Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VM39

Protein Details
Accession A0A1Y1VM39    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31FNGISDTSNRKNKKKAKRDSQLIATDLHydrophilic
77-136QSLPRHLRRRAASHNIKRIPLEFRKKAYWERKNDPNPKLPPQKPKNRKDKRKSGTIVDEYHydrophilic
667-691SSKSEYNKWLNSKKKDKQENSSIYNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-22RKNKKKAKR
82-128HLRRRAASHNIKRIPLEFRKKAYWERKNDPNPKLPPQKPKNRKDKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MKRNFNGISDTSNRKNKKKAKRDSQLIATDLNNSLISEAPRNVDIVQFAEARSFELNAIESALKNATENTGNQRVFQSLPRHLRRRAASHNIKRIPLEFRKKAYWERKNDPNPKLPPQKPKNRKDKRKSGTIVDEYNRRSLNVKWLETHVWHSKRMKMDEKWGYKIAEYPREKGRKIIYKDEKCTCLLHDASYYQCVEINGSVNDIKNIFNTIIDLSIPSVTSNRYIKGNKIGSTKIYEFKKYPFNTITPVTFFWKEVAEDKLNDKRTMWLWVHPSSCQDVLKEINIAKNELHINEVNINLIRDEIVMFQLAGPRSHAILQETLSLCSSTENEEINEKAHKTWENLKYLRTPASLPAGIILGLTVYDPRLKSFRKMEKRNSEIPEQDQQLINEICNHWPENVARSNIWNSELRESLKNNKCTEDSLNKRRSDSLVPGTPLEPLKSDSRIPILLAQRGATNYLINTDKQSQELLYGWNIYIPKSWAMAFFKPLVFAGARVIGLKNIYELYFESSIPCYPYDYIETKSYNEYIKEKSSKEEEEYNKKPLSKRPNYQKLGIMSPFKPPFEAYLSIIKQQNQKNDTLPLWVINTPKLIKLIFEEISIESNSFDNLQEKFYSEIVNQYKDHDIDINKDVIQQNNSLINGFIRVSIDILGKGVINDNSIIYLSSKSEYNKWLNSKKKDKQENSSIYNVGEFPSSTLIIGFVTTGHYSLNNAHAKAIGACSVIGLKEMIQNNKSNNYKHSTFVLVRDPKGQVVRPAVLSLIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.72
3 0.75
4 0.79
5 0.82
6 0.85
7 0.87
8 0.9
9 0.92
10 0.9
11 0.89
12 0.84
13 0.75
14 0.67
15 0.57
16 0.49
17 0.4
18 0.33
19 0.24
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.19
26 0.19
27 0.19
28 0.21
29 0.2
30 0.19
31 0.19
32 0.16
33 0.18
34 0.16
35 0.16
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.16
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.15
55 0.18
56 0.24
57 0.32
58 0.32
59 0.33
60 0.34
61 0.33
62 0.33
63 0.37
64 0.37
65 0.37
66 0.47
67 0.55
68 0.61
69 0.64
70 0.7
71 0.7
72 0.71
73 0.71
74 0.72
75 0.73
76 0.76
77 0.82
78 0.79
79 0.75
80 0.69
81 0.63
82 0.61
83 0.6
84 0.6
85 0.57
86 0.57
87 0.6
88 0.64
89 0.7
90 0.72
91 0.71
92 0.7
93 0.71
94 0.77
95 0.81
96 0.85
97 0.82
98 0.8
99 0.78
100 0.79
101 0.82
102 0.78
103 0.79
104 0.8
105 0.84
106 0.85
107 0.88
108 0.89
109 0.9
110 0.93
111 0.93
112 0.94
113 0.9
114 0.9
115 0.85
116 0.83
117 0.81
118 0.76
119 0.73
120 0.66
121 0.66
122 0.57
123 0.58
124 0.49
125 0.4
126 0.36
127 0.31
128 0.37
129 0.37
130 0.37
131 0.34
132 0.37
133 0.4
134 0.39
135 0.44
136 0.43
137 0.38
138 0.43
139 0.45
140 0.46
141 0.5
142 0.56
143 0.57
144 0.52
145 0.59
146 0.62
147 0.64
148 0.63
149 0.6
150 0.53
151 0.45
152 0.47
153 0.44
154 0.44
155 0.41
156 0.4
157 0.46
158 0.52
159 0.52
160 0.52
161 0.54
162 0.53
163 0.56
164 0.63
165 0.64
166 0.66
167 0.73
168 0.73
169 0.67
170 0.59
171 0.55
172 0.45
173 0.41
174 0.33
175 0.27
176 0.23
177 0.22
178 0.22
179 0.23
180 0.22
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.21
213 0.23
214 0.26
215 0.34
216 0.38
217 0.37
218 0.39
219 0.4
220 0.36
221 0.4
222 0.4
223 0.37
224 0.36
225 0.36
226 0.34
227 0.36
228 0.42
229 0.38
230 0.41
231 0.38
232 0.36
233 0.36
234 0.37
235 0.35
236 0.28
237 0.28
238 0.27
239 0.24
240 0.23
241 0.2
242 0.18
243 0.17
244 0.17
245 0.2
246 0.18
247 0.19
248 0.23
249 0.3
250 0.32
251 0.32
252 0.3
253 0.28
254 0.27
255 0.32
256 0.28
257 0.26
258 0.28
259 0.31
260 0.32
261 0.3
262 0.3
263 0.27
264 0.28
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.17
270 0.18
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.15
279 0.17
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.09
288 0.09
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.13
325 0.11
326 0.14
327 0.15
