Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EDF1

Protein Details
Accession H0EDF1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-131NSPASRPKPRRSVQKQGPKQDTRCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039970  TF_Grauzone  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Amino Acid Sequences MLRHEQSRTLATPSTASQVVYPESGSGTLPEGKDEVEDSVEMHEAAEQLKALSHVRHVSHDNLANERNHSHMPLEESPGMRSARDESVSSQDHGESGPEDQMYSSEYNSPASRPKPRRSVQKQGPKQDTRCSLCSHAPFKDSSSLRKHIAAAHTRPFPCAFSFAGCTSTFGSKNEWKRHIASQHLCLTYYRCSSCPQSTVEGKGNEFNRKDLFTQHLRRMHAPFAIKKAIAKGDSKLQVEWETHVKDMQASCLVIRRQPPQRSACPKPDCANLFEGAGSWDDWTEHVGRHMEKGEAGRLGVDKLLARWAYENGIIERRDDHTYRLVGAEREGNAGGYYSDGNGVEKKEPDERGEIESMNLDAGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.24
3 0.22
4 0.19
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.18
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.11
14 0.13
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.16
41 0.21
42 0.22
43 0.26
44 0.29
45 0.3
46 0.35
47 0.39
48 0.37
49 0.36
50 0.39
51 0.37
52 0.36
53 0.34
54 0.31
55 0.26
56 0.25
57 0.22
58 0.2
59 0.24
60 0.24
61 0.29
62 0.28
63 0.28
64 0.27
65 0.3
66 0.29
67 0.22
68 0.21
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.21
73 0.19
74 0.25
75 0.27
76 0.27
77 0.24
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.16
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.2
98 0.25
99 0.35
100 0.4
101 0.48
102 0.55
103 0.62
104 0.71
105 0.73
106 0.79
107 0.79
108 0.82
109 0.82
110 0.82
111 0.85
112 0.81
113 0.76
114 0.73
115 0.71
116 0.65
117 0.59
118 0.52
119 0.46
120 0.43
121 0.46
122 0.42
123 0.36
124 0.33
125 0.31
126 0.3
127 0.34
128 0.3
129 0.31
130 0.33
131 0.35
132 0.35
133 0.36
134 0.35
135 0.31
136 0.36
137 0.37
138 0.34
139 0.36
140 0.4
141 0.39
142 0.39
143 0.36
144 0.31
145 0.24
146 0.23
147 0.18
148 0.13
149 0.15
150 0.14
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.18
159 0.22
160 0.3
161 0.36
162 0.38
163 0.38
164 0.4
165 0.44
166 0.43
167 0.45
168 0.4
169 0.39
170 0.42
171 0.39
172 0.37
173 0.32
174 0.31
175 0.26
176 0.26
177 0.21
178 0.16
179 0.18
180 0.22
181 0.23
182 0.23
183 0.22
184 0.24
185 0.25
186 0.27
187 0.3
188 0.28
189 0.26
190 0.28
191 0.3
192 0.31
193 0.3
194 0.28
195 0.25
196 0.25
197 0.25
198 0.23
199 0.26
200 0.28
201 0.34
202 0.39
203 0.42
204 0.43
205 0.46
206 0.46
207 0.43
208 0.38
209 0.36
210 0.32
211 0.31
212 0.32
213 0.28
214 0.27
215 0.27
216 0.27
217 0.25
218 0.24
219 0.2
220 0.25
221 0.3
222 0.3
223 0.27
224 0.26
225 0.26
226 0.25
227 0.25
228 0.24
229 0.2
230 0.19
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.17
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.23
243 0.28
244 0.36
245 0.41
246 0.49
247 0.5
248 0.59
249 0.65
250 0.67
251 0.7
252 0.67
253 0.66
254 0.63
255 0.63
256 0.56
257 0.5
258 0.46
259 0.36
260 0.31
261 0.25
262 0.22
263 0.15
264 0.13
265 0.1
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.12
274 0.16
275 0.16
276 0.2
277 0.21
278 0.2
279 0.21
280 0.23
281 0.23
282 0.2
283 0.19
284 0.17
285 0.16
286 0.16
287 0.14
288 0.14
289 0.11
290 0.11
291 0.17
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.18
297 0.2
298 0.22
299 0.19
300 0.25
301 0.24
302 0.24
303 0.25
304 0.26
305 0.3
306 0.28
307 0.28
308 0.29
309 0.3
310 0.3
311 0.31
312 0.3
313 0.25
314 0.27
315 0.28
316 0.22
317 0.23
318 0.22
319 0.2
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.1
324 0.1
325 0.08
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.14
330 0.17
331 0.2
332 0.22
333 0.25
334 0.3
335 0.33
336 0.34
337 0.37
338 0.37
339 0.38
340 0.39
341 0.36
342 0.3
343 0.28
344 0.25