Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VAM2

Protein Details
Accession A0A1Y1VAM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-39EISEKSRDPKKYMKKRTSESKRKELVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-35RDPKKYMKKRTSESKRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010736  SHIPPO-rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF07004  SHIPPO-rpt  
Amino Acid Sequences MADNTQNDASKSEISEKSRDPKKYMKKRTSESKRKELVIEPPKDYPIQAKIKGPGPAAYSLPTTLGRKSYKLRAPAYSFGMYFDPNNKIVSPSPNKFFPSVCRTGQYNSPSYSLRIKTKGLKNDTISFPGPGTYDQDCNNIYKKNPSYSIKSRNKPLKNDPNPGPAQYSQSSNNKCTPSWSINPKRELKSTTISPGPAAYSTTNYNVYLKESPSYSLKERFQSTEYISVEESMKNQKRVSPIKPRKVVFPSPNSYSVKMKYVTNSSPKFSFRNKHSEYELYVDDNVPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.38
3 0.42
4 0.5
5 0.56
6 0.59
7 0.57
8 0.61
9 0.68
10 0.74
11 0.79
12 0.79
13 0.81
14 0.84
15 0.9
16 0.91
17 0.9
18 0.88
19 0.88
20 0.84
21 0.77
22 0.73
23 0.66
24 0.65
25 0.64
26 0.61
27 0.53
28 0.5
29 0.49
30 0.45
31 0.41
32 0.35
33 0.34
34 0.36
35 0.36
36 0.38
37 0.4
38 0.45
39 0.48
40 0.45
41 0.39
42 0.34
43 0.33
44 0.29
45 0.27
46 0.23
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.17
52 0.23
53 0.23
54 0.26
55 0.31
56 0.38
57 0.41
58 0.47
59 0.49
60 0.5
61 0.53
62 0.53
63 0.53
64 0.46
65 0.4
66 0.34
67 0.31
68 0.25
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.27
78 0.31
79 0.32
80 0.34
81 0.37
82 0.38
83 0.37
84 0.36
85 0.34
86 0.34
87 0.35
88 0.33
89 0.32
90 0.32
91 0.33
92 0.38
93 0.35
94 0.31
95 0.28
96 0.29
97 0.27
98 0.27
99 0.31
100 0.29
101 0.29
102 0.28
103 0.3
104 0.36
105 0.42
106 0.48
107 0.47
108 0.49
109 0.48
110 0.5
111 0.49
112 0.44
113 0.38
114 0.3
115 0.25
116 0.2
117 0.17
118 0.12
119 0.14
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.17
128 0.17
129 0.22
130 0.24
131 0.24
132 0.3
133 0.31
134 0.36
135 0.42
136 0.52
137 0.54
138 0.56
139 0.61
140 0.65
141 0.68
142 0.67
143 0.69
144 0.69
145 0.68
146 0.71
147 0.66
148 0.64
149 0.6
150 0.54
151 0.47
152 0.37
153 0.34
154 0.27
155 0.27
156 0.24
157 0.31
158 0.33
159 0.33
160 0.37
161 0.35
162 0.33
163 0.34
164 0.34
165 0.32
166 0.36
167 0.43
168 0.47
169 0.52
170 0.59
171 0.63
172 0.61
173 0.59
174 0.56
175 0.49
176 0.45
177 0.42
178 0.39
179 0.34
180 0.31
181 0.27
182 0.25
183 0.21
184 0.16
185 0.16
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.17
199 0.19
200 0.21
201 0.24
202 0.25
203 0.29
204 0.32
205 0.36
206 0.38
207 0.39
208 0.37
209 0.37
210 0.36
211 0.37
212 0.34
213 0.3
214 0.27
215 0.26
216 0.25
217 0.22
218 0.21
219 0.24
220 0.29
221 0.31
222 0.32
223 0.34
224 0.42
225 0.49
226 0.55
227 0.56
228 0.62
229 0.68
230 0.76
231 0.73
232 0.73
233 0.73
234 0.74
235 0.71
236 0.69
237 0.65
238 0.62
239 0.68
240 0.63
241 0.58
242 0.54
243 0.48
244 0.45
245 0.4
246 0.38
247 0.36
248 0.4
249 0.44
250 0.48
251 0.49
252 0.48
253 0.51
254 0.52
255 0.53
256 0.54
257 0.56
258 0.53
259 0.6
260 0.6
261 0.61
262 0.63
263 0.62
264 0.57
265 0.53
266 0.48
267 0.4
268 0.37