Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VBG3

Protein Details
Accession A0A1Y1VBG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-37SLGFLPRKRAARHRGKVKTFPKDDSHydrophilic
113-140DEVKRRFYKNWYHSKKKAFTKYAKKYAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-31PRKRAARHRGKVKT
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 8, nucl 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045077  L3_arc_euk  
IPR000597  Ribosomal_L3  
IPR019926  Ribosomal_L3_CS  
IPR044892  Ribosomal_L3_dom_3_arc_sf  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:1990145  P:maintenance of translational fidelity  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00297  Ribosomal_L3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00474  RIBOSOMAL_L3  
Amino Acid Sequences MSHRKYECPRHGSLGFLPRKRAARHRGKVKTFPKDDSKKNVHLTAFLGYKAGMTHVVRDVERPGSKLNKTEEVVEAVTIIETPPMVIVGVVGYIETPRGLRSLTTVWSEHLSDEVKRRFYKNWYHSKKKAFTKYAKKYAEAAKPIERELERIKKYCTVVRVLAHTQIRKVSVGQKKAHLMEIQLNGGSIADKVDFAKANFEKTIDIKSVFAEGEVIDTIAVTKGHGYEGVTHRWGTTRLPRKTHRGLRKVACIGAWHPSHVMFSVARSGQDGYHHRTEMNKKIYRIANGSDAKSASTEFDITEKKITPLGGFPHYGIVNEDFVMIKGSCPGVKKRVITLRKSVLTYASRAAAESINLKFIDTASKFGHGRFQTAEEKDAFMGTLKKDIEKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.56
3 0.53
4 0.54
5 0.53
6 0.59
7 0.61
8 0.64
9 0.64
10 0.67
11 0.73
12 0.79
13 0.83
14 0.84
15 0.88
16 0.88
17 0.88
18 0.82
19 0.8
20 0.8
21 0.78
22 0.78
23 0.78
24 0.76
25 0.74
26 0.74
27 0.73
28 0.63
29 0.56
30 0.5
31 0.45
32 0.39
33 0.3
34 0.25
35 0.18
36 0.18
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.16
42 0.19
43 0.23
44 0.22
45 0.24
46 0.26
47 0.28
48 0.29
49 0.28
50 0.3
51 0.34
52 0.37
53 0.41
54 0.43
55 0.42
56 0.42
57 0.43
58 0.39
59 0.35
60 0.32
61 0.26
62 0.21
63 0.14
64 0.13
65 0.1
66 0.08
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.1
89 0.12
90 0.15
91 0.18
92 0.18
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.24
101 0.27
102 0.31
103 0.33
104 0.36
105 0.38
106 0.43
107 0.51
108 0.53
109 0.59
110 0.63
111 0.7
112 0.75
113 0.8
114 0.81
115 0.8
116 0.81
117 0.78
118 0.79
119 0.8
120 0.83
121 0.83
122 0.77
123 0.69
124 0.65
125 0.64
126 0.61
127 0.54
128 0.48
129 0.44
130 0.42
131 0.41
132 0.41
133 0.33
134 0.29
135 0.32
136 0.38
137 0.35
138 0.36
139 0.38
140 0.38
141 0.4
142 0.4
143 0.35
144 0.3
145 0.3
146 0.29
147 0.32
148 0.28
149 0.31
150 0.32
151 0.3
152 0.27
153 0.25
154 0.25
155 0.21
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.33
160 0.34
161 0.36
162 0.39
163 0.39
164 0.39
165 0.31
166 0.26
167 0.25
168 0.24
169 0.21
170 0.17
171 0.16
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.18
191 0.13
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.11
215 0.14
216 0.18
217 0.18
218 0.18
219 0.18
220 0.19
221 0.2
222 0.17
223 0.24
224 0.31
225 0.36
226 0.43
227 0.47
228 0.55
229 0.63
230 0.69
231 0.7
232 0.68
233 0.71
234 0.69
235 0.72
236 0.66
237 0.57
238 0.48
239 0.4
240 0.33
241 0.32
242 0.27
243 0.19
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.15
248 0.16
249 0.09
250 0.09
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.19
258 0.23
259 0.25
260 0.28
261 0.29
262 0.28
263 0.34
264 0.41
265 0.44
266 0.49
267 0.48
268 0.45
269 0.52
270 0.55
271 0.52
272 0.49
273 0.42
274 0.41
275 0.4
276 0.41
277 0.36
278 0.32
279 0.28
280 0.25
281 0.23
282 0.15
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.14
287 0.16
288 0.17
289 0.2
290 0.19
291 0.19
292 0.21
293 0.21
294 0.18
295 0.2
296 0.23
297 0.22
298 0.22
299 0.22
300 0.24
301 0.23
302 0.22
303 0.21
304 0.18
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.11
309 0.11
310 0.14
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.18
317 0.23
318 0.27
319 0.33
320 0.36
321 0.42
322 0.51
323 0.57
324 0.59
325 0.62
326 0.64
327 0.63
328 0.62
329 0.55
330 0.52
331 0.47
332 0.43
333 0.37
334 0.31
335 0.27
336 0.25
337 0.26
338 0.2
339 0.19
340 0.2
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.17
346 0.17
347 0.24
348 0.21
349 0.24
350 0.23
351 0.28
352 0.29
353 0.29
354 0.38
355 0.3
356 0.32
357 0.3
358 0.34
359 0.37
360 0.39
361 0.42
362 0.35
363 0.36
364 0.32
365 0.3
366 0.25
367 0.19
368 0.21
369 0.18
370 0.23
371 0.23
372 0.28