Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VGV5

Protein Details
Accession A0A1Y1VGV5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-136AEEYYSGSKKKKKDKKQNETSKKDKGKKKNDDEKQNVDNTHydrophilic
141-167DEEKEVKLSKRQQKKLNAKKKKGGISLHydrophilic
455-475LEKKTEQKEKEKAAREKAKKEBasic
484-516DEKTSTSKNEKKINSKKSGKSRIRRIQYDPEDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-125SKKKKKDKKQNETSKKDKGKKK
149-163SKRQQKKLNAKKKKG
446-508QEKEKPKSILEKKTEQKEKEKAAREKAKKEAAKKDNQIDEKTSTSKNEKKINSKKSGKSRIRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLEEVKKWACEKISSIIGISSEECRPLIDNIWELQTENEIRTEFQNIIGNSVSTNLFINDFVSRRNLNSNSNNNSSVNLDSDVRNNSPYEYYKNDAEEYYSGSKKKKKDKKQNETSKKDKGKKKNDDEKQNVDNTDDTDDEEKEVKLSKRQQKKLNAKKKKGGISLEEWDKEDRSFVTKGKNGRPLCPCQAAKHGLVANCLNCGKIVCKLEGPGPCPFCGEEVLDSDQQVRVYQQKQREKLREEKTILIKSTNNNNKDGSNSSNSKANASSSSSSPLRPSQEQIDQQRSEKLAIKLEVQMEMDKREKAYEKAIMMKERLLDYDKNSTERTKIFDTATDFDPNMTAANNKWLTPEERLAAIKKEQALREYEKNKRKNVRIAIDIKTKQVVELPADPFEYKEDEPITAISESKEQEEEVKSTGYYINPFIKEIPKYVKVNIYDKQKQEKEKPKSILEKKTEQKEKEKAAREKAKKEAAKKDNQIDEKTSTSKNEKKINSKKSGKSRIRRIQYDPEDDDMYGVDFAFSDDEEETEDAGVCSSSDNVLGPSVIVDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.33
4 0.29
5 0.26
6 0.25
7 0.23
8 0.2
9 0.16
10 0.17
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.21
16 0.21
17 0.23
18 0.23
19 0.26
20 0.25
21 0.24
22 0.22
23 0.23
24 0.21
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.19
29 0.2
30 0.23
31 0.18
32 0.19
33 0.25
34 0.22
35 0.24
36 0.23
37 0.22
38 0.19
39 0.2
40 0.17
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.3
54 0.32
55 0.37
56 0.45
57 0.53
58 0.54
59 0.58
60 0.59
61 0.51
62 0.49
63 0.42
64 0.34
65 0.27
66 0.22
67 0.2
68 0.18
69 0.22
70 0.24
71 0.23
72 0.24
73 0.22
74 0.22
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.28
79 0.31
80 0.32
81 0.34
82 0.34
83 0.3
84 0.29
85 0.25
86 0.25
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.34
91 0.41
92 0.46
93 0.56
94 0.62
95 0.67
96 0.75
97 0.83
98 0.87
99 0.92
100 0.95
101 0.95
102 0.94
103 0.91
104 0.9
105 0.89
106 0.87
107 0.86
108 0.85
109 0.85
110 0.87
111 0.9
112 0.9
113 0.89
114 0.9
115 0.89
116 0.85
117 0.8
118 0.74
119 0.63
120 0.54
121 0.46
122 0.36
123 0.31
124 0.23
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.19
133 0.19
134 0.24
135 0.34
136 0.42
137 0.51
138 0.59
139 0.67
140 0.72
141 0.82
142 0.85
143 0.87
144 0.88
145 0.86
146 0.86
147 0.85
148 0.83
149 0.78
150 0.72
151 0.65
152 0.6
153 0.58
154 0.55
155 0.48
156 0.42
157 0.37
158 0.33
159 0.27
160 0.23
161 0.17
162 0.15
163 0.17
164 0.18
165 0.24
166 0.27
167 0.34
168 0.4
169 0.48
170 0.45
171 0.5
172 0.54
173 0.53
174 0.54
175 0.56
176 0.5
177 0.44
178 0.49
179 0.46
180 0.41
181 0.39
182 0.36
183 0.29
184 0.3
185 0.29
186 0.22
187 0.21
188 0.21
189 0.16
190 0.13
191 0.13
192 0.11
193 0.15
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.21
