Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VGB5

Protein Details
Accession A0A1Y1VGB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-111LIQHTSKRDKKTQTTPKPKTVKCGHydrophilic
460-479NNNNSNTNPKKNKNSPNNDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024061  NDT80_DNA-bd_dom  
IPR037141  NDT80_DNA-bd_dom_sf  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05224  NDT80_PhoG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51517  NDT80  
Amino Acid Sequences MDKTKTYTVNIHSKVDSGFFLAEDHWTCYRRNYFHISNSFTATNKESNCQEQIPLPCLIEVDNQPHTVKEFQLGISARITDGGDPIELIQHTSKRDKKTQTTPKPKTVKCGDERCLTILQNHHHSSKEPSDSCLATFDRLQFKLATPNNGRRKRTGAAQQFFVLVIELSVLCNDDQSFKIAFLESSPVIVRGRSPSHFCDNNDTYSYAEIQQQYLSSMQMNYPLLANQNNFASGLSTLSEISATKESALIPNGKNNTKKNNNNNHNGNNANLNNNNNNNFNQNNFNMNNMNNINTNNMNNNSMNNNNMNNNAMNNNMSNNAMNNNMNNNMNNNNMNNNNMNNNNMNNCMNNNNINNNNMGNINSINNTMNNMNNNMNNINNNMGNMNMNNMNNNMNTNNMGNMNGNNMNSINNNNNMGNMNNRNNMNMNNINVNNNMNNNININNMNNNNNMNMNTNNSNNNNSNTNPKKNKNSPNNDDMIQKPPKKMKTINSPGNTFLSVSNSKNNNHYLNSEATLVSSSSSLLSDNNSIVPMNEQDSAATLASLSMSTRDNYMAAEDFNAAATLQRIPSSVSNFDSPNINQSQNQSQNQTANNNNKNNNNNNNNNNSNTNGTNNNIQSLQNIQSQFLFNPTQFSNPELMKLVYGLCERVGKLEDEVKMLKVGEKNF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.37
3 0.31
4 0.22
5 0.19
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.17
10 0.17
11 0.2
12 0.22
13 0.23
14 0.24
15 0.32
16 0.4
17 0.39
18 0.43
19 0.48
20 0.5
21 0.57
22 0.64
23 0.62
24 0.56
25 0.57
26 0.53
27 0.45
28 0.42
29 0.37
30 0.35
31 0.31
32 0.33
33 0.32
34 0.36
35 0.39
36 0.37
37 0.35
38 0.35
39 0.38
40 0.36
41 0.35
42 0.3
43 0.26
44 0.24
45 0.24
46 0.23
47 0.22
48 0.24
49 0.25
50 0.27
51 0.27
52 0.27
53 0.29
54 0.26
55 0.24
56 0.22
57 0.21
58 0.19
59 0.25
60 0.25
61 0.24
62 0.23
63 0.23
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.18
78 0.22
79 0.32
80 0.38
81 0.43
82 0.52
83 0.58
84 0.63
85 0.71
86 0.78
87 0.8
88 0.85
89 0.85
90 0.87
91 0.88
92 0.81
93 0.79
94 0.77
95 0.75
96 0.73
97 0.74
98 0.7
99 0.65
100 0.65
101 0.59
102 0.54
103 0.45
104 0.4
105 0.37
106 0.37
107 0.39
108 0.41
109 0.4
110 0.37
111 0.38
112 0.41
113 0.42
114 0.45
115 0.37
116 0.37
117 0.39
118 0.38
119 0.37
120 0.34
121 0.28
122 0.21
123 0.23
124 0.25
125 0.28
126 0.27
127 0.29
128 0.26
129 0.26
130 0.33
131 0.34
132 0.38
133 0.38
134 0.47
135 0.56
136 0.63
137 0.65
138 0.6
139 0.63
140 0.57
141 0.58
142 0.59
143 0.58
144 0.54
145 0.54
146 0.5
147 0.45
148 0.42
149 0.33
150 0.23
151 0.12
152 0.08
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.14
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.15
179 0.19
180 0.2
181 0.24
182 0.27
183 0.35
184 0.39
185 0.39
186 0.43
187 0.42
188 0.42
189 0.4
190 0.36
191 0.28
192 0.25
193 0.25
194 0.17
195 0.19
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.13
236 0.16
237 0.15
238 0.2
239 0.25
240 0.28
241 0.34
242 0.36
243 0.44
244 0.49
245 0.57
246 0.63
247 0.69
