Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UQV9

Protein Details
Accession A0A1Y1UQV9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-35PSVPSNTGKTVQKKKKSSNNLKVKPLEQHydrophilic
59-91NKPEIEKKEVDKKKNRYYKKKSMSDMKKTENKSBasic
111-139LKKSASKQFLSQKKKRKSKMNLKAEKQEDHydrophilic
437-458EARAKRQAARLERQKRLQENSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-79DKKKNRYYKKK
121-130SQKKKRKSKM
428-449KEIDRKKFEEARAKRQAARLER
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR014789  PolyA-riboNase_RNA-binding  
IPR039884  R3HC1/R3HCL  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08675  RNA_bind  
Amino Acid Sequences MSEKTTAPSVPSNTGKTVQKKKKSSNNLKVKPLEQLENEKVNNEKVQKNQVNKENNDNNKPEIEKKEVDKKKNRYYKKKSMSDMKKTENKSENLSDAKSDVTSSTNEKPDLKKSASKQFLSQKKKRKSKMNLKAEKQEDTKEEDNSDIKLIESFLTSLSMKRDEMEKKEEELINNPPPPQQHTANKFPKKQNYNYTKAYKPKKEIPIYDGNANILKQNEEIKRVLDCFDFPTAYKTHNLMEMFKEYEGNFRINWINDSRALFIFNSEENAKSAYELKKNETEYKIKPYENPTSEFSPLNDESESVNTSEDEKNENENEIENEKVYENNDQYERNERYHNHSKSDQHECPLNHSKNEKSEYQTKYNKYSQPSQPRQPNIQTTPFLRQTSQETQEKPVRRQRPVTSDVVARRLISSALGIKPKEKTEEEKEIDRKKFEEARAKRQAARLERQKRLQENSDIFNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.5
3 0.54
4 0.61
5 0.64
6 0.69
7 0.75
8 0.82
9 0.86
10 0.89
11 0.91
12 0.91
13 0.92
14 0.9
15 0.9
16 0.86
17 0.77
18 0.74
19 0.68
20 0.63
21 0.57
22 0.57
23 0.54
24 0.56
25 0.54
26 0.48
27 0.45
28 0.42
29 0.44
30 0.41
31 0.4
32 0.39
33 0.5
34 0.54
35 0.61
36 0.66
37 0.68
38 0.71
39 0.69
40 0.73
41 0.72
42 0.74
43 0.73
44 0.67
45 0.61
46 0.57
47 0.57
48 0.53
49 0.5
50 0.48
51 0.45
52 0.49
53 0.57
54 0.6
55 0.67
56 0.7
57 0.74
58 0.78
59 0.83
60 0.88
61 0.88
62 0.9
63 0.9
64 0.91
65 0.9
66 0.87
67 0.88
68 0.88
69 0.87
70 0.85
71 0.83
72 0.81
73 0.76
74 0.77
75 0.73
76 0.65
77 0.61
78 0.56
79 0.52
80 0.47
81 0.44
82 0.36
83 0.28
84 0.27
85 0.21
86 0.18
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.17
91 0.22
92 0.25
93 0.27
94 0.31
95 0.33
96 0.38
97 0.43
98 0.42
99 0.43
100 0.45
101 0.54
102 0.57
103 0.55
104 0.56
105 0.59
106 0.64
107 0.68
108 0.7
109 0.71
110 0.74
111 0.82
112 0.83
113 0.84
114 0.85
115 0.87
116 0.89
117 0.89
118 0.89
119 0.85
120 0.86
121 0.79
122 0.74
123 0.65
124 0.58
125 0.49
126 0.46
127 0.43
128 0.35
129 0.32
130 0.29
131 0.27
132 0.24
133 0.22
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.2
150 0.22
151 0.26
152 0.31
153 0.31
154 0.31
155 0.36
156 0.37
157 0.32
158 0.31
159 0.32
160 0.32
161 0.32
162 0.3
163 0.27
164 0.26
165 0.3
166 0.31
167 0.31
168 0.34
169 0.38
170 0.48
171 0.56
172 0.62
173 0.65
174 0.68
175 0.71
176 0.69
177 0.7
178 0.71
179 0.68
180 0.68
181 0.68
182 0.66
183 0.63
184 0.65
185 0.67
186 0.63
187 0.6
188 0.62
189 0.64
190 0.64
191 0.61
192 0.58
193 0.58
194 0.54
195 0.5
196 0.42
197 0.34
198 0.29
199 0.27
200 0.22
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.16
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.17
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.16
232 0.12
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.15
240 0.17
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.18
245 0.17
246 0.15
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.15
260 0.17
261 0.22
262 0.23
263 0.27
264 0.31
265 0.34
266 0.39
267 0.38
268 0.4
269 0.38
270 0.45
271 0.46
272 0.42
273 0.43
274 0.43
275 0.48
276 0.45
277 0.45
278 0.4
279 0.38
280 0.39
281 0.36
282 0.3
283 0.27
284 0.25
285 0.23
286 0.19
287 0.17
288 0.16
289 0.17
290 0.17
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.17
313 0.16
314 0.19
315 0.21
316 0.21
317 0.23
318 0.31
319 0.33
320 0.3
321 0.35
322 0.33
323 0.4
324 0.49
325 0.51
326 0.47
327 0.5
328 0.54
329 0.55
330 0.62
331 0.56
332 0.48
333 0.52
334 0.46
335 0.49
336 0.53
337 0.5
338 0.46
339 0.48
340 0.49
341 0.5
342 0.54
343 0.49
344 0.45
345 0.5
346 0.51
347 0.56
348 0.6
349 0.57
350 0.6
351 0.64
352 0.64
353 0.6
354 0.63
355 0.64
356 0.67
357 0.71
358 0.73
359 0.75
360 0.75
361 0.77
362 0.75
363 0.74
364 0.69
365 0.67
366 0.61
367 0.56
368 0.58
369 0.56
370 0.51
371 0.43
372 0.39
373 0.4
374 0.44
375 0.48
376 0.46
377 0.42
378 0.47
379 0.54
380 0.58
381 0.59
382 0.61
383 0.63
384 0.64
385 0.7
386 0.71
387 0.72
388 0.71
389 0.68
390 0.62
391 0.6
392 0.57
393 0.54
394 0.47
395 0.38
396 0.33
397 0.29
398 0.25
399 0.18
400 0.17
401 0.18
402 0.21
403 0.26
404 0.26
405 0.29
406 0.34
407 0.37
408 0.4
409 0.39
410 0.42
411 0.45
412 0.54
413 0.55
414 0.6
415 0.66
416 0.69
417 0.7
418 0.66
419 0.59
420 0.56
421 0.59
422 0.58
423 0.6
424 0.59
425 0.64
426 0.72
427 0.76
428 0.73
429 0.71
430 0.72
431 0.7
432 0.73
433 0.73
434 0.72
435 0.76
436 0.8
437 0.83
438 0.82
439 0.81
440 0.78
441 0.77
442 0.72