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.24
205 0.23
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.14
220 0.17
221 0.22
222 0.31
223 0.37
224 0.44
225 0.53
226 0.59
227 0.59
228 0.65
229 0.67
230 0.66
231 0.61
232 0.6
233 0.57
234 0.53
235 0.49
236 0.41
237 0.37
238 0.32
239 0.39
240 0.4
241 0.36
242 0.34
243 0.34
244 0.32
245 0.32
246 0.32
247 0.25
248 0.23
249 0.24
250 0.23
251 0.26
252 0.26
253 0.25
254 0.23
255 0.2
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.14
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.21
269 0.26
270 0.31
271 0.34
272 0.39
273 0.36
274 0.36
275 0.37
276 0.34
277 0.3
278 0.3
279 0.27
280 0.23
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.23
285 0.21
286 0.16
287 0.17
288 0.14
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.17
296 0.2
297 0.21
298 0.2
299 0.27
300 0.29
301 0.29
302 0.28
303 0.28
304 0.26
305 0.22
306 0.22
307 0.18
308 0.17
309 0.17
310 0.24
311 0.24
312 0.25
313 0.26
314 0.26
315 0.26
316 0.26
317 0.27
318 0.22
319 0.24
320 0.22
321 0.23
322 0.26
323 0.26
324 0.27
325 0.24
326 0.21
327 0.18
328 0.18
329 0.15
330 0.12
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.2
340 0.22
341 0.24
342 0.18
343 0.19
344 0.21
345 0.21
346 0.22
347 0.21
348 0.2
349 0.22
350 0.25
351 0.24
352 0.25
353 0.29
354 0.31
355 0.38
356 0.43
357 0.49
358 0.54
359 0.59
360 0.65
361 0.69
362 0.71
363 0.72
364 0.73
365 0.69
366 0.68
367 0.67
368 0.65
369 0.65
370 0.59
371 0.52
372 0.45
373 0.39
374 0.31
375 0.29
376 0.25
377 0.19
378 0.23
379 0.23
380 0.22
381 0.23
382 0.23
383 0.2
384 0.2
385 0.2
386 0.15
387 0.16
388 0.16
389 0.15
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.13
394 0.13
395 0.11
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.13
401 0.17
402 0.19
403 0.19
404 0.17
405 0.17
406 0.15
407 0.16
408 0.18
409 0.15
410 0.15
411 0.17
412 0.22
413 0.21
414 0.23
415 0.24
416 0.28
417 0.28
418 0.3
419 0.33
420 0.34
421 0.36
422 0.38
423 0.42
424 0.41
425 0.45
426 0.47
427 0.5
428 0.51
429 0.54
430 0.61
431 0.62
432 0.65
433 0.7
434 0.75
435 0.74
436 0.76
437 0.76
438 0.74
439 0.79
440 0.79
441 0.79
442 0.75
443 0.75
444 0.74
445 0.79
446 0.79
447 0.74
448 0.75
449 0.73
450 0.76
451 0.76
452 0.78
453 0.75
454 0.77
455 0.82
456 0.81
457 0.8
458 0.79
459 0.79
460 0.75
461 0.76
462 0.76
463 0.75
464 0.76
465 0.77
466 0.77
467 0.76
468 0.76
469 0.71
470 0.65
471 0.59
472 0.54
473 0.5
474 0.44
475 0.41
476 0.45
477 0.48
478 0.51
479 0.57
480 0.6
481 0.67
482 0.74
483 0.79
484 0.8
485 0.83
486 0.84
487 0.86
488 0.89
489 0.89
490 0.89
491 0.9
492 0.89
493 0.9
494 0.87
495 0.83
496 0.83
497 0.81
498 0.8
499 0.72
500 0.66
501 0.58
502 0.51
503 0.44
504 0.33
505 0.25
506 0.17
507 0.13
508 0.09
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.1
533 0.09