Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VLR7

Protein Details
Accession A0A1Y1VLR7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-277EERKKEREKYEEERKRRHRHRSRSRNRSRSRDRSRSRSRHSRHHRRDRSRSRSRHSRHYRDKSRDKRRRDRSRSRSPRETHSRSRHHRSRSTSSSRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-270VKHEEERKKEREKYEEERKRRHRHRSRSRNRSRSRDRSRSRSRHSRHHRRDRSRSRSRHSRHYRDKSRDKRRRDRSRSRSPRETHSRSRHHRSR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKKAANKLETTGNEETMNLNSIVYQNIKSSLYFKSLYELKTYHEVVSEIKNQVKSLEPFMKDTIASTAYCLLFKLWTLKLTIKQVNGLINFQNCSHVRALGFLYLRYVCKPDHLWSWFEDYLDDEEEVQVEGGVSPRIMTIGRMCRQLLTEQKWLDTILPRIPLKISQEIDEKIRVKHEEERKKEREKYEEERKRRHRHRSRSRNRSRSRDRSRSRSRHSRHHRRDRSRSRSRHSRHYRDKSRDKRRRDRSRSRSPRETHSRSRHHRSRSTSSSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.3
4 0.23
5 0.23
6 0.15
7 0.13
8 0.11
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.2
18 0.2
19 0.22
20 0.22
21 0.21
22 0.24
23 0.28
24 0.28
25 0.3
26 0.28
27 0.27
28 0.32
29 0.33
30 0.28
31 0.24
32 0.24
33 0.22
34 0.27
35 0.29
36 0.26
37 0.29
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.33
42 0.29
43 0.31
44 0.35
45 0.32
46 0.34
47 0.35
48 0.35
49 0.29
50 0.27
51 0.22
52 0.17
53 0.15
54 0.13
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.16
63 0.13
64 0.14
65 0.16
66 0.19
67 0.23
68 0.3
69 0.33
70 0.29
71 0.3
72 0.31
73 0.33
74 0.31
75 0.28
76 0.24
77 0.21
78 0.21
79 0.19
80 0.23
81 0.19
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.11
97 0.14
98 0.17
99 0.17
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.24
104 0.31
105 0.28
106 0.25
107 0.23
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.06
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.09
129 0.16
130 0.18
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.25
136 0.28
137 0.26
138 0.3
139 0.28
140 0.28
141 0.28
142 0.28
143 0.25
144 0.2
145 0.18
146 0.14
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.21
153 0.25
154 0.23
155 0.21
156 0.25
157 0.26
158 0.27
159 0.3
160 0.28
161 0.23
162 0.26
163 0.25
164 0.24
165 0.31
166 0.39
167 0.44
168 0.5
169 0.59
170 0.63
171 0.7
172 0.74
173 0.71
174 0.69
175 0.67
176 0.68
177 0.7
178 0.73
179 0.73
180 0.77
181 0.81
182 0.84
183 0.86
184 0.88
185 0.87
186 0.88
187 0.91
188 0.92
189 0.93
190 0.94
191 0.95
192 0.95
193 0.94
194 0.93
195 0.92
196 0.92
197 0.92
198 0.91
199 0.89
200 0.89
201 0.91
202 0.9
203 0.89
204 0.89
205 0.85
206 0.85
207 0.88
208 0.88
209 0.88
210 0.89
211 0.91
212 0.91
213 0.95
214 0.95
215 0.95
216 0.94
217 0.93
218 0.91
219 0.91
220 0.87
221 0.86
222 0.86
223 0.87
224 0.87
225 0.89
226 0.89
227 0.89
228 0.94
229 0.94
230 0.94
231 0.92
232 0.92
233 0.92
234 0.92
235 0.93
236 0.93
237 0.93
238 0.92
239 0.94
240 0.95
241 0.94
242 0.93
243 0.86
244 0.86
245 0.85
246 0.84
247 0.83
248 0.82
249 0.83
250 0.83
251 0.89
252 0.87
253 0.86
254 0.86
255 0.84
256 0.83
257 0.83