
425 0.11
426 0.13
427 0.18
428 0.19
429 0.23
430 0.27
431 0.28
432 0.26
433 0.29
434 0.33
435 0.34
436 0.41
437 0.45
438 0.44
439 0.51
440 0.52
441 0.54
442 0.53
443 0.52
444 0.44
445 0.37
446 0.33
447 0.26
448 0.27
449 0.2
450 0.16
451 0.11
452 0.11
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.16
462 0.19
463 0.23
464 0.23
465 0.24
466 0.22
467 0.21
468 0.21
469 0.17
470 0.17
471 0.15
472 0.18
473 0.22
474 0.22
475 0.27
476 0.34
477 0.37
478 0.37
479 0.36
480 0.31
481 0.33
482 0.4
483 0.37
484 0.34
485 0.35
486 0.34
487 0.38
488 0.44
489 0.43
490 0.39
491 0.39
492 0.38
493 0.37
494 0.39
495 0.36
496 0.31
497 0.35
498 0.36
499 0.35
500 0.4
501 0.38
502 0.38
503 0.39
504 0.43
505 0.36
506 0.35
507 0.37
508 0.31
509 0.31
510 0.3
511 0.34
512 0.3
513 0.29
514 0.27
515 0.24
516 0.24
517 0.22
518 0.2
519 0.17
520 0.14
521 0.14
522 0.12
523 0.12
524 0.14
525 0.18
526 0.19
527 0.18
528 0.22
529 0.23
530 0.24
531 0.28
532 0.29
533 0.27
534 0.28
535 0.32
536 0.32
537 0.32
538 0.33
539 0.28
540 0.28
541 0.29
542 0.27
543 0.24
544 0.2
545 0.21
546 0.26
547 0.26
548 0.26
549 0.24
550 0.24
551 0.21
552 0.27
553 0.3
554 0.26
555 0.29
556 0.31
557 0.38
558 0.4
559 0.4
560 0.4
561 0.35
562 0.32
563 0.31
564 0.27
565 0.18
566 0.16
567 0.16
568 0.13
569 0.14
570 0.14
571 0.15
572 0.15
573 0.15
574 0.2
575 0.21
576 0.23
577 0.28
578 0.34
579 0.39
580 0.44
581 0.47
582 0.5
583 0.55
584 0.56
585 0.58
586 0.57
587 0.56
588 0.57
589 0.56
590 0.5