248 0.72
249 0.76
250 0.78
251 0.72
252 0.67
253 0.59
254 0.49
255 0.44
256 0.37
257 0.32
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.28
262 0.29
263 0.25
264 0.25
265 0.25
266 0.24
267 0.23
268 0.23
269 0.21
270 0.24
271 0.22
272 0.23
273 0.22
274 0.21
275 0.24
276 0.2
277 0.2
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.18
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.15
321 0.15
322 0.17
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.16
329 0.17
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.17
338 0.17
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.18
344 0.18
345 0.14
346 0.13
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.16
362 0.15
363 0.15
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.14
381 0.12
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.18
406 0.22
407 0.24
408 0.26
409 0.26
410 0.27
411 0.28
412 0.28
413 0.29
414 0.25
415 0.23
416 0.24
417 0.24
418 0.24
419 0.24
420 0.24
421 0.2
422 0.18
423 0.19
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.17
432 0.18
433 0.2
434 0.2
435 0.2
436 0.2
437 0.2
438 0.2
439 0.18
440 0.16
441 0.18
442 0.19
443 0.2
444 0.24
445 0.25
446 0.29
447 0.29
448 0.3
449 0.29
450 0.28
451 0.36
452 0.38
453 0.46
454 0.5
455 0.54
456 0.62
457 0.69
458 0.78
459 0.79
460 0.82
461 0.79
462 0.77
463 0.73
464 0.65
465 0.59
466 0.51
467 0.48
468 0.47
469 0.44
470 0.43
471 0.47
472 0.5
473 0.53
474 0.57
475 0.58
476 0.6
477 0.67
478 0.71
479 0.68
480 0.65
481 0.61
482 0.56
483 0.48
484 0.38
485 0.28
486 0.25
487 0.23
488 0.23
489 0.28
490 0.29
491 0.31
492 0.34
493 0.38
494 0.36
495 0.34
496 0.34
497 0.3
498 0.29
499 0.29
500 0.26
501 0.21
502 0.17
503 0.16
504 0.14
505 0.11
506 0.09
507 0.08
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.13
526 0.14
527 0.12
528 0.11
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.06
534 0.06
535 0.08
536 0.08
537 0.1
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.1
549 0.08
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.13
557 0.17
558 0.21
559 0.23
560 0.24
561 0.26
562 0.26
563 0.27
564 0.29
565 0.26
566 0.28
567 0.28
568 0.28
569 0.27
570 0.31
571 0.4
572 0.44
573 0.47
574 0.45
575 0.45
576 0.48
577 0.5
578 0.51
579 0.5
580 0.52
581 0.56
582 0.6
583 0.62
584 0.64
585 0.69
586 0.71
587 0.73
588 0.72
589 0.73
590 0.73
591 0.75
592 0.72
593 0.68
594 0.61
595 0.54
596 0.48
597 0.42
598 0.38
599 0.33
600 0.31
601 0.35
602 0.33
603 0.33
604 0.3
605 0.28
606 0.26
607 0.27
608 0.28
609 0.27
610 0.26
611 0.25
612 0.25
613 0.27
614 0.26
615 0.26
616 0.25
617 0.2
618 0.24
619 0.24
620 0.26
621 0.25
622 0.27
623 0.28
624 0.25
625 0.28
626 0.26
627 0.26
628 0.21
629 0.21
630 0.19
631 0.18
632 0.19
633 0.17
634 0.16
635 0.19
636 0.19
637 0.22
638 0.23
639 0.2
640 0.23
641 0.28
642 0.27
643 0.29
644 0.3
645 0.28
646 0.28
647 0.27
648 0.28