FuNGI

A0A1Y1UTS2

Protein Details

Accession

A0A1Y1UTS2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
569-588	NDNRLKNRRYRDYKLLEKLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 7, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5

Amino Acid Sequences

MYLKFDLYNNEELERLSILISNKNELTDNTTSYILDPQLPCKQCKKVIECPGHLGRIPIYQYIVHPLFVNTLCKELTHICPICKKYNASLKIKSSCCNKRITSTTFSLHKFKIKSTNSNGKLNKKNEIRFQSEYAFSFGNQWFSVGKMYELIPTFDFSNNPEIKNKLLKVFIRNIPVLPINMRPSIMDSNNIIIHNNITSMYIRLLDLNHQFQSDTNLISYSGYGLRVYNLYKKILGIHNSTDITENSDKNFIKQILSGKTGIFRSMCLAKRQNFCLRSVIVPNINIPLDKILIPKVFTDQLIPYGYKPNDYVIINRQPTLQTTSILSVRSFPSNSRTIQINPLIANVFQADFDGDEMNIFWLPGKESKKELATKLNISNNIRSFKDGSLMISFIQDTLTGLYNMTNDQHVVEPHIIENICEKLKVSKKEWNIFCKFYKSRMKTNKIPYKHLLSLLLPKTLTLKNGNEILVDRGILLHTINGENQKILLNSITHYGNDYYLKFMWDVQRIVHEYNLFHIISISILDCIPEPSIEHEFKCILENIPDFFLPTLSLSNLDSSILNQSKSINDNRLKNRRYRDYKLLEKLSESINNHLTNIVSSGSKGKIDNIIQILMSVGVQAVLPKCYIKSSYFVGLTAKELFVHSKSGRVGIISTSLNTSSTGYLQRELVKSMEDLITDKTGVVHDYNGDEIYDYPFSTNIPDINDSFLEYAFAMSLTNNNNNNNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.17
3	0.12
4	0.14
5	0.15
6	0.22
7	0.23
8	0.26
9	0.26
10	0.27
11	0.28
12	0.25
13	0.3
14	0.27
15	0.28
16	0.25
17	0.25
18	0.24
19	0.24
20	0.27
21	0.21
22	0.24
23	0.23
24	0.27
25	0.35
26	0.39
27	0.42
28	0.46
29	0.52
30	0.53
31	0.62
32	0.63
33	0.64
34	0.71
35	0.75
36	0.72
37	0.72
38	0.7
39	0.65
40	0.57
41	0.49
42	0.41
43	0.37
44	0.35
45	0.28
46	0.25
47	0.22
48	0.23
49	0.29
50	0.28
51	0.23
52	0.22
53	0.21
54	0.24
55	0.24
56	0.28
57	0.2
58	0.22
59	0.21
60	0.2
61	0.23
62	0.22
63	0.25
64	0.3
65	0.33
66	0.34
67	0.42
68	0.48
69	0.51
70	0.53
71	0.51
72	0.5
73	0.57
74	0.62
75	0.62
76	0.65
77	0.66
78	0.69
79	0.69
80	0.66
81	0.66
82	0.67
83	0.63
84	0.63
85	0.57
86	0.57
87	0.61
88	0.61
89	0.57
90	0.52
91	0.55
92	0.53
93	0.54
94	0.52
95	0.48
96	0.49
97	0.45
98	0.45
99	0.49
100	0.49
101	0.54
102	0.58
103	0.66
104	0.64
105	0.71
106	0.73
107	0.73
108	0.76
109	0.7
110	0.7
111	0.68
112	0.69
113	0.69
114	0.7
115	0.67
116	0.62
117	0.62
118	0.56
119	0.51
120	0.46
121	0.39
122	0.32
123	0.25
124	0.26
125	0.23
126	0.22
127	0.19
128	0.19
129	0.16
130	0.17
131	0.19
132	0.14
133	0.13
134	0.12
135	0.12
136	0.16
137	0.16
138	0.17
139	0.15
140	0.16
141	0.18
142	0.17
143	0.17
144	0.15
145	0.23
146	0.24
147	0.25
148	0.27
149	0.27
150	0.3
151	0.36
152	0.37
153	0.32
154	0.36
155	0.38
156	0.41
157	0.48
158	0.48
159	0.46
160	0.45
161	0.41
162	0.38
163	0.35
164	0.3
165	0.24
166	0.24
167	0.22
168	0.22
169	0.22
170	0.19
171	0.22
172	0.26
173	0.24
174	0.22
175	0.2
176	0.22
177	0.24
178	0.24
179	0.2
180	0.15
181	0.15
182	0.13
183	0.12
184	0.1
185	0.08
186	0.09
187	0.09
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.14
194	0.18
195	0.21
196	0.2
197	0.2
198	0.2
199	0.19
200	0.24
201	0.2
202	0.16
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.11
215	0.13
216	0.18
217	0.19
218	0.2
219	0.2
220	0.2
221	0.24
222	0.27
223	0.29
224	0.26
225	0.25
226	0.28
227	0.28
228	0.28
229	0.25
230	0.2
231	0.22
232	0.22
233	0.21
234	0.18
235	0.24
236	0.24
237	0.23
238	0.28
239	0.23
240	0.21
241	0.23
242	0.28
243	0.25
244	0.28
245	0.27
246	0.23
247	0.26
248	0.25
249	0.24
250	0.18
251	0.14
252	0.15
253	0.21
254	0.23
255	0.26
256	0.32
257	0.37
258	0.41
259	0.47
260	0.52
261	0.47
262	0.46
263	0.44
264	0.38
265	0.34
266	0.32
267	0.3
268	0.24
269	0.22
270	0.21
271	0.19
272	0.18
273	0.15
274	0.13
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.15
284	0.15
285	0.14
286	0.15
287	0.12
288	0.14
289	0.15
290	0.15
291	0.14
292	0.2
293	0.2
294	0.19
295	0.19
296	0.17
297	0.19
298	0.19
299	0.2
300	0.2
301	0.28
302	0.27
303	0.27
304	0.27
305	0.24
306	0.25
307	0.28
308	0.22
309	0.14
310	0.15
311	0.16
312	0.17
313	0.17
314	0.16
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.15
319	0.13
320	0.16
321	0.19
322	0.2
323	0.2
324	0.21
325	0.2
326	0.24
327	0.25
328	0.23
329	0.19
330	0.2
331	0.18
332	0.15
333	0.14
334	0.1
335	0.08
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.11
352	0.14
353	0.15
354	0.17
355	0.19
356	0.24
357	0.27
358	0.28
359	0.3
360	0.31
361	0.33
362	0.36
363	0.37
364	0.37
365	0.36
366	0.38
367	0.35
368	0.35
369	0.31
370	0.28
371	0.27
372	0.22
373	0.23
374	0.18
375	0.16
376	0.14
377	0.14
378	0.12
379	0.1
380	0.1
381	0.07
382	0.07
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.07
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.12
403	0.11
404	0.1
405	0.11
406	0.12
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.16
411	0.23
412	0.28
413	0.3
414	0.35
415	0.42
416	0.51
417	0.56
418	0.58
419	0.56
420	0.55
421	0.53
422	0.54
423	0.49
424	0.48
425	0.53
426	0.49
427	0.55
428	0.61
429	0.66
430	0.66
431	0.75
432	0.76
433	0.7
434	0.71
435	0.65
436	0.62
437	0.57
438	0.5
439	0.42
440	0.34
441	0.38
442	0.34
443	0.31
444	0.24
445	0.21
446	0.24
447	0.23
448	0.24
449	0.2
450	0.2
451	0.21
452	0.23
453	0.23
454	0.2
455	0.2
456	0.19
457	0.15
458	0.13
459	0.1
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.05
465	0.06
466	0.07
467	0.08
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.13
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.09
477	0.1
478	0.13
479	0.13
480	0.11
481	0.13
482	0.13
483	0.13
484	0.15
485	0.15
486	0.15
487	0.15
488	0.16
489	0.14
490	0.17
491	0.2
492	0.22
493	0.22
494	0.2
495	0.25
496	0.26
497	0.27
498	0.26
499	0.22
500	0.18
501	0.2
502	0.23
503	0.17
504	0.15
505	0.14
506	0.12
507	0.1
508	0.11
509	0.09
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.11
519	0.16
520	0.18
521	0.18
522	0.19
523	0.2
524	0.2
525	0.22
526	0.19
527	0.15
528	0.17
529	0.19
530	0.18
531	0.19
532	0.18
533	0.17
534	0.15
535	0.14
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.17
548	0.18
549	0.18
550	0.17
551	0.18
552	0.21
553	0.25
554	0.29
555	0.3
556	0.34
557	0.43
558	0.53
559	0.62
560	0.63
561	0.66
562	0.71
563	0.73
564	0.76
565	0.75
566	0.75
567	0.74
568	0.79
569	0.8
570	0.77
571	0.67
572	0.6
573	0.55
574	0.48
575	0.46
576	0.38
577	0.33
578	0.33
579	0.32
580	0.3
581	0.29
582	0.25
583	0.19
584	0.19
585	0.15
586	0.09
587	0.1
588	0.13
589	0.14
590	0.16
591	0.16
592	0.17
593	0.23
594	0.24
595	0.29
596	0.27
597	0.26
598	0.24
599	0.23
600	0.21
601	0.15
602	0.13
603	0.07
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.07
608	0.08
609	0.09
610	0.1
611	0.11
612	0.12
613	0.14
614	0.18
615	0.17
616	0.19
617	0.22
618	0.28
619	0.27
620	0.28
621	0.27
622	0.25
623	0.26
624	0.24
625	0.21
626	0.15
627	0.16
628	0.18
629	0.17
630	0.23
631	0.21
632	0.24
633	0.25
634	0.26
635	0.26
636	0.24
637	0.23
638	0.17
639	0.21
640	0.17
641	0.17
642	0.17
643	0.17
644	0.16
645	0.16
646	0.16
647	0.13
648	0.16
649	0.2
650	0.2
651	0.22
652	0.24
653	0.29
654	0.29
655	0.3
656	0.28
657	0.24
658	0.22
659	0.24
660	0.22
661	0.17
662	0.17
663	0.18
664	0.19
665	0.17
666	0.17
667	0.14
668	0.14
669	0.15
670	0.15
671	0.13
672	0.13
673	0.15
674	0.16
675	0.16
676	0.15
677	0.13
678	0.13
679	0.16
680	0.15
681	0.14
682	0.13
683	0.13
684	0.13
685	0.16
686	0.17
687	0.15
688	0.18
689	0.21
690	0.21
691	0.24
692	0.24
693	0.23
694	0.22
695	0.2
696	0.17
697	0.13
698	0.13
699	0.09
700	0.09
701	0.07
702	0.07
703	0.12
704	0.16
705	0.24
706	0.28

A0A1Y1UTS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer