Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V0C1

Protein Details
Accession A0A1Y1V0C1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
517-541EDLGNKKRLVPKFVRKKRNIVSIKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
527-533PKFVRKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006638  Elp3/MiaA/NifB-like_rSAM  
IPR005839  Methylthiotransferase  
IPR020612  Methylthiotransferase_CS  
IPR013848  Methylthiotransferase_N  
IPR038135  Methylthiotransferase_N_sf  
IPR006466  MiaB-like_B  
IPR007197  rSAM  
IPR023404  rSAM_horseshoe  
IPR002792  TRAM_dom  
Gene Ontology GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035598  F:N6-threonylcarbomyladenosine methylthiotransferase activity  
GO:0061712  F:tRNA (N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))-methylthiotransferase  
Pfam View protein in Pfam  
PF04055  Radical_SAM  
PF01938  TRAM  
PF00919  UPF0004  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51449  MTTASE_N  
PS01278  MTTASE_RADICAL  
PS51918  RADICAL_SAM  
PS50926  TRAM  
CDD cd01335  Radical_SAM  
Amino Acid Sequences MDIGLVENVDIEDLHVEEGINKREEENGTVEINPVILNNAQNDNEKASDNKYPTQHFLPGNATIYVRSWGCSHNNSDSEYMAGLLRERGYKIIFESAKKYEADLWLLNSCTVKNPSEQTFVNEIENAKKHNILVVLAGCVPQASQKDKRWKPYSVIGVQQIDRVVEVVEETLKGNTIRYMRERKRLRQKLGGANLELPKIRKNPLIEIIPISTGCLNECTYCKTKAARGALGSYPIEMIVERVKSILKQGVVEIWITSEDVGAYGIDIGVTIVDLLWEVVKAIEENHPYAKLRVGMTNPPYILEHVEEMAKILSHPRVYAFIHIPVQSGSDSVLDVMKRKYTINEFKKVVYALRDGTKEIGGVTIATDIICGFPSETEEDFEKTMDLMRECRFPITHISQFYPRPGTPAAKMTRVPTGIVKNRSRKITTFFESYETYGEEIIGTEQEILVTEVNSGSGDLYVGHNRYYNQVLVPRQKGLLGKMCRVKITKKGKYFLMGEVLEVLKYEGFENEEVIEEDLGNKKRLVPKFVRKKRNIVSIKNLEGDENTNSEESTHISLEESLNNFHFPRTNVGDVCCGGNGETCDCHKNNNNVTTCDQNTNRVLLNLEDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.11
5 0.17
6 0.21
7 0.22
8 0.22
9 0.23
10 0.28
11 0.3
12 0.29
13 0.28
14 0.26
15 0.26
16 0.26
17 0.26
18 0.2
19 0.19
20 0.16
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.15
26 0.19
27 0.2
28 0.24
29 0.25
30 0.27
31 0.26
32 0.26
33 0.25
34 0.26
35 0.31
36 0.32
37 0.37
38 0.39
39 0.42
40 0.46
41 0.48
42 0.51
43 0.45
44 0.44
45 0.42
46 0.4
47 0.38
48 0.34
49 0.3
50 0.24
51 0.24
52 0.23
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.19
57 0.24
58 0.28
59 0.32
60 0.36
61 0.38
62 0.39
63 0.39
64 0.34
65 0.3
66 0.26
67 0.21
68 0.14
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.26
80 0.27
81 0.28
82 0.32
83 0.33
84 0.35
85 0.34
86 0.33
87 0.29
88 0.28
89 0.29
90 0.26
91 0.25
92 0.24
93 0.25
94 0.25
95 0.21
96 0.19
97 0.2
98 0.22
99 0.2
100 0.21
101 0.26
102 0.28
103 0.33
104 0.33
105 0.33
106 0.35
107 0.34
108 0.32
109 0.29
110 0.26
111 0.28
112 0.29
113 0.27
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.23
118 0.23
119 0.17
120 0.18
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.13
130 0.18
131 0.25
132 0.34
133 0.45
134 0.51
135 0.61
136 0.64
137 0.64
138 0.63
139 0.63
140 0.64
141 0.57
142 0.57
143 0.52
144 0.5
145 0.46
146 0.43
147 0.35
148 0.26
149 0.21
150 0.16
151 0.11
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.12
163 0.14
164 0.17
165 0.24
166 0.35
167 0.4
168 0.5
169 0.58
170 0.64
171 0.73
172 0.79
173 0.78
174 0.77
175 0.79
176 0.78
177 0.78
178 0.72
