FuNGI

A0A1Y1VF81

Protein Details

Accession

A0A1Y1VF81

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
391-419	PDVVLVKKSYPSRRRRNRARNWKLKELAM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
401-413	PSRRRRNRARNWK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEYQHYNPTITNQTILCCNCGVPITPNPANMCIDCIRNEVDITEGIPKQCTLNFCRSCERYLQPPNLWVYCELESRELLALCLKRLKGLSKVRLINAQFLYTEPHSKRIKLQLTIQKEVFANTILQQVFVVTFLVCNQICEDCTDAAAKNTWKACVQVRQKVNHKRTFLFLEQVILKHNAQRDANNIKEAKDGIDFYYSQRAHAIKMVEFLQSITPIRVKTSEQLLSADIHTGSKSYKFTYSCELIPICKDDLLCLPRKIAHNSSMINQLCICSRISNTIQVIDPNTMKIAEIRPQTYWESKYSQFEALCSYQDLVEYYIIDVIEYGPRVGKYQQITVEVCLSNDFSNTFIARTHLGNVLKAGDHAFGYNLAHSNFNNQIFEDYCRSNSVPDVVLVKKSYPSRRRRNRARNWKLKELAMEEENNGEKTKAEVAKAEQDYELFLRDIEEDPELRGMINLYKSMY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.3
4	0.24
5	0.23
6	0.21
7	0.21
8	0.21
9	0.19
10	0.24
11	0.31
12	0.33
13	0.37
14	0.38
15	0.39
16	0.4
17	0.35
18	0.34
19	0.28
20	0.28
21	0.26
22	0.26
23	0.25
24	0.23
25	0.23
26	0.19
27	0.18
28	0.16
29	0.16
30	0.19
31	0.19
32	0.18
33	0.19
34	0.2
35	0.2
36	0.22
37	0.26
38	0.25
39	0.34
40	0.38
41	0.41
42	0.5
43	0.5
44	0.51
45	0.52
46	0.51
47	0.5
48	0.54
49	0.58
50	0.52
51	0.55
52	0.57
53	0.51
54	0.49
55	0.4
56	0.35
57	0.29
58	0.3
59	0.26
60	0.22
61	0.21
62	0.21
63	0.22
64	0.18
65	0.16
66	0.18
67	0.18
68	0.19
69	0.24
70	0.22
71	0.22
72	0.25
73	0.28
74	0.32
75	0.41
76	0.46
77	0.5
78	0.54
79	0.54
80	0.58
81	0.56
82	0.54
83	0.45
84	0.39
85	0.3
86	0.26
87	0.29
88	0.23
89	0.3
90	0.24
91	0.31
92	0.33
93	0.34
94	0.4
95	0.45
96	0.49
97	0.45
98	0.53
99	0.54
100	0.58
101	0.62
102	0.56
103	0.5
104	0.43
105	0.41
106	0.32
107	0.24
108	0.18
109	0.13
110	0.19
111	0.15
112	0.15
113	0.14
114	0.13
115	0.12
116	0.11
117	0.11
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.11
122	0.1
123	0.1
124	0.11
125	0.12
126	0.12
127	0.13
128	0.15
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.11
133	0.12
134	0.15
135	0.15
136	0.17
137	0.18
138	0.19
139	0.18
140	0.2
141	0.24
142	0.3
143	0.36
144	0.4
145	0.45
146	0.51
147	0.6
148	0.68
149	0.73
150	0.71
151	0.67
152	0.6
153	0.58
154	0.57
155	0.49
156	0.42
157	0.33
158	0.29
159	0.26
160	0.25
161	0.23
162	0.2
163	0.18
164	0.17
165	0.2
166	0.21
167	0.21
168	0.22
169	0.26
170	0.3
171	0.31
172	0.34
173	0.32
174	0.28
175	0.29
176	0.28
177	0.22
178	0.17
179	0.17
180	0.12
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.21
185	0.2
186	0.19
187	0.21
188	0.21
189	0.19
190	0.22
191	0.22
192	0.14
193	0.16
194	0.17
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.13
208	0.17
209	0.19
210	0.17
211	0.18
212	0.18
213	0.18
214	0.17
215	0.15
216	0.1
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.14
225	0.15
226	0.17
227	0.21
228	0.23
229	0.2
230	0.22
231	0.21
232	0.18
233	0.18
234	0.18
235	0.14
236	0.13
237	0.12
238	0.1
239	0.15
240	0.18
241	0.21
242	0.19
243	0.2
244	0.22
245	0.26
246	0.29
247	0.27
248	0.28
249	0.28
250	0.28
251	0.29
252	0.34
253	0.31
254	0.27
255	0.24
256	0.21
257	0.17
258	0.18
259	0.16
260	0.09
261	0.09
262	0.14
263	0.15
264	0.19
265	0.19
266	0.19
267	0.19
268	0.19
269	0.2
270	0.17
271	0.16
272	0.12
273	0.12
274	0.1
275	0.1
276	0.11
277	0.12
278	0.15
279	0.18
280	0.19
281	0.19
282	0.22
283	0.25
284	0.27
285	0.28
286	0.25
287	0.27
288	0.28
289	0.31
290	0.31
291	0.31
292	0.27
293	0.25
294	0.27
295	0.23
296	0.22
297	0.18
298	0.16
299	0.12
300	0.13
301	0.13
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.11
317	0.12
318	0.16
319	0.17
320	0.21
321	0.24
322	0.27
323	0.27
324	0.27
325	0.31
326	0.26
327	0.23
328	0.2
329	0.18
330	0.14
331	0.14
332	0.12
333	0.09
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.11
339	0.13
340	0.13
341	0.15
342	0.19
343	0.19
344	0.19
345	0.2
346	0.19
347	0.18
348	0.17
349	0.16
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.14
360	0.14
361	0.18
362	0.23
363	0.24
364	0.23
365	0.21
366	0.23
367	0.23
368	0.26
369	0.26
370	0.22
371	0.22
372	0.25
373	0.25
374	0.23
375	0.23
376	0.23
377	0.19
378	0.19
379	0.22
380	0.2
381	0.23
382	0.23
383	0.23
384	0.25
385	0.32
386	0.41
387	0.46
388	0.56
389	0.63
390	0.73
391	0.83
392	0.89
393	0.93
394	0.94
395	0.95
396	0.96
397	0.96
398	0.93
399	0.92
400	0.85
401	0.78
402	0.73
403	0.65
404	0.59
405	0.52
406	0.46
407	0.36
408	0.36
409	0.34
410	0.29
411	0.26
412	0.2
413	0.17
414	0.17
415	0.24
416	0.23
417	0.23
418	0.25
419	0.29
420	0.38
421	0.4
422	0.4
423	0.32
424	0.29
425	0.3
426	0.28
427	0.25
428	0.16
429	0.14
430	0.13
431	0.15
432	0.16
433	0.15
434	0.17
435	0.15
436	0.17
437	0.18
438	0.17
439	0.15
440	0.14
441	0.14
442	0.16
443	0.18

A0A1Y1VF81

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer