FuNGI

A0A1Y1VKT5

Protein Details

Accession

A0A1Y1VKT5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
234-259	SREEYLEYRNKRNKQKKDIAEAEKKL	Hydrophilic
675-694	AIKEKKKKLLDQKREYDRMK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
244-270	KRNKQKKDIAEAEKKLLPLQEKKKEQE
672-683	EREAIKEKKKKL
1062-1079	KKKESLGHGSQHIHKKRR

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination

Amino Acid Sequences

MDGKITKVKLRNFVTYDYCEFTPGPNLNMIIGPNGTGKSSIVCGIALGLGGSTQTLGRAKDISDFIKHGAEKATIEITLFHQKKGKPSNITIQRTLKRNTNSTSWKIDGKPYNQKDVLSLIESFNIQIDNLCQFLPQDKVCEFAQMSSIELLNATLKAIGNKDLYTEYEELLKCQEQKNILQSNLENQEKILNKIKNQNEAIEREVAKYKERENILQNIRILEKQIPWGIYDKSREEYLEYRNKRNKQKKDIAEAEKKLLPLQEKKKEQEKKIERATQIENHLEKEYEECVKKYTELSKEIENLEEENNSIINNFLDFRENERELENKIKMHKRKMYELENSIEIKKKELIEKGIIDENGEELYNNNSSDNDTSTELGKIQWELGEKAQKLFEIDAEVRSIQNKEQDIRQQNFVYIEEIDRLRKQLSDLDNIRNQRLNLLERSHKPTFIAYQWLEKNRLMFKMHVYAPVLIEINPKNRECAAAVEAFTGSSLTTFVTQCKDDYDTFTNELIDKRRLKISVVMYENLSVNDFEVPIPKDELQDYGFDCYLIDLIQGPDPVKCALCKLNNIHAVPYAGRDIDAAPFDDDHRFKNYVINNVRYSKRAAYGMLSVRTQQLRDAKILFSNTDTKQKLKFENMILDNEKMKKKLELDMKELVQKESKLRTSYEKIRNEREAIKEKKKKLLDQKREYDRMKKQLDIVKIEYNSYSQNSSSYTEEKENFQRKINDNLSRREEKLENYTDYQKKAFELFNQKTTIIIDNLQDSALLSTTNEEIYNYQRFLNEMKEKYIKIDAEFKEVKNKAQSAYEEAKSSLEDLSDKEKRLVHEGFQNKTLDELQQALAEEKLKAEMINENNADIVKEYNERKAEIEHLKEETNTSKNSITEINDNMKEIEKTFIPKIHEVIQELDKKFSEAFDKIGCVGEIKLNENEEYKKWGIDIYVKFRDTEELQLLTGTRQSGGERSVSTILYLMTLQEFSKAPFRVVDEINQGMDSRNERLIHAQLVDAASQDGTSQYFLITPKLLPDLKYNSKMKVLCIYNGEWQMIENKHKVDKIDFRKYINKKKESLGHGSQHIHKKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.57
3	0.54
4	0.49
5	0.44
6	0.38
7	0.35
8	0.31
9	0.33
10	0.29
11	0.27
12	0.25
13	0.25
14	0.24
15	0.25
16	0.24
17	0.18
18	0.16
19	0.15
20	0.15
21	0.15
22	0.14
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.14
27	0.15
28	0.13
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.11
33	0.09
34	0.08
35	0.05
36	0.05
37	0.05
38	0.05
39	0.05
40	0.04
41	0.08
42	0.11
43	0.12
44	0.14
45	0.16
46	0.17
47	0.22
48	0.26
49	0.26
50	0.28
51	0.29
52	0.29
53	0.34
54	0.33
55	0.3
56	0.29
57	0.27
58	0.24
59	0.25
60	0.24
61	0.18
62	0.18
63	0.17
64	0.18
65	0.27
66	0.27
67	0.27
68	0.32
69	0.34
70	0.44
71	0.52
72	0.56
73	0.53
74	0.58
75	0.66
76	0.7
77	0.74
78	0.73
79	0.72
80	0.71
81	0.7
82	0.69
83	0.66
84	0.63
85	0.63
86	0.6
87	0.59
88	0.61
89	0.6
90	0.63
91	0.57
92	0.57
93	0.52
94	0.57
95	0.55
96	0.55
97	0.61
98	0.58
99	0.64
100	0.6
101	0.58
102	0.51
103	0.46
104	0.4
105	0.32
106	0.29
107	0.2
108	0.19
109	0.19
110	0.17
111	0.15
112	0.12
113	0.1
114	0.09
115	0.1
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.11
121	0.14
122	0.18
123	0.17
124	0.2
125	0.2
126	0.23
127	0.23
128	0.27
129	0.25
130	0.2
131	0.23
132	0.19
133	0.2
134	0.18
135	0.18
136	0.13
137	0.12
138	0.12
139	0.09
140	0.09
