Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VA64

Protein Details
Accession A0A1Y1VA64    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-332LLKTGRLTKKEKQRIKREKIRQRQKQSRSNNSITKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-325RLTKKEKQRIKREKIRQRQKQSRS
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS51939  XRRM  
Amino Acid Sequences MEVEFESVPLRILELFKFYLSDQEIKSVLSSCPKTEWTLNGWLPVETLFSFKRVKAITEDKNAILNILVNQGNDFVEFTNDYQYLRRKSPFSPANIPQKKPLNCSLEVSGFTDSISPIEIQTIFSKYGGVENISFGTKEGTYIVDFYEVNPIINTLVTPITYEDQRIYVRTIRKPDVEIVKSKLPKAYPLNKVAQFGPVEENVQREFIKQAFEQYAQVSFVDFDYGNKFGYVKFKQSVAKELVNIVFRNGGITVRGMEEKLDFHPLEGDEEYVYWQLEKIKKEKNLYSQERTINPLLLKTGRLTKKEKQRIKREKIRQRQKQSRSNNSITKGDKSKLKSSILSSKLFDNSSSRTGIKDSFKRKIRMESIDEMFKSLTVVKKDGNEMKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.17
4 0.19
5 0.18
6 0.23
7 0.24
8 0.28
9 0.25
10 0.27
11 0.28
12 0.26
13 0.28
14 0.23
15 0.22
16 0.25
17 0.27
18 0.25
19 0.28
20 0.3
21 0.33
22 0.34
23 0.36
24 0.32
25 0.39
26 0.38
27 0.39
28 0.37
29 0.33
30 0.3
31 0.26
32 0.24
33 0.15
34 0.18
35 0.14
36 0.17
37 0.19
38 0.19
39 0.25
40 0.24
41 0.26
42 0.3
43 0.39
44 0.43
45 0.48
46 0.51
47 0.46
48 0.48
49 0.45
50 0.38
51 0.29
52 0.22
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.19
70 0.26
71 0.29
72 0.33
73 0.37
74 0.36
75 0.37
76 0.47
77 0.49
78 0.48
79 0.52
80 0.54
81 0.61
82 0.65
83 0.65
84 0.62
85 0.65
86 0.62
87 0.58
88 0.59
89 0.53
90 0.47
91 0.49
92 0.45
93 0.38
94 0.36
95 0.33
96 0.26
97 0.2
98 0.18
99 0.15
100 0.12
101 0.09
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.11
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.09
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.17
156 0.23
157 0.27
158 0.32
159 0.33
160 0.34
161 0.34
162 0.37
163 0.4
164 0.36
165 0.35
166 0.33
167 0.36
168 0.36
169 0.35
170 0.33
171 0.26
172 0.29
173 0.34
174 0.39
175 0.38
176 0.41
177 0.47
178 0.45
179 0.47
180 0.41
181 0.36
182 0.28
183 0.23
184 0.2
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.11
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.13
196 0.12
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.17
218 0.18
219 0.21
220 0.21
221 0.25
222 0.29
223 0.3
224 0.35
225 0.32
226 0.31
227 0.27
228 0.28
229 0.28
230 0.26
231 0.25
232 0.19
233 0.16
234 0.14
235 0.14
236 0.12
237 0.09
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.16
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.16
255 0.15
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.08
263 0.13
264 0.18
265 0.22
266 0.27
267 0.34
268 0.41
269 0.47
270 0.52
271 0.56
272 0.62
273 0.66
274 0.66
275 0.65
276 0.65
277 0.6
278 0.59
279 0.51
280 0.44
281 0.37
282 0.31
283 0.28
284 0.23
285 0.23
286 0.2
287 0.28
288 0.3
289 0.35
290 0.4
291 0.45
292 0.55
293 0.65
294 0.72
295 0.73
296 0.79
297 0.84
298 0.89
299 0.91
300 0.91
301 0.91
302 0.93
303 0.94
304 0.93
305 0.93
306 0.93
307 0.93
308 0.92
309 0.91
310 0.91
311 0.89
312 0.87
313 0.83
314 0.77
315 0.74
316 0.67
317 0.64
318 0.59
319 0.55
320 0.53
321 0.52
322 0.55
323 0.54
324 0.55
325 0.52
326 0.52
327 0.57
328 0.56
329 0.53
330 0.47
331 0.45
332 0.44
333 0.41
334 0.36
335 0.31
336 0.3
337 0.3
338 0.32
339 0.28
340 0.26
341 0.28
342 0.33
343 0.37
344 0.42
345 0.47
346 0.53
347 0.61
348 0.67
349 0.69
350 0.73
351 0.72
352 0.71
353 0.69
354 0.67
355 0.64
356 0.65
357 0.6
358 0.51
359 0.43
360 0.35
361 0.29
362 0.26
363 0.26
364 0.23
365 0.26
366 0.28
367 0.32
368 0.4