328 0.17
329 0.25
330 0.3
331 0.36
332 0.36
333 0.38
334 0.38
335 0.39
336 0.38
337 0.3
338 0.25
339 0.19
340 0.22
341 0.2
342 0.16
343 0.15
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.12
357 0.13
358 0.17
359 0.26
360 0.36
361 0.45
362 0.53
363 0.61
364 0.67
365 0.71
366 0.74
367 0.69
368 0.63
369 0.55
370 0.5
371 0.46
372 0.38
373 0.34
374 0.27
375 0.23
376 0.24
377 0.21
378 0.18
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.15
388 0.18
389 0.18
390 0.17
391 0.18
392 0.2
393 0.18
394 0.2
395 0.19
396 0.17
397 0.18
398 0.2
399 0.2
400 0.21
401 0.23
402 0.31
403 0.35
404 0.39
405 0.38
406 0.38
407 0.37
408 0.36
409 0.4
410 0.39
411 0.41
412 0.45
413 0.52
414 0.5
415 0.51
416 0.5
417 0.47
418 0.41
419 0.37
420 0.34
421 0.3
422 0.3
423 0.3
424 0.28
425 0.28
426 0.25
427 0.2
428 0.14
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.16
433 0.15
434 0.16
435 0.16
436 0.16
437 0.19
438 0.2
439 0.2
440 0.2
441 0.19
442 0.18
443 0.17
444 0.18
445 0.13
446 0.1
447 0.08
448 0.11
449 0.12
450 0.11
451 0.13
452 0.15
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.13
457 0.14
458 0.14
459 0.13
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.13
472 0.17
473 0.18
474 0.19
475 0.2
476 0.19
477 0.19
478 0.18
479 0.16
480 0.12
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.14
503 0.12
504 0.11
505 0.13
506 0.16
507 0.17
508 0.19
509 0.22
510 0.23
511 0.23
512 0.25
513 0.25
514 0.23
515 0.23
516 0.24
517 0.23
518 0.29
519 0.33
520 0.32
521 0.34
522 0.37
523 0.37
524 0.37
525 0.43
526 0.43
527 0.47
528 0.5
529 0.52
530 0.5
531 0.51
532 0.51
533 0.51
534 0.55
535 0.55
536 0.61
537 0.66
538 0.74
539 0.74
540 0.74
541 0.71
542 0.63
543 0.6
544 0.54
545 0.48
546 0.38
547 0.43
548 0.42
549 0.36
550 0.34
551 0.28
552 0.27
553 0.26
554 0.28
555 0.22
556 0.27
557 0.29
558 0.33
559 0.35
560 0.36
561 0.39
562 0.41
563 0.47
564 0.41
565 0.43
566 0.41
567 0.42
568 0.39
569 0.35
570 0.31
571 0.24
572 0.24
573 0.23
574 0.22
575 0.19
576 0.23
577 0.2
578 0.21
579 0.21
580 0.19
581 0.17
582 0.19
583 0.22
584 0.19
585 0.18
586 0.18
587 0.17
588 0.19
589 0.19
590 0.16
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.11
597 0.12
598 0.14
599 0.14
600 0.15
601 0.17
602 0.17
603 0.18
604 0.15
605 0.23
606 0.25
607 0.28
608 0.27
609 0.28
610 0.31
611 0.29
612 0.3
613 0.27
614 0.24
615 0.25
616 0.28
617 0.27
618 0.23
619 0.28
620 0.29
621 0.29
622 0.29
623 0.26
624 0.26
625 0.28
626 0.28
627 0.23
628 0.2
629 0.16
630 0.16
631 0.15
632 0.13
633 0.1
634 0.1
635 0.1
636 0.12
637 0.13
638 0.11
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.13
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.12
651 0.09
652 0.1
653 0.11
654 0.12
655 0.15
656 0.17
657 0.21
658 0.28
659 0.33
660 0.39
661 0.47
662 0.55
663 0.62
664 0.7
665 0.76
666 0.78
667 0.82
668 0.86
669 0.85
670 0.85
671 0.86
672 0.84
673 0.79
674 0.75
675 0.66
676 0.55
677 0.49
678 0.39
679 0.29
680 0.22
681 0.16
682 0.12
683 0.13
684 0.13
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.09
689 0.09
690 0.08
691 0.06
692 0.08
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.11
698 0.13
699 0.22
700 0.24
701 0.24
702 0.25
703 0.25
704 0.26
705 0.26
706 0.25
707 0.18
708 0.14
709 0.13
710 0.13
711 0.14
712 0.12
713 0.12
714 0.1
715 0.1
716 0.15
717 0.21
718 0.27
719 0.29
720 0.34
721 0.38
722 0.47
723 0.51
724 0.49
725 0.5
726 0.51
727 0.5
728 0.48
729 0.47
730 0.46
731 0.43
732 0.44
733 0.48
734 0.47
735 0.47
736 0.49
737 0.48
738 0.46
739 0.49
740 0.47
741 0.44
742 0.44
743 0.46
744 0.42
745 0.41