Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VQD4

Protein Details
Accession A0A1Y1VQD4    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-149RPKAPSTNQPTKKRAKHQKHSNNNNALAHydrophilic
215-237NGGSTERKRRRSHPKVNTSKTLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-137KKRAK
221-226RKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.999, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MTITKNIYNTSQDERGYISVYEFTSSNGTIVMWDSECGYVNWTSIRKAMGWSKRGEGRNIMKEMENVEKTAKDIRKIRGGILKIQGTWIPFDDAYEAAKEYCYSIRYELTHIFGEQFAKEARPKAPSTNQPTKKRAKHQKHSNNNNALAALKYNLGELTPPPSDIDYSSSSASSSAVSTVNNTPISNNNNNKNTSTKYSTITGTTRKRRTSVSENGGSTERKRRRSHPKVNTSKTLAQHNVINSTLMKNPTGMKGYNVPTVDPNNCKGPFNMNNCNAPNQDWENICNNTNTPNKMNNSSMRKKVHSVNLNIDTNQIFEAVETALALQTLSMDLGLRPFPSWMNIQRNEYKKLNDYPKLTYPSEFEMAGCRFEMVGGCYQKVC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.3
4 0.26
5 0.21
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.16
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.15
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.1
20 0.1
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.12
27 0.13
28 0.18
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.19
34 0.24
35 0.32
36 0.36
37 0.4
38 0.41
39 0.45
40 0.52
41 0.54
42 0.53
43 0.53
44 0.53
45 0.56
46 0.55
47 0.51
48 0.45
49 0.43
50 0.42
51 0.41
52 0.33
53 0.27
54 0.26
55 0.24
56 0.24
57 0.31
58 0.31
59 0.31
60 0.37
61 0.41
62 0.48
63 0.49
64 0.52
65 0.51
66 0.5
67 0.49
68 0.48
69 0.45
70 0.36
71 0.37
72 0.33
73 0.27
74 0.26
75 0.21
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.17
93 0.18
94 0.21
95 0.21
96 0.22
97 0.22
98 0.21
99 0.2
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.18
108 0.19
109 0.23
110 0.24
111 0.29
112 0.36
113 0.42
114 0.49
115 0.56
116 0.63
117 0.67
118 0.73
119 0.77
120 0.77
121 0.79
122 0.81
123 0.81
124 0.83
125 0.86
126 0.89
127 0.9
128 0.92
129 0.91
130 0.88
131 0.78
132 0.68
133 0.57
134 0.46
135 0.36
136 0.26
137 0.16
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.07
144 0.06
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.14
153 0.12
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.09
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.09
166 0.1
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.16
172 0.21
173 0.26
174 0.3
175 0.34
176 0.37
177 0.39
178 0.39
179 0.38
180 0.36
181 0.33
182 0.33
183 0.28
184 0.26
185 0.27
186 0.26
187 0.26
188 0.26
189 0.29
190 0.33
191 0.4
192 0.44
193 0.44
194 0.45
195 0.45
196 0.49
197 0.49
198 0.49
199 0.48
200 0.47
201 0.45
202 0.45
203 0.44
204 0.39
205 0.34
206 0.35
207 0.34
208 0.38
209 0.41
210 0.49
211 0.58
212 0.68
213 0.76
214 0.77
215 0.81
216 0.84
217 0.86
218 0.83
219 0.77
220 0.72
221 0.64
222 0.6
223 0.51
224 0.42
225 0.39
226 0.34
227 0.3
228 0.24
229 0.22
230 0.16
231 0.16
232 0.18
233 0.16
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.17
238 0.2
239 0.18
240 0.17
241 0.22
242 0.24
243 0.28
244 0.26
245 0.24
246 0.24
247 0.28
248 0.3
249 0.27
250 0.27
251 0.29
252 0.3
253 0.3
254 0.28
255 0.32
256 0.36
257 0.41
258 0.47
259 0.44
260 0.49
261 0.5
262 0.53
263 0.45
264 0.39
265 0.37
266 0.3
267 0.31
268 0.26
269 0.28
270 0.29
271 0.3
272 0.3
273 0.26
274 0.23
275 0.26
276 0.3
277 0.31
278 0.3
279 0.35
280 0.38
281 0.41
282 0.46
283 0.47
284 0.51
285 0.55
286 0.59
287 0.58
288 0.58
289 0.58
290 0.61
291 0.62
292 0.6
293 0.58
294 0.59
295 0.6
296 0.59
297 0.55
298 0.49
299 0.4
300 0.33
301 0.27
302 0.19
303 0.11
304 0.08
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.21
328 0.27
329 0.36
330 0.4
331 0.46
332 0.54
333 0.59
334 0.63
335 0.61
336 0.58
337 0.55
338 0.6
339 0.63
340 0.62
341 0.61
342 0.61
343 0.64
344 0.65
345 0.6
346 0.52
347 0.46
348 0.44
349 0.42
350 0.36
351 0.28
352 0.29
353 0.28
354 0.27
355 0.24
356 0.19
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.14
361 0.21
362 0.22