179 0.62
180 0.57
181 0.52
182 0.44
183 0.38
184 0.29
185 0.26
186 0.25
187 0.26
188 0.25
189 0.26
190 0.29
191 0.33
192 0.35
193 0.31
194 0.3
195 0.28
196 0.25
197 0.22
198 0.18
199 0.13
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.15
207 0.18
208 0.19
209 0.22
210 0.22
211 0.25
212 0.31
213 0.34
214 0.32
215 0.3
216 0.32
217 0.3
218 0.31
219 0.27
220 0.2
221 0.16
222 0.13
223 0.11
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.12
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.11
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.05
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.2
283 0.22
284 0.24
285 0.22
286 0.2
287 0.2
288 0.18
289 0.16
290 0.12
291 0.1
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.11
305 0.12
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.17
310 0.17
311 0.17
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.06
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.14
328 0.21
329 0.31
330 0.36
331 0.42
332 0.42
333 0.42
334 0.43
335 0.41
336 0.34
337 0.26
338 0.22
339 0.17
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.19
344 0.17
345 0.15
346 0.13
347 0.1
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.06
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.09
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.14
375 0.15
376 0.18
377 0.18
378 0.2
379 0.18
380 0.17
381 0.23
382 0.26
383 0.29
384 0.28
385 0.3
386 0.33
387 0.35
388 0.36
389 0.34
390 0.28
391 0.27
392 0.27
393 0.27
394 0.25
395 0.31
396 0.31
397 0.3
398 0.32
399 0.3
400 0.32
401 0.3
402 0.29
403 0.26
404 0.31
405 0.35
406 0.42
407 0.48
408 0.52
409 0.56
410 0.61
411 0.59
412 0.53
413 0.52
414 0.52
415 0.49
416 0.45
417 0.4
418 0.38
419 0.36
420 0.34
421 0.29
422 0.22
423 0.18
424 0.13
425 0.12
426 0.09
427 0.08
428 0.07
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.05
447 0.07
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.15
453 0.18
454 0.2
455 0.19
456 0.18
457 0.23
458 0.29
459 0.36
460 0.38
461 0.37
462 0.34
463 0.36
464 0.36
465 0.35
466 0.37
467 0.34
468 0.38
469 0.43
470 0.44
471 0.46
472 0.47
473 0.47
474 0.48
475 0.55
476 0.57
477 0.58
478 0.6
479 0.59
480 0.61
481 0.59
482 0.52
483 0.48
484 0.39
485 0.31
486 0.29
487 0.27
488 0.21
489 0.18
490 0.15
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.07
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.09
504 0.11
505 0.17
506 0.19
507 0.2
508 0.2
509 0.24
510 0.32
511 0.37
512 0.44
513 0.47
514 0.55
515 0.65
516 0.75
517 0.81
518 0.79
519 0.84
520 0.84
521 0.85
522 0.83
523 0.79
524 0.79
525 0.77
526 0.75
527 0.69
528 0.61
529 0.51
530 0.44
531 0.39
532 0.3
533 0.24
534 0.21
535 0.17
536 0.17
537 0.16
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.12
543 0.13
544 0.15
545 0.16
546 0.2
547 0.2
548 0.19
549 0.2
550 0.22
551 0.22
552 0.22
553 0.24
554 0.21
555 0.27
556 0.3
557 0.34
558 0.34
559 0.35
560 0.38
561 0.35
562 0.34
563 0.27
564 0.22
565 0.17
566 0.18
567 0.18
568 0.17
569 0.19
570 0.2
571 0.27
572 0.27
573 0.34
574 0.39
575 0.47
576 0.53
577 0.6
578 0.61
579 0.59
580 0.62
581 0.63
582 0.58
583 0.57
584 0.5
585 0.48
586 0.46
587 0.45
588 0.43
589 0.36
590 0.34
591 0.27