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.11
145	0.13
146	0.16
147	0.17
148	0.17
149	0.18
150	0.18
151	0.19
152	0.21
153	0.21
154	0.18
155	0.23
156	0.23
157	0.22
158	0.24
159	0.25
160	0.25
161	0.27
162	0.31
163	0.28
164	0.33
165	0.41
166	0.43
167	0.41
168	0.41
169	0.39
170	0.42
171	0.46
172	0.43
173	0.34
174	0.28
175	0.34
176	0.32
177	0.36
178	0.37
179	0.33
180	0.36
181	0.46
182	0.5
183	0.52
184	0.52
185	0.54
186	0.5
187	0.49
188	0.47
189	0.44
190	0.4
191	0.34
192	0.38
193	0.33
194	0.33
195	0.33
196	0.33
197	0.34
198	0.37
199	0.39
200	0.39
201	0.47
202	0.48
203	0.49
204	0.47
205	0.42
206	0.41
207	0.36
208	0.33
209	0.27
210	0.24
211	0.23
212	0.25
213	0.23
214	0.23
215	0.25
216	0.26
217	0.27
218	0.3
219	0.28
220	0.27
221	0.28
222	0.27
223	0.28
224	0.29
225	0.33
226	0.39
227	0.41
228	0.49
229	0.57
230	0.65
231	0.72
232	0.78
233	0.8
234	0.8
235	0.85
236	0.84
237	0.85
238	0.86
239	0.85
240	0.84
241	0.77
242	0.7
243	0.62
244	0.54
245	0.45
246	0.39
247	0.35
248	0.35
249	0.42
250	0.47
251	0.52
252	0.57
253	0.66
254	0.71
255	0.71
256	0.73
257	0.72
258	0.72
259	0.75
260	0.77
261	0.69
262	0.65
263	0.64
264	0.59
265	0.55
266	0.53
267	0.44
268	0.39
269	0.38
270	0.33
271	0.28
272	0.24
273	0.22
274	0.21
275	0.22
276	0.2
277	0.21
278	0.22
279	0.22
280	0.24
281	0.29
282	0.28
283	0.3
284	0.32
285	0.33
286	0.36
287	0.35
288	0.33
289	0.26
290	0.22
291	0.19
292	0.17
293	0.14
294	0.11
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.1
304	0.11
305	0.16
306	0.23
307	0.24
308	0.24
309	0.25
310	0.26
311	0.26
312	0.32
313	0.29
314	0.26
315	0.32
316	0.41
317	0.46
318	0.53
319	0.57
320	0.55
321	0.61
322	0.66
323	0.65
324	0.63
325	0.61
326	0.54
327	0.51
328	0.48
329	0.41
330	0.39
331	0.31
332	0.27
333	0.26
334	0.26
335	0.27
336	0.29
337	0.31
338	0.3
339	0.31
340	0.31
341	0.31
342	0.29
343	0.24
344	0.2
345	0.17
346	0.13
347	0.11
348	0.09
349	0.06
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.12
364	0.12
365	0.11
366	0.09
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.14
372	0.2
373	0.2
374	0.21
375	0.21
376	0.2
377	0.19
378	0.18
379	0.15
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.14
385	0.13
386	0.14
387	0.15
388	0.12
389	0.16
390	0.17
391	0.17
392	0.21
393	0.3
394	0.36
395	0.37
396	0.41
397	0.36
398	0.36
399	0.35
400	0.32
401	0.24
402	0.17
403	0.15
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.13
408	0.14
409	0.13
410	0.13
411	0.14
412	0.18
413	0.2
414	0.26
415	0.29
416	0.33
417	0.37
418	0.38
419	0.39
420	0.35
421	0.32
422	0.26
423	0.26
424	0.24
425	0.23
426	0.25
427	0.29
428	0.31
429	0.39
430	0.38
431	0.35
432	0.32
433	0.3
434	0.29
435	0.24
436	0.27
437	0.2
438	0.25
439	0.29
440	0.31
441	0.33
442	0.3
443	0.32
444	0.28
445	0.3
446	0.26
447	0.23
448	0.22
449	0.25
450	0.25
451	0.24
452	0.24
453	0.21
454	0.19
455	0.19
456	0.17
457	0.12
458	0.15
459	0.14
460	0.19
461	0.21
462	0.21
463	0.21
464	0.21
465	0.22
466	0.19
467	0.19
468	0.16
469	0.14
470	0.14
471	0.13
472	0.13
473	0.12
474	0.11
475	0.08
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.06
482	0.07
483	0.09
484	0.1
485	0.1
486	0.11
487	0.14
488	0.13
489	0.17
490	0.19
491	0.19
492	0.21
493	0.21
494	0.2
495	0.18
496	0.19
497	0.18
498	0.21
499	0.21
500	0.21
501	0.23
502	0.24
503	0.23
504	0.28
505	0.28
506	0.29
507	0.3
508	0.28
509	0.26
510	0.26
511	0.26
512	0.2
513	0.16
514	0.09
515	0.07
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.11
523	0.11
524	0.12
525	0.12
526	0.13
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.07
536	0.05
537	0.05
538	0.04
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.09
549	0.13
550	0.15
551	0.2
552	0.22
553	0.29
554	0.34
555	0.34
556	0.32
557	0.28
558	0.27
559	0.22
560	0.2
561	0.14
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.08
571	0.09
572	0.12
573	0.12
574	0.13
575	0.16
576	0.17
577	0.17
578	0.22
579	0.24
580	0.29
581	0.33
582	0.36
583	0.35
584	0.39
585	0.4
586	0.36
587	0.36
588	0.29
589	0.26
590	0.23
591	0.2
592	0.17
593	0.21
594	0.23
595	0.22
596	0.2
597	0.19
598	0.21
599	0.21
600	0.19
601	0.18
602	0.2
603	0.2
604	0.22
605	0.23
606	0.2
607	0.22
608	0.23
609	0.19
610	0.16
611	0.2
612	0.2
613	0.26
614	0.27
615	0.27
616	0.3
617	0.34
618	0.35
619	0.34
620	0.37
621	0.31
622	0.38
623	0.37
624	0.37
625	0.35
626	0.33
627	0.31
628	0.32
629	0.31
630	0.25
631	0.24
632	0.23
633	0.23
634	0.29
635	0.34
636	0.34
637	0.36
638	0.4
639	0.4
640	0.41
641	0.4
642	0.35
643	0.28
644	0.25
645	0.25
646	0.26
647	0.28
648	0.26
649	0.27
650	0.32
651	0.36
652	0.45
653	0.5
654	0.53
655	0.55
656	0.59
657	0.61
658	0.58
659	0.56
660	0.53
661	0.54
662	0.53
663	0.59
664	0.61
665	0.62
666	0.66
667	0.66
668	0.66
669	0.68
670	0.71
671	0.71
672	0.72
673	0.78
674	0.78
675	0.82
676	0.78
677	0.76
678	0.72
679	0.71
680	0.64
681	0.57
682	0.54
683	0.52
684	0.53
685	0.49
686	0.44
687	0.4
688	0.37
689	0.36
690	0.31
691	0.26
692	0.23
693	0.19
694	0.17
695	0.12
696	0.12
697	0.14
698	0.15
699	0.17
700	0.17
701	0.18
702	0.22
703	0.23
704	0.25
705	0.33
706	0.38
707	0.37
708	0.4
709	0.45
710	0.44
711	0.52
712	0.56
713	0.56
714	0.53
715	0.58
716	0.6
717	0.57
718	0.55
719	0.5
720	0.45
721	0.39
722	0.42
723	0.39
724	0.36
725	0.35
726	0.42
727	0.41
728	0.41
729	0.39
730	0.32
731	0.29
732	0.29
733	0.27
734	0.26
735	0.33
736	0.34
737	0.38
738	0.39
739	0.37
740	0.35
741	0.35
742	0.3
743	0.2
744	0.18
745	0.15
746	0.14
747	0.14
748	0.14
749	0.12
750	0.1
751	0.09
752	0.07
753	0.06
754	0.05
755	0.06
756	0.06
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.08
761	0.13
762	0.17
763	0.16
764	0.17
765	0.16
766	0.17
767	0.19
