Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VHT8

Protein Details
Accession A0A1Y1VHT8    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-45IDEAKSDKSSKKKYIKRGEIENLEKKKBasic
48-71ENLEKEKEEKLKKKKENEITKAISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-62KKRKLIDEAKSDKSSKKKYIKRGEIENLEKKKYFENLEKEKEEKLKKKK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFLKSIIDEEISKKRKLIDEAKSDKSSKKKYIKRGEIENLEKKKYFENLEKEKEEKLKKKKENEITKAISLNNNSNNKSDKGENKSNSDNNDDDDNDNLSKIFENISQDEVIKRLRSHGEPIRYFGETDQERIIRLRHLEAAEEKTEGQQNEFMHAMEDTDRNLDLEALKKQAGIKDDDEKNKKKKDYKDVDTTIIGLELIQKDMDKACFLISVYFKRLLDAWEDELNERSEEVKRSYKGKRETAIQRQTREYLKPFFKGLKRKTIEADVLARVSEIAQFMQEREYMKANESYLQLSIGNAPWPIGVTMVGIHERSAREKIFASQVAHVLNDESQRKWIQSIKRIMTWAQDKYKPTDLSKRVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.43
4 0.5
5 0.54
6 0.53
7 0.59
8 0.65
9 0.71
10 0.71
11 0.68
12 0.66
13 0.67
14 0.66
15 0.65
16 0.69
17 0.7
18 0.75
19 0.83
20 0.87
21 0.85
22 0.85
23 0.84
24 0.83
25 0.84
26 0.83
27 0.77
28 0.72
29 0.66
30 0.58
31 0.53
32 0.49
33 0.47
34 0.46
35 0.5
36 0.54
37 0.61
38 0.64
39 0.61
40 0.61
41 0.63
42 0.64
43 0.64
44 0.65
45 0.68
46 0.72
47 0.8
48 0.84
49 0.86
50 0.87
51 0.85
52 0.84
53 0.78
54 0.72
55 0.65
56 0.57
57 0.51
58 0.43
59 0.42
60 0.41
61 0.43
62 0.41
63 0.42
64 0.43
65 0.4
66 0.41
67 0.41
68 0.4
69 0.43
70 0.5
71 0.51
72 0.53
73 0.58
74 0.58
75 0.55
76 0.52
77 0.44
78 0.37
79 0.37
80 0.33
81 0.26
82 0.24
83 0.23
84 0.18
85 0.17
86 0.15
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.13
93 0.14
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.16
101 0.15
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.29
106 0.34
107 0.41
108 0.4
109 0.43
110 0.41
111 0.38
112 0.36
113 0.29
114 0.3
115 0.21
116 0.22
117 0.22
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.19
128 0.2
129 0.23
130 0.21
131 0.2
132 0.18
133 0.16
134 0.2
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.15
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.23
165 0.28
166 0.35
167 0.41
168 0.46
169 0.51
170 0.55
171 0.59
172 0.58
173 0.61
174 0.65
175 0.67
176 0.67
177 0.69
178 0.66
179 0.62
180 0.55
181 0.47
182 0.36
183 0.26
184 0.19
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.16
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.19
215 0.19
216 0.15
217 0.13
218 0.12
219 0.13
220 0.15
221 0.18
222 0.23
223 0.24
224 0.31
225 0.37
226 0.44
227 0.49
228 0.53
229 0.52
230 0.55
231 0.62
232 0.66
233 0.69
234 0.67
235 0.63
236 0.59
237 0.6
238 0.56
239 0.51
240 0.45
241 0.43
242 0.41
243 0.4
244 0.4
245 0.43
246 0.46
247 0.52
248 0.52
249 0.55
250 0.54
251 0.54
252 0.55
253 0.53
254 0.49
255 0.42
256 0.4
257 0.31
258 0.29
259 0.26
260 0.22
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.13
271 0.13
272 0.15
273 0.19
274 0.18
275 0.2
276 0.23
277 0.22
278 0.24
279 0.23
280 0.22
281 0.19
282 0.19
283 0.16
284 0.14
285 0.15
286 0.13
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.09
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.14
302 0.15
303 0.19
304 0.23
305 0.22
306 0.23
307 0.24
308 0.27
309 0.31
310 0.34
311 0.33
312 0.31
313 0.33
314 0.31
315 0.3
316 0.27
317 0.21
318 0.19
319 0.24
320 0.24
321 0.21
322 0.26
323 0.28
324 0.29
325 0.31
326 0.36
327 0.38
328 0.45
329 0.54
330 0.54
331 0.57
332 0.58
333 0.56
334 0.58
335 0.56
336 0.55
337 0.53
338 0.54
339 0.53
340 0.56
341 0.64
342 0.6
343 0.59
344 0.61