Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V9J0

Protein Details
Accession A0A1Y1V9J0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-178LINYNDCKHNIKKKKRKDKTNEDEEAEKHydrophilic
189-209FSNNKNKKESRSRFNRINFIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-168KKKKRKD
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 9, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001646  5peptide_repeat  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13599  Pentapeptide_4  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MTPIRTLKKRNSSFPLLDKITPSIVINLYANYFTFNNKTFIENLNEHTIPSSLLDVLDKQKCKFYNGNIAVEVRNHCLNDQTELTSAEITRIWLHMTPENLWMDLCLLNERFGHPQWTQDASLEIESKILTSIEKDLCLEPKIEVSKIKNLINYNDCKHNIKKKKRKDKTNEDEEAEKKAQQQQLLLLFSNNKNKKESRSRFNRINFIEEWRKKKVMADSEPLICISSSNKKPNTKVSPTSRTLLHNLNRVVRTLRFENTTRGIKTYTVLNIYELSNGENEAVLRWGTIPNTSINGGLLKYPIGNNAAAEYYIANFIYFYSLTNKLVSDDIDKDKENSYSVIYQPDPTNENGIHSIPTSMLSTIQVKSSINLNSPQTLYSNISSVSNSSSYQYSPHVAKKAKTQSNSKLNSSKSGQTVAPLPNAVNPITFSPVNNPVQTPPNPATSLQQKLQQSQLQKTPLQQTPLQPTQLQSTPLQPTQLQQTQLQLTQLQPTQLQQAQLQQVQLQQAQLQQAQLQQAQLQPTQLQPTQLQQTQLQQTQLLQKNQLQQVQLQQQIQQSQLHLAQLQKPQPHLNQSQVIQLQFQLTHQIQLQKVQLKKLQESEQQQILQQRYQQLQKENAAQTVKTAMEAKAQVPVQGTQTIQNAQVQQLQLQNQSTPPLKATPTIQNKSLSTSATAQVKTNITPSIPTKPINASTTTISTPQITQQSPVNKVTQKIPTAATTVANGIAVTQSTPLMKTPSLPAQPITQQQTQQTTPLLSSQNRVKTTPNIPYKSSPPLNLHQPNTATATAAMNKYYPEGFNANAAAAQAKIISGSPPSMVNNQLKMANMGFMQHQNAGIPTSLLTHQQQLLIQQQLALQQQQNAVPIQLLQGTRGIPQQYAEASLEAYNLQTQKTALEQVRRQQYAAASGIPYPTMTFPPQLNNPNLMGAHTNVQQIYQQLTQSRQAALQHQMDLKNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.73
3 0.67
4 0.62
5 0.55
6 0.5
7 0.42
8 0.37
9 0.3
10 0.25
11 0.22
12 0.22
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.18
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.21
22 0.22
23 0.24
24 0.24
25 0.27
26 0.27
27 0.31
28 0.34
29 0.32
30 0.34
31 0.38
32 0.37
33 0.35
34 0.33
35 0.29
36 0.22
37 0.2
38 0.18
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.14
43 0.22
44 0.29
45 0.32
46 0.32
47 0.39
48 0.4
49 0.45
50 0.48
51 0.48
52 0.51
53 0.53
54 0.56
55 0.52
56 0.52
57 0.47
58 0.45
59 0.4
60 0.33
61 0.3
62 0.27
63 0.24
64 0.28
65 0.27
66 0.28
67 0.28
68 0.26
69 0.24
70 0.25
71 0.26
72 0.22
73 0.2
74 0.17
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.27
86 0.28
87 0.26
88 0.23
89 0.2
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.16
96 0.17
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.27
101 0.23
102 0.27
103 0.29
104 0.32
105 0.31
106 0.27
107 0.27
108 0.24
109 0.26
110 0.23
111 0.18
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.1
117 0.08
118 0.08
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.19
123 0.2
124 0.23
125 0.24
126 0.23
127 0.17
128 0.22
129 0.24
130 0.24
131 0.27
132 0.28
133 0.36
134 0.4
135 0.42
136 0.41
137 0.41
138 0.46
139 0.48
140 0.51
141 0.46
142 0.49
143 0.5
144 0.51
145 0.56
146 0.6
147 0.63
148 0.68
149 0.75
150 0.78
151 0.86
152 0.91
153 0.94
154 0.94
155 0.94
156 0.94
157 0.94
158 0.89
159 0.81
160 0.78
161 0.68
162 0.64
163 0.54
164 0.45
165 0.38
166 0.38
167 0.38
168 0.33
169 0.33
170 0.31
171 0.34
172 0.35
173 0.31
174 0.26
175 0.28
176 0.31
177 0.4
178 0.41
179 0.38
180 0.41
181 0.44
182 0.52
183 0.58
