Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VEK4

Protein Details
Accession A0A1Y1VEK4    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-407SERKAKERDDLRRSRQKQREREMRLSHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-211KFKHKKMPRGPPS
370-401RRSSRHRDESESERKAKERDDLRRSRQKQRER
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSLASFLPKPKNQQLNTETIYDHSSIISDEIIGPPPYRQRKGFIPKTVEDFGNGGAFPEIHVVQYPLDMGRKKSMKTSSTKTLPLQVDKDGKIRYDSVLRQGHSENRIIHSQLKDIVPMEKHEFNARPNDEEIKKTTEKTQAALQAILEGRSKTSQGNLGKDKKSGASFVKYTPASRSTVGSRIIRMVEAPVDPMEPPKFKHKKMPRGPPSPPAPVLHSPPRKVSAEDQSNWVIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGIQDIQINPKFASFSEALSIADRHAREEVRLRANMQTKLAAKEKKEKEERLRMLAQRAREERAGLINNTSNEYENERRKERDVSESSSESESESDSGNGSPRSEHSYKERRSSRHRDESESERKAKERDDLRRSRQKQREREMRLSHMGQETKSKVMRKLGDRDISEKIALGLAQPTTSKESMYDQRLFNRSEGLSSGFGSEDSYNIYDKPLFAERSSNTIYRPKKTVSDDNFDSEAIEKIVSNKMGEGSRGFKGTDGTSSRSGPVQFEKESDPYELEKFLKNKRNHESSDDKGDEKRRRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.63
4 0.57
5 0.48
6 0.4
7 0.4
8 0.31
9 0.26
10 0.17
11 0.15
12 0.13
13 0.13
14 0.11
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.18
22 0.28
23 0.36
24 0.41
25 0.42
26 0.43
27 0.52
28 0.63
29 0.69
30 0.68
31 0.67
32 0.65
33 0.69
34 0.68
35 0.57
36 0.48
37 0.4
38 0.32
39 0.26
40 0.22
41 0.16
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.13
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.17
55 0.19
56 0.21
57 0.3
58 0.34
59 0.35
60 0.41
61 0.47
62 0.48
63 0.54
64 0.58
65 0.59
66 0.6
67 0.64
68 0.59
69 0.59
70 0.57
71 0.55
72 0.51
73 0.48
74 0.48
75 0.45
76 0.49
77 0.42
78 0.39
79 0.36
80 0.35
81 0.31
82 0.31
83 0.32
84 0.35
85 0.39
86 0.38
87 0.39
88 0.41
89 0.44
90 0.4
91 0.43
92 0.36
93 0.34
94 0.36
95 0.35
96 0.37
97 0.32
98 0.31
99 0.31
100 0.29
101 0.27
102 0.25
103 0.28
104 0.23
105 0.26
106 0.29
107 0.27
108 0.27
109 0.32
110 0.33
111 0.32
112 0.4
113 0.38
114 0.35
115 0.35
116 0.42
117 0.37
118 0.38
119 0.38
120 0.36
121 0.36
122 0.35
123 0.39
124 0.4
125 0.38
126 0.37
127 0.39
128 0.38
129 0.37
130 0.36
131 0.3
132 0.25
133 0.24
134 0.24
135 0.2
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.12
141 0.14
142 0.2
143 0.23
144 0.31
145 0.38
146 0.45
147 0.46
148 0.46
149 0.46
150 0.42
151 0.38
152 0.36
153 0.31
154 0.29
155 0.29
156 0.29
157 0.34
158 0.31
159 0.31
160 0.3
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.26
165 0.22
166 0.26
167 0.3
168 0.27
169 0.25
170 0.25
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.16
175 0.13
176 0.11
177 0.12
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.12
182 0.15
183 0.14
184 0.16
185 0.26
186 0.33
187 0.34
188 0.45
189 0.51
190 0.59
191 0.68
192 0.77
193 0.76
194 0.78
195 0.79
196 0.77
197 0.72
198 0.66
199 0.59
200 0.49
201 0.45
202 0.39
203 0.4
204 0.42
205 0.42
206 0.39
207 0.39
208 0.42
209 0.38
210 0.37