768	0.26
769	0.29
770	0.27
771	0.32
772	0.35
773	0.35
774	0.37
775	0.4
776	0.33
777	0.28
778	0.35
779	0.31
780	0.35
781	0.38
782	0.36
783	0.4
784	0.4
785	0.41
786	0.38
787	0.39
788	0.33
789	0.34
790	0.35
791	0.32
792	0.37
793	0.35
794	0.31
795	0.29
796	0.28
797	0.24
798	0.23
799	0.16
800	0.11
801	0.1
802	0.1
803	0.18
804	0.22
805	0.23
806	0.25
807	0.28
808	0.29
809	0.35
810	0.35
811	0.29
812	0.34
813	0.39
814	0.39
815	0.41
816	0.4
817	0.33
818	0.33
819	0.31
820	0.23
821	0.18
822	0.17
823	0.13
824	0.14
825	0.15
826	0.14
827	0.14
828	0.14
829	0.13
830	0.11
831	0.11
832	0.1
833	0.09
834	0.1
835	0.15
836	0.17
837	0.23
838	0.23
839	0.22
840	0.22
841	0.22
842	0.21
843	0.15
844	0.14
845	0.09
846	0.15
847	0.17
848	0.23
849	0.25
850	0.25
851	0.26
852	0.27
853	0.33
854	0.34
855	0.37
856	0.33
857	0.34
858	0.34
859	0.33
860	0.34
861	0.31
862	0.28
863	0.25
864	0.25
865	0.25
866	0.24
867	0.26
868	0.27
869	0.24
870	0.25
871	0.28
872	0.32
873	0.3
874	0.31
875	0.3
876	0.29
877	0.27
878	0.23
879	0.21
880	0.17
881	0.2
882	0.23
883	0.26
884	0.28
885	0.3
886	0.31
887	0.35
888	0.36
889	0.34
890	0.35
891	0.38
892	0.41
893	0.4
894	0.4
895	0.33
896	0.32
897	0.3
898	0.28
899	0.26
900	0.19
901	0.21
902	0.2
903	0.21
904	0.21
905	0.22
906	0.2
907	0.16
908	0.15
909	0.16
910	0.16
911	0.18
912	0.2
913	0.21
914	0.22
915	0.24
916	0.26
917	0.24
918	0.28
919	0.26
920	0.24
921	0.22
922	0.22
923	0.21
924	0.27
925	0.32
926	0.34
927	0.4
928	0.4
929	0.41
930	0.4
931	0.42
932	0.36
933	0.35
934	0.31
935	0.24
936	0.24
937	0.24
938	0.24
939	0.2
940	0.2
941	0.15
942	0.12
943	0.12
944	0.13
945	0.15
946	0.16
947	0.19
948	0.17
949	0.2
950	0.22
951	0.2
952	0.19
953	0.17
954	0.15
955	0.13
956	0.13
957	0.1
958	0.09
959	0.1
960	0.09
961	0.11
962	0.12
963	0.13
964	0.21
965	0.21
966	0.21
967	0.22
968	0.26
969	0.29
970	0.3
971	0.32
972	0.31
973	0.32
974	0.31
975	0.29
976	0.26
977	0.22
978	0.24
979	0.22
980	0.2
981	0.23
982	0.23
983	0.24
984	0.28
985	0.3
986	0.3
987	0.28
988	0.25
989	0.22
990	0.22
991	0.21
992	0.17
993	0.14
994	0.11
995	0.1
996	0.1
997	0.08
998	0.08
999	0.08
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.1
1003	0.11
1004	0.14
1005	0.15
1006	0.14
1007	0.16
1008	0.23
1009	0.24
1010	0.24
1011	0.3
1012	0.36
1013	0.43
1014	0.52
1015	0.52
1016	0.5
1017	0.55
1018	0.55
1019	0.51
1020	0.51
1021	0.46
1022	0.41
1023	0.43
1024	0.42
1025	0.42
1026	0.44
1027	0.41
1028	0.32
1029	0.29
1030	0.32
1031	0.32
1032	0.36
1033	0.33
1034	0.34
1035	0.38
1036	0.41
1037	0.43
1038	0.45
1039	0.5
1040	0.54
1041	0.61
1042	0.61
1043	0.62
1044	0.69
1045	0.76
1046	0.79
1047	0.79
1048	0.77
1049	0.7
1050	0.74
1051	0.77
1052	0.74
1053	0.73
1054	0.71
1055	0.67
1056	0.66
1057	0.67
1058	0.68
1059	0.69

A0A1Y1VKT5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer