FuNGI

A0A1Y1VBS8

Protein Details

Accession

A0A1Y1VBS8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-49	SEDSSKLKWNSQRKNSTQKLQSFSIGMSHKKTPFQKHKEDLELKKQKD	Hydrophilic
114-134	SNNNEQNSKNKTKKRHLDSFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
430-447	HRKRGVKRGKLTSSHRRK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, mito_nucl 12, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR008942 ENTH_VHS IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR035009 SR140_RRM IPR000061 Surp IPR035967 SWAP/Surp_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID PF00076 RRM_1 PF01805 Surp
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50102 RRM PS50128 SURP
CDD	cd12223 RRM_SR140

Amino Acid Sequences

MSEDSSKLKWNSQRKNSTQKLQSFSIGMSHKKTPFQKHKEDLELKKQKDDEETAKVFAEFVASFEEETTVPKTWVKAKTVLNANNNISEENKLEEKDRIYQPQMKINLNKEKESNNNEQNSKNKTKKRHLDSFLEELKKEEELKAKLGKQNENNNYDEKLGSHDTGDLETTNLYIGNINPMVNEEMLCQKFAQYGPIASVKIMWPRTQEEKDRNRNCGFVSFMKREHAENALKDTDGKEFMNNVMHVGWSKAVPIPPKPIYELDKKMSLSTGLPFNAHVVAAPIANLANSPSSQSKERLEVQVVQPDDKELLMLIHRMIERVIKYGPDFEAIIMDREWNNPKFSFLFQNNSSEHVYYRWKLYSILQGDSKYDWRTESFSMFDEGPIWCPPLVPFNDEETEQFYLDSESSSSSSSDSDSSSDSDYGYSRIHRKRGVKRGKLTSSHRRKFQRILRNLNLERGSILNAMIFAIEHAEAADDIITILCNSLLIETTPIYPTKIARLYLISDILHNSSASAPNAWKYRTGFEPHLGNIIKHFNAIWKSIDARLKAEQIKQSILAILNTWEMWNIFSKDYIIDLKEKFQNDPKKEARKNIDSLESGNKRQKLDNWTNSTFILNNKYLNESNTSTLIVNEESIKDEEDDDDSVDGIPLENNYKSGWTRIDLKPQEEEEEEEEEDIDGVPLYLNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.85
3	0.86
4	0.88
5	0.86
6	0.83
7	0.79
8	0.71
9	0.65
10	0.56
11	0.47
12	0.44
13	0.4
14	0.36
15	0.35
16	0.39
17	0.39
18	0.46
19	0.54
20	0.58
21	0.64
22	0.69
23	0.75
24	0.76
25	0.8
26	0.83
27	0.85
28	0.82
29	0.82
30	0.83
31	0.75
32	0.73
33	0.68
34	0.6
35	0.57
36	0.56
37	0.51
38	0.49
39	0.5
40	0.44
41	0.42
42	0.39
43	0.32
44	0.25
45	0.22
46	0.13
47	0.11
48	0.14
49	0.13
50	0.13
51	0.13
52	0.15
53	0.12
54	0.14
55	0.17
56	0.14
57	0.15
58	0.17
59	0.2
60	0.26
61	0.33
62	0.34
63	0.39
64	0.42
65	0.49
66	0.57
67	0.62
68	0.6
69	0.61
70	0.59
71	0.55
72	0.51
73	0.44
74	0.35
75	0.3
76	0.25
77	0.22
78	0.23
79	0.19
80	0.21
81	0.24
82	0.25
83	0.31
84	0.36
85	0.38
86	0.42
87	0.48
88	0.5
89	0.54
90	0.57
91	0.56
92	0.56
93	0.58
94	0.62
95	0.58
96	0.58
97	0.53
98	0.54
99	0.55
100	0.56
101	0.57
102	0.55
103	0.59
104	0.59
105	0.61
106	0.62
107	0.63
108	0.65
109	0.65
110	0.65
111	0.68
112	0.75
113	0.8
114	0.82
115	0.83
116	0.8
117	0.79
118	0.77
119	0.76
120	0.73
121	0.66
122	0.56
123	0.48
124	0.43
125	0.36
126	0.31
127	0.27
128	0.26
129	0.25
130	0.3
131	0.35
132	0.39
133	0.41
134	0.46
135	0.51
136	0.52
137	0.6
138	0.63
139	0.61
140	0.57
141	0.56
142	0.51
143	0.44
144	0.36
145	0.26
146	0.23
147	0.21
148	0.19
149	0.17
150	0.17
151	0.17
152	0.17
153	0.17
154	0.12
155	0.1
156	0.09
157	0.08
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.1
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.13
169	0.12
170	0.13
171	0.09
172	0.16
173	0.16
174	0.17
175	0.16
176	0.15
177	0.17
178	0.17
179	0.19
180	0.13
181	0.13
182	0.15
183	0.18
184	0.18
185	0.15
186	0.16
187	0.15
188	0.2
189	0.21
190	0.2
191	0.21
192	0.25
193	0.33
194	0.37
195	0.42
196	0.46
197	0.55
198	0.64
199	0.66
200	0.69
201	0.63
202	0.59
203	0.53
204	0.46
205	0.39
206	0.36
207	0.38
208	0.34
209	0.34
210	0.36
211	0.36
212	0.34
213	0.32
214	0.31
215	0.28
216	0.26
217	0.29
218	0.26
219	0.25
220	0.25
221	0.23
222	0.19
223	0.17
224	0.16
225	0.13
226	0.13
227	0.14
228	0.17
229	0.16
230	0.14
231	0.12
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.11
240	0.14
241	0.16
242	0.23
243	0.25
244	0.26
245	0.27
246	0.29
247	0.31
248	0.36
249	0.39
250	0.34
251	0.36
252	0.35
253	0.33
254	0.29
255	0.26
256	0.19
