Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VID2

Protein Details
Accession A0A1Y1VID2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-213NPHLRRTQLKQMLQKRWKKSPDNPMNQQHIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-26RKAKVKAEK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010422  Ccdc124/Oxs1  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06244  Ccdc124  
Amino Acid Sequences MAKKFKGVNSKVAAANERKAKVKAEKDRLIAEQKEREEALEWSKGAKDQSKKLLAEKKRQEQLLKKQQNAELLRQEEEELSKSKIRGNIKEDARKFQRRANYYNSNSSSTDSLPKFGQQKTEEFGASGIDNALDLMSAINEPEESSGNNNNNNNKIDRHPERRVKSAYAIFEEKTLPILKEENPHLRRTQLKQMLQKRWKKSPDNPMNQQHIAYNATQEEENQAVSNLNNEVLDRLRIKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.51
3 0.49
4 0.47
5 0.46
6 0.45
7 0.48
8 0.51
9 0.57
10 0.6
11 0.62
12 0.66
13 0.66
14 0.68
15 0.66
16 0.64
17 0.59
18 0.55
19 0.52
20 0.47
21 0.47
22 0.43
23 0.38
24 0.32
25 0.3
26 0.27
27 0.24
28 0.22
29 0.2
30 0.21
31 0.22
32 0.24
33 0.29
34 0.3
35 0.33
36 0.42
37 0.48
38 0.48
39 0.54
40 0.6
41 0.6
42 0.64
43 0.67
44 0.68
45 0.67
46 0.69
47 0.69
48 0.69
49 0.72
50 0.73
51 0.72
52 0.66
53 0.65
54 0.64
55 0.65
56 0.58
57 0.53
58 0.48
59 0.42
60 0.4
61 0.35
62 0.33
63 0.25
64 0.23
65 0.19
66 0.15
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.19
71 0.24
72 0.28
73 0.32
74 0.35
75 0.4
76 0.45
77 0.53
78 0.52
79 0.55
80 0.57
81 0.59
82 0.56
83 0.52
84 0.53
85 0.5
86 0.52
87 0.52
88 0.54
89 0.5
90 0.56
91 0.54
92 0.49
93 0.44
94 0.41
95 0.34
96 0.25
97 0.28
98 0.21
99 0.2
100 0.17
101 0.2
102 0.23
103 0.22
104 0.27
105 0.23
106 0.24
107 0.24
108 0.26
109 0.22
110 0.18
111 0.17
112 0.12
113 0.1
114 0.08
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.08
133 0.13
134 0.16
135 0.2
136 0.24
137 0.26
138 0.3
139 0.32
140 0.31
141 0.29
142 0.3
143 0.34
144 0.39
145 0.44
146 0.49
147 0.57
148 0.59
149 0.64
150 0.64
151 0.58
152 0.56
153 0.52
154 0.46
155 0.41
156 0.39
157 0.32
158 0.3
159 0.28
160 0.22
161 0.19
162 0.18
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.21
168 0.27
169 0.35
170 0.36
171 0.39
172 0.39
173 0.42
174 0.46
175 0.46
176 0.51
177 0.5
178 0.55
179 0.61
180 0.7
181 0.75
182 0.78
183 0.81
184 0.78
185 0.79
186 0.81
187 0.8
188 0.8
189 0.8
190 0.81
191 0.83
192 0.84
193 0.83
194 0.82
195 0.74
196 0.66
197 0.56
198 0.48
199 0.4
200 0.31
201 0.25
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.15
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.19