211 0.37
212 0.37
213 0.38
214 0.37
215 0.37
216 0.34
217 0.34
218 0.32
219 0.27
220 0.18
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.18
225 0.18
226 0.24
227 0.29
228 0.34
229 0.38
230 0.37
231 0.38
232 0.29
233 0.31
234 0.31
235 0.34
236 0.29
237 0.28
238 0.3
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.22
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.14
259 0.17
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.18
275 0.23
276 0.24
277 0.25
278 0.25
279 0.29
280 0.34
281 0.34
282 0.29
283 0.27
284 0.25
285 0.28
286 0.33
287 0.3
288 0.28
289 0.37
290 0.41
291 0.46
292 0.51
293 0.54
294 0.57
295 0.64
296 0.64
297 0.6
298 0.61
299 0.54
300 0.55
301 0.51
302 0.45
303 0.41
304 0.41
305 0.37
306 0.32
307 0.3
308 0.23
309 0.26
310 0.25
311 0.18
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.19
316 0.19
317 0.15
318 0.14
319 0.19
320 0.24
321 0.28
322 0.33
323 0.35
324 0.36
325 0.38
326 0.43
327 0.4
328 0.43
329 0.4
330 0.4
331 0.41
332 0.4
333 0.39
334 0.34
335 0.31
336 0.22
337 0.18
338 0.14
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.27
353 0.37
354 0.41
355 0.5
356 0.55
357 0.54
358 0.63
359 0.72
360 0.73
361 0.74
362 0.73
363 0.7
364 0.68
365 0.71
366 0.71
367 0.67
368 0.6
369 0.52
370 0.51
371 0.47
372 0.44
373 0.43
374 0.41
375 0.45
376 0.52
377 0.59
378 0.65
379 0.74
380 0.78
381 0.81
382 0.82
383 0.82
384 0.81
385 0.83
386 0.84
387 0.82
388 0.85
389 0.8
390 0.76
391 0.72
392 0.64
393 0.57
394 0.52
395 0.46
396 0.37
397 0.38
398 0.34
399 0.33
400 0.36
401 0.35
402 0.34
403 0.39
404 0.45
405 0.45
406 0.52
407 0.55
408 0.57
409 0.55
410 0.55
411 0.52
412 0.47
413 0.4
414 0.32
415 0.24
416 0.17
417 0.15
418 0.12
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.11
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.14
428 0.2
429 0.26
430 0.33
431 0.36
432 0.34
433 0.41
434 0.45
435 0.46
436 0.4
437 0.38
438 0.32
439 0.28
440 0.27
441 0.23
442 0.2
443 0.18
444 0.18
445 0.13
446 0.13
447 0.14
448 0.12
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.13
456 0.13
457 0.17
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.28
462 0.27
463 0.32
464 0.36
465 0.34
466 0.31
467 0.38
468 0.43
469 0.42
470 0.46
471 0.43
472 0.46
473 0.52
474 0.59
475 0.57
476 0.6
477 0.58
478 0.58
479 0.56
480 0.48
481 0.41
482 0.32
483 0.26
484 0.18
485 0.15
486 0.1
487 0.12
488 0.17
489 0.17
490 0.17
491 0.17
492 0.2
493 0.21
494 0.22
495 0.23
496 0.22
497 0.24
498 0.25
499 0.24
500 0.21
501 0.23
502 0.22
503 0.27
504 0.27
505 0.29
506 0.3
507 0.32
508 0.32
509 0.33
510 0.33
511 0.3
512 0.33
513 0.34
514 0.32
515 0.33
516 0.36
517 0.36
518 0.37
519 0.35
520 0.31
521 0.28
522 0.29
523 0.3
524 0.28
525 0.31
526 0.35
527 0.42
528 0.49
529 0.53
530 0.6
531 0.66
532 0.73
533 0.7
534 0.72
535 0.71
536 0.68
537 0.71
538 0.65
539 0.58
540 0.57
541 0.62