Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VDT1

Protein Details
Accession A0A1Y1VDT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-139SESGIEHKRKKRKMDKYLNSSKLKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-128KRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
Amino Acid Sequences MHSGKDSNERLNERSKRLSITSATSKDISEELSLWNQICTDLLNLYNLHKEAETVVQKTNKYHDKINGKPELLNPKVAKKLIESYNRVIEKATKEQKEITKTKDNLDILIALQNNSESGIEHKRKKRKMDKYLNSSKLKSHDNKQYKPLSPGNLVVVKPPGQDWLLASVLQYFPDKNKYEVEDVEDDEDRPGIKKRYIFPVKCVLEIPNEDNQKPYFPIGHEVLSLYPNSSCFYKATIIKTPNEHKNSSNGKPAYIVRFEDDDEAEREVPADRVLDMPPKMKLKEDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.57
3 0.54
4 0.52
5 0.54
6 0.47
7 0.47
8 0.5
9 0.45
10 0.45
11 0.41
12 0.38
13 0.34
14 0.32
15 0.26
16 0.18
17 0.16
18 0.15
19 0.17
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.14
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.12
31 0.12
32 0.14
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.21
40 0.23
41 0.22
42 0.27
43 0.31
44 0.32
45 0.34
46 0.41
47 0.41
48 0.4
49 0.43
50 0.46
51 0.51
52 0.56
53 0.63
54 0.62
55 0.55
56 0.54
57 0.54
58 0.56
59 0.48
60 0.49
61 0.41
62 0.4
63 0.44
64 0.43
65 0.38
66 0.31
67 0.37
68 0.38
69 0.44
70 0.43
71 0.42
72 0.49
73 0.48
74 0.45
75 0.39
76 0.36
77 0.32
78 0.37
79 0.42
80 0.36
81 0.37
82 0.42
83 0.47
84 0.51
85 0.5
86 0.47
87 0.49
88 0.48
89 0.49
90 0.51
91 0.46
92 0.38
93 0.34
94 0.28
95 0.18
96 0.2
97 0.17
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.05
105 0.08
106 0.16
107 0.22
108 0.3
109 0.38
110 0.47
111 0.53
112 0.63
113 0.7
114 0.72
115 0.78
116 0.81
117 0.83
118 0.84
119 0.88
120 0.86
121 0.8
122 0.7
123 0.61
124 0.54
125 0.51
126 0.46
127 0.42
128 0.44
129 0.49
130 0.51
131 0.55
132 0.58
133 0.53
134 0.55
135 0.52
136 0.45
137 0.38
138 0.36
139 0.32
140 0.29
141 0.26
142 0.22
143 0.2
144 0.17
145 0.16
146 0.15
147 0.13
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.08
160 0.09
161 0.16
162 0.18
163 0.18
164 0.2
165 0.22
166 0.24
167 0.25
168 0.27
169 0.22
170 0.21
171 0.22
172 0.2
173 0.17
174 0.15
175 0.15
176 0.11
177 0.1
178 0.14
179 0.15
180 0.18
181 0.22
182 0.25
183 0.36
184 0.46
185 0.46
186 0.46
187 0.53
188 0.51
189 0.48
190 0.45
191 0.36
192 0.3
193 0.32
194 0.3
195 0.27
196 0.29
197 0.28
198 0.3
199 0.29
200 0.27
201 0.26
202 0.24
203 0.19
204 0.17
205 0.22
206 0.22
207 0.22
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.14
221 0.19
222 0.23
223 0.27
224 0.34
225 0.37
226 0.4
227 0.47
228 0.53
229 0.56
230 0.58
231 0.55
232 0.49
233 0.54
234 0.58
235 0.56
236 0.57
237 0.48
238 0.43
239 0.45
240 0.48
241 0.44
242 0.4
243 0.37
244 0.31
245 0.32
246 0.32
247 0.31
248 0.28
249 0.25
250 0.23
251 0.24
252 0.21
253 0.19
254 0.18
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.13
259 0.1
260 0.12
261 0.14
262 0.2
263 0.22
264 0.24
265 0.29
266 0.35
267 0.36