Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UPI6

Protein Details
Accession A0A1Y1UPI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-169GISAPLKYVRKRRFRKRMSKRVIEDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-164RKRRFRKRMSKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MATKKLKARIAAENDINRKIPVKRILLKRGNADNQDKDDDENNIHYEEQFLLRMPEGDANDRLRQAIQEREVPEEFKITFSDSRHATIHWENENYNAKLVDLPCIIESQKTLDRKQFYKIADISQILIATKEKDLDIDYSYPHGISAPLKYVRKRRFRKRMSKRVIEDVEREVERLLQDDANAEDVTYDFGLNMPDKIQEESDIGTPGPTSEGEEEMEGEVEGDADMDMDNLDLDEESLAADIEQQLDQNDDNEDEDSEEEASGDDEGDGDGDEGDEDGEGDEEGDEGDEEEDDQEESLQQKRELIQEEIDELEAKIEEKNEQIKSVVGNQIMKKRFVDQLHALEKELEEKQNEMNQIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.61
3 0.57
4 0.49
5 0.46
6 0.41
7 0.42
8 0.42
9 0.46
10 0.52
11 0.6
12 0.7
13 0.73
14 0.75
15 0.75
16 0.76
17 0.74
18 0.73
19 0.71
20 0.66
21 0.62
22 0.61
23 0.54
24 0.47
25 0.41
26 0.37
27 0.32
28 0.29
29 0.26
30 0.23
31 0.22
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.16
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.17
43 0.17
44 0.2
45 0.23
46 0.26
47 0.29
48 0.28
49 0.28
50 0.24
51 0.25
52 0.25
53 0.28
54 0.27
55 0.31
56 0.32
57 0.36
58 0.37
59 0.35
60 0.32
61 0.27
62 0.24
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.2
67 0.2
68 0.25
69 0.23
70 0.26
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.27
75 0.31
76 0.3
77 0.31
78 0.28
79 0.34
80 0.4
81 0.36
82 0.33
83 0.27
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.21
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.19
97 0.22
98 0.25
99 0.29
100 0.34
101 0.36
102 0.4
103 0.41
104 0.37
105 0.4
106 0.39
107 0.35
108 0.33
109 0.32
110 0.28
111 0.23
112 0.22
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.13
135 0.18
136 0.21
137 0.26
138 0.35
139 0.43
140 0.53
141 0.61
142 0.68
143 0.74
144 0.81
145 0.88
146 0.89
147 0.92
148 0.9
149 0.9
150 0.82
151 0.8
152 0.73
153 0.65
154 0.56
155 0.47
156 0.41
157 0.32
158 0.28
159 0.19
160 0.16
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.04
177 0.04
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.09
285 0.14
286 0.17
287 0.17
288 0.19
289 0.22
290 0.27
291 0.3
292 0.31
293 0.28
294 0.26
295 0.27
296 0.26
297 0.24
298 0.19
299 0.14
300 0.13
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.15
307 0.22
308 0.23
309 0.24
310 0.24
311 0.24
312 0.26
313 0.3
314 0.31
315 0.28
316 0.33
317 0.36
318 0.45
319 0.47
320 0.47
321 0.42
322 0.41
323 0.45
324 0.42
325 0.45
326 0.43
327 0.49
328 0.53
329 0.53
330 0.49
331 0.44
332 0.41
333 0.38
334 0.35
335 0.3
336 0.25
337 0.25
338 0.3
339 0.33