257	0.16
258	0.17
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.13
263	0.12
264	0.11
265	0.09
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.07
278	0.08
279	0.11
280	0.13
281	0.16
282	0.17
283	0.21
284	0.23
285	0.24
286	0.24
287	0.26
288	0.25
289	0.27
290	0.26
291	0.22
292	0.2
293	0.18
294	0.16
295	0.12
296	0.1
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.05
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.09
306	0.11
307	0.11
308	0.12
309	0.12
310	0.1
311	0.11
312	0.12
313	0.13
314	0.11
315	0.11
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.08
321	0.09
322	0.08
323	0.11
324	0.16
325	0.15
326	0.17
327	0.16
328	0.18
329	0.18
330	0.19
331	0.23
332	0.21
333	0.25
334	0.23
335	0.28
336	0.27
337	0.28
338	0.28
339	0.22
340	0.2
341	0.17
342	0.2
343	0.16
344	0.18
345	0.16
346	0.15
347	0.16
348	0.18
349	0.22
350	0.21
351	0.23
352	0.22
353	0.22
354	0.23
355	0.23
356	0.23
357	0.17
358	0.15
359	0.14
360	0.13
361	0.16
362	0.16
363	0.16
364	0.14
365	0.14
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.1
373	0.11
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.15
381	0.17
382	0.18
383	0.18
384	0.19
385	0.16
386	0.16
387	0.15
388	0.13
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.07
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.13
414	0.21
415	0.26
416	0.3
417	0.36
418	0.45
419	0.53
420	0.63
421	0.7
422	0.71
423	0.74
424	0.79
425	0.79
426	0.78
427	0.76
428	0.76
429	0.77
430	0.74
431	0.74
432	0.71
433	0.7
434	0.71
435	0.72
436	0.72
437	0.7
438	0.74
439	0.72
440	0.75
441	0.71
442	0.68
443	0.6
444	0.49
445	0.4
446	0.31
447	0.26
448	0.16
449	0.15
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.06
455	0.04
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.05
463	0.05
464	0.03
465	0.03
466	0.04
467	0.04
468	0.03
469	0.04
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.06
477	0.06
478	0.08
479	0.09
480	0.1
481	0.11
482	0.12
483	0.12
484	0.17
485	0.2
486	0.19
487	0.19
488	0.21
489	0.22
490	0.23
491	0.25
492	0.19
493	0.16
494	0.17
495	0.16
496	0.15
497	0.13
498	0.11
499	0.11
500	0.13
501	0.13
502	0.14
503	0.14
504	0.18
505	0.22
506	0.22
507	0.24
508	0.24
509	0.27
510	0.3
511	0.35
512	0.33
513	0.34
514	0.37
515	0.33
516	0.39
517	0.36
518	0.31
519	0.28
520	0.29
521	0.25
522	0.22
523	0.21
524	0.19
525	0.21
526	0.23
527	0.22
528	0.2
529	0.22
530	0.27
531	0.32
532	0.28
533	0.29
534	0.3
535	0.35
536	0.37
537	0.4
538	0.4
539	0.38
540	0.38
541	0.35
542	0.33
543	0.29
544	0.25
545	0.2
546	0.16
547	0.14
548	0.13
549	0.12
550	0.12
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.13
555	0.14
556	0.14
557	0.14
558	0.15
559	0.15
560	0.17
561	0.19
562	0.16
563	0.2
564	0.2
565	0.26
566	0.3
567	0.31
568	0.33
569	0.39
570	0.47
571	0.47
572	0.55
573	0.59
574	0.65
575	0.69
576	0.75
577	0.75
578	0.73
579	0.73
580	0.69
581	0.66
582	0.56
583	0.54
584	0.54
585	0.5
586	0.49
587	0.51
588	0.51
589	0.47
590	0.49
591	0.53
592	0.53
593	0.58
594	0.62
595	0.63
596	0.61
597	0.6
598	0.57
599	0.52
600	0.43
601	0.37
602	0.34
603	0.28
604	0.28
605	0.28
606	0.32
607	0.32
608	0.32
609	0.34
610	0.29
611	0.3
612	0.28
613	0.28
614	0.23
615	0.22
616	0.22
617	0.17
618	0.15
619	0.15
620	0.14
621	0.16
622	0.16
623	0.17
624	0.16
625	0.16
626	0.16
627	0.16
628	0.16
629	0.14
630	0.13
631	0.12
632	0.12
633	0.11
634	0.1
635	0.08
636	0.08
637	0.09
638	0.12
639	0.13
640	0.13
641	0.14
642	0.18
643	0.19
644	0.22
645	0.24
646	0.24
647	0.31
648	0.36
649	0.46
650	0.48
651	0.5
652	0.52
653	0.51
654	0.52
655	0.46
656	0.45
657	0.37
658	0.35
659	0.32
660	0.26
661	0.24
662	0.19
663	0.17
664	0.14
665	0.11
666	0.07
667	0.06

A0A1Y1VBS8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer