Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V8W4

Protein Details
Accession A0A1Y1V8W4    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-223TPEEAPKSKKRKGPKQPNPLSCKKKKVNPNNQQQQKKKINEDHydrophilic
233-266EVENTEVEKPKKKRRRRTKKKKNNNVEANNDTNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-207PKSKKRKGPKQPNPLSCKKKK
241-254KPKKKRRRRTKKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd08553  PIN_Fcf1-like  
Amino Acid Sequences MRLKRQKTYKKYMGVYQHSFGFREPYQIIVDGNFIKVAQNSRLDYKSMLQETVVGKTRIMTTNCVINELRSLGEDFMGAALAAKRLEKRRCPHGGNPVNAADCIKEILGDTNQFNYCVATQDLNLRDYLRRIPGVPLIYINRSVMILEPPSPATTNKVKEIEYNKTIPNNYENAIIKNNTDTPEEAPKSKKRKGPKQPNPLSCKKKKVNPNNQQQQKKKINEDEKKEEEEVAEVENTEVEKPKKKRRRRTKKKKNNNVEANNDTNNEINQKNENEEEEDNDEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.72
3 0.64
4 0.61
5 0.53
6 0.5
7 0.42
8 0.38
9 0.3
10 0.31
11 0.28
12 0.25
13 0.25
14 0.25
15 0.24
16 0.19
17 0.22
18 0.16
19 0.16
20 0.14
21 0.12
22 0.13
23 0.15
24 0.18
25 0.19
26 0.23
27 0.25
28 0.3
29 0.32
30 0.31
31 0.31
32 0.31
33 0.34
34 0.31
35 0.29
36 0.23
37 0.27
38 0.27
39 0.31
40 0.32
41 0.24
42 0.22
43 0.24
44 0.28
45 0.29
46 0.29
47 0.27
48 0.24
49 0.3
50 0.3
51 0.32
52 0.28
53 0.22
54 0.23
55 0.2
56 0.18
57 0.13
58 0.14
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.13
72 0.21
73 0.28
74 0.36
75 0.41
76 0.49
77 0.57
78 0.61
79 0.63
80 0.66
81 0.67
82 0.61
83 0.6
84 0.52
85 0.45
86 0.39
87 0.33
88 0.22
89 0.14
90 0.12
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.14
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.18
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.13
141 0.18
142 0.19
143 0.22
144 0.24
145 0.24
146 0.28
147 0.33
148 0.35
149 0.33
150 0.33
151 0.31
152 0.32
153 0.33
154 0.29
155 0.27
156 0.22
157 0.2
158 0.22
159 0.21
160 0.2
161 0.22
162 0.21
163 0.19
164 0.19
165 0.2
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.25
171 0.26
172 0.27
173 0.31
174 0.37
175 0.44
176 0.5
177 0.53
178 0.55
179 0.64
180 0.72
181 0.78
182 0.8
183 0.84
184 0.87
185 0.91
186 0.89
187 0.88
188 0.87
189 0.83
190 0.82
191 0.78
192 0.77
193 0.78
194 0.81
195 0.82
196 0.82
197 0.86
198 0.86
199 0.89
200 0.91
201 0.87
202 0.86
203 0.85
204 0.81
205 0.78
206 0.78
207 0.79
208 0.78
209 0.79
210 0.78
211 0.73
212 0.71
213 0.63
214 0.54
215 0.43
216 0.36
217 0.28
218 0.2
219 0.15
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.15
226 0.17
227 0.26
228 0.34
229 0.45
230 0.55
231 0.65
232 0.75
233 0.81
234 0.89
235 0.92
236 0.95
237 0.96
238 0.97
239 0.98
240 0.98
241 0.98
242 0.97
243 0.96
244 0.94
245 0.91
246 0.86
247 0.8
248 0.72
249 0.62
250 0.52
251 0.43
252 0.35
253 0.32
254 0.26
255 0.24
256 0.27
257 0.28
258 0.31
259 0.32
260 0.33
261 0.33
262 0.33
263 0.34
264 0.32