184 0.62
185 0.63
186 0.68
187 0.74
188 0.78
189 0.81
190 0.8
191 0.71
192 0.68
193 0.59
194 0.56
195 0.59
196 0.57
197 0.56
198 0.53
199 0.52
200 0.47
201 0.5
202 0.5
203 0.49
204 0.49
205 0.49
206 0.47
207 0.47
208 0.47
209 0.42
210 0.34
211 0.24
212 0.18
213 0.16
214 0.21
215 0.27
216 0.35
217 0.42
218 0.47
219 0.51
220 0.6
221 0.66
222 0.64
223 0.66
224 0.67
225 0.68
226 0.66
227 0.65
228 0.58
229 0.52
230 0.49
231 0.48
232 0.43
233 0.42
234 0.42
235 0.45
236 0.43
237 0.41
238 0.4
239 0.34
240 0.35
241 0.31
242 0.31
243 0.29
244 0.3
245 0.33
246 0.36
247 0.39
248 0.35
249 0.33
250 0.32
251 0.28
252 0.27
253 0.26
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.19
261 0.15
262 0.13
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.16
317 0.19
318 0.21
319 0.21
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.2
324 0.16
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.18
329 0.17
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.18
335 0.2
336 0.16
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.14
341 0.13
342 0.12
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.11
354 0.12
355 0.15
356 0.16
357 0.15
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.19
362 0.19
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.16
382 0.19
383 0.25
384 0.27
385 0.28
386 0.36
387 0.44
388 0.47
389 0.49
390 0.52
391 0.55
392 0.62
393 0.64
394 0.59
395 0.55
396 0.5
397 0.5
398 0.46
399 0.41
400 0.32
401 0.31
402 0.27
403 0.22
404 0.26
405 0.23
406 0.2
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.17
411 0.16
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.12
416 0.12
417 0.1
418 0.12
419 0.18
420 0.2
421 0.2
422 0.2
423 0.19
424 0.24
425 0.25
426 0.26
427 0.22
428 0.23
429 0.24
430 0.24
431 0.25
432 0.25
433 0.28
434 0.24
435 0.28
436 0.26
437 0.27
438 0.31
439 0.31
440 0.29
441 0.29
442 0.32
443 0.31
444 0.31
445 0.33
446 0.35
447 0.34
448 0.34
449 0.32
450 0.31
451 0.35
452 0.36
453 0.34
454 0.28
455 0.27
456 0.27
457 0.26
458 0.24
459 0.18
460 0.19
461 0.21
462 0.21
463 0.21
464 0.18
465 0.17
466 0.21
467 0.23
468 0.21
469 0.19
470 0.21
471 0.21
472 0.21
473 0.21
474 0.16
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.14
485 0.17
486 0.19
487 0.2
488 0.2
489 0.17
490 0.17
491 0.18
492 0.17
493 0.14
494 0.12
495 0.12
496 0.14
497 0.13
498 0.12
499 0.11
500 0.12
501 0.14
502 0.14
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.15
507 0.14
508 0.13
509 0.12
510 0.12
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.17
516 0.2
517 0.21
518 0.22
519 0.2
520 0.25
521 0.27
522 0.28
523 0.25
524 0.21
525 0.21
526 0.28
527 0.33
528 0.29
529 0.27
530 0.28
531 0.35
532 0.38
533 0.39
534 0.3
535 0.26
536 0.31
537 0.34
538 0.35
539 0.29
540 0.29
541 0.28
542 0.29
543 0.29
544 0.24
545 0.18
546 0.17
547 0.17
548 0.15
549 0.14
550 0.14
551 0.18
552 0.22
553 0.26
554 0.26
555 0.27
556 0.3
557 0.31
558 0.36
559 0.33
560 0.32
561 0.32
562 0.31
563 0.34
564 0.32
565 0.3
566 0.24
567 0.22
568 0.18
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.12
573 0.13
574 0.15
575 0.19
576 0.18
577 0.22
578 0.26
579 0.26
580 0.28
581 0.31
582 0.32
583 0.31
584 0.34
585 0.35
586 0.37
587 0.37
588 0.4
589 0.4
590 0.42
591 0.39
592 0.38
593 0.39
594 0.35
595 0.3
596 0.28
597 0.28
598 0.28
599 0.33
600 0.35
601 0.34
602 0.37
603 0.38
604 0.43
605 0.39
606 0.4
607 0.36
608 0.31
609 0.27
610 0.25
611 0.21
612 0.15
613 0.16
614 0.12
615 0.15
616 0.16
617 0.16
618 0.18
619 0.18
620 0.18
621 0.18
622 0.19
623 0.17
624 0.17
625 0.18
626 0.15
627 0.17
628 0.17
629 0.17
630 0.18
631 0.17
632 0.17
633 0.2
634 0.17
635 0.18
636 0.2
637 0.21
638 0.21
639 0.2
640 0.2
641 0.17
642 0.21
643 0.21
644 0.18
645 0.18
646 0.17
647 0.17
648 0.19
649 0.22
650 0.27
651 0.35
652 0.37
653 0.39
654 0.4
655 0.4
656 0.42
657 0.4
658 0.31
659 0.24
660 0.24
661 0.24
662 0.26
663 0.26
664 0.23
665 0.25
666 0.25
667 0.23
668 0.23
669 0.2
670 0.15
671 0.17
672 0.19
673 0.23
674 0.24
675 0.25
676 0.25
677 0.28
678 0.32
679 0.31
680 0.31
681 0.26
682 0.25
683 0.27
684 0.25
685 0.23
686 0.2
687 0.19
688 0.17
689 0.19
690 0.23
691 0.2
692 0.21
693 0.25
694 0.3
695 0.33
696 0.35
697 0.36
698 0.33
699 0.35
700 0.39
701 0.41
702 0.37
703 0.35
704 0.34
705 0.3
706 0.3
707 0.29
708 0.23
709 0.18
710 0.16
711 0.14
712 0.12
713 0.1
714 0.08
715 0.07
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.11
724 0.11
725 0.13
726 0.17
727 0.24
728 0.26
729 0.26
730 0.26
731 0.27
732 0.32
733 0.36
734 0.38
735 0.34
736 0.34
737 0.37
738 0.41
739 0.38
740 0.36
741 0.32
742 0.26
743 0.23
744 0.25
745 0.26
746 0.22
747 0.26
748 0.31
749 0.37
750 0.38
751 0.39
752 0.38
753 0.4
754 0.46
755 0.51
756 0.53
757 0.49
758 0.5
759 0.53
760 0.54
761 0.56
762 0.53
763 0.49
764 0.44
765 0.46
766 0.53
767 0.56
768 0.54
769 0.5
770 0.48
771 0.45
772 0.43
773 0.38
774 0.28
775 0.22
776 0.22
777 0.21
778 0.2
779 0.19
780 0.15
781 0.15
782 0.16
783 0.17
784 0.15
785 0.15
786 0.16
787 0.16
788 0.18
789 0.18
790 0.16
791 0.15
792 0.14
793 0.12
794 0.09
795 0.09
796 0.06
797 0.06
798 0.06
799 0.06
800 0.07
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.11
805 0.14
806 0.16
807 0.23
808 0.26
809 0.27
810 0.29
811 0.29
812 0.28
813 0.28
814 0.25
815 0.21
816 0.16
817 0.15
818 0.16
819 0.17
820 0.18
821 0.17
822 0.17
823 0.16
824 0.16
825 0.16
826 0.13
827 0.11
828 0.09
829 0.11
830 0.12
831 0.15
832 0.16
833 0.18
834 0.19
835 0.21
836 0.22
837 0.23
838 0.28
839 0.27
840 0.25
841 0.22
842 0.22
843 0.25
844 0.26
845 0.27
846 0.23
847 0.23
848 0.26
849 0.27
850 0.28
851 0.24
852 0.22
853 0.18
854 0.16
855 0.15
856 0.16
857 0.15
858 0.13
859 0.15
860 0.16
861 0.17
862 0.22
863 0.22
864 0.18
865 0.18
866 0.21
867 0.19
868 0.21
869 0.21
870 0.16
871 0.16
872 0.16
873 0.16
874 0.13
875 0.13
876 0.14
877 0.14
878 0.14
879 0.13
880 0.13
881 0.14
882 0.17
883 0.24
884 0.25
885 0.33
886 0.38
887 0.46
888 0.55
889 0.55
890 0.53
891 0.49
892 0.46
893 0.43
894 0.39
895 0.33
896 0.24
897 0.24
898 0.24
899 0.21
900 0.19
901 0.15
902 0.15
903 0.16
904 0.18
905 0.2
906 0.21
907 0.28
908 0.35
909 0.41
910 0.43
911 0.42
912 0.41
913 0.41
914 0.39
915 0.34
916 0.29
917 0.23
918 0.24
919 0.23
920 0.26
921 0.22
922 0.23
923 0.23
924 0.23
925 0.25
926 0.24
927 0.25
928 0.25
929 0.29
930 0.34
931 0.35
932 0.35
933 0.33
934 0.34
935 0.36
936 0.4
937 0.4
938 0.39
939 0.42
940 0.46
941 0.51