Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V1H8

Protein Details
Accession A0A1Y1V1H8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-309TCDPPSFNNARKKGKRKRSLESSEYHydrophilic
398-422LENGIVRKPRAKKRNTNKDPIPTAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-302RKKGKRKR
404-411RKPRAKKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0000126  C:transcription factor TFIIIB complex  
GO:0000994  F:RNA polymerase III core binding  
GO:0000995  F:RNA polymerase III general transcription initiation factor activity  
GO:0001006  F:RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0001156  F:TFIIIC-class transcription factor complex binding  
GO:0001112  P:DNA-templated transcription open complex formation  
GO:0006359  P:regulation of transcription by RNA polymerase III  
GO:0070898  P:RNA polymerase III preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MSTNNCIHNLVEDEAMGHRVCTKCGQIMEENIIVSEVSFSEKSNGAAVADGFFISSGKARASIPNRFGGRNSMNTLESREQVIANGRRRIQQIANALNMTERHMEAAQRYYNLAILNDFNKGRKTVNVASACLYIVCRMEKTSHLLIDFSDVLQTNVYLLGATFLKLVQKLHLELPLVDPALYIARFASKLDFGDKSQVVIRDALRLVSRMNRDWIQTGRRPAGICAACLLIAARMHDFHRTQKEIISVVKICNSTLRKRLDEFRNTPSSELTIEDFQNIWLEETCDPPSFNNARKKGKRKRSLESSEYEKDFETEELKKEINDILKGDEIKELTGKIDMDELLADDNNLEVLDNDEEIKDVILNEEEVEFKTRVWTNENKDWIEAQEAKRRQAIMDLENGIVRKPRAKKRNTNKDPIPTAQTPAEAAKKLLNQTKISKKINYAAIDHLFEDSLKLKAEVEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.16
4 0.12
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.22
9 0.24
10 0.27
11 0.29
12 0.34
13 0.32
14 0.36
15 0.39
16 0.36
17 0.33
18 0.27
19 0.25
20 0.2
21 0.16
22 0.12
23 0.07
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.12
47 0.21
48 0.27
49 0.35
50 0.37
51 0.44
52 0.46
53 0.46
54 0.46
55 0.46
56 0.44
57 0.41
58 0.41
59 0.36
60 0.35
61 0.35
62 0.39
63 0.34
64 0.3
65 0.27
66 0.24
67 0.21
68 0.21
69 0.29
70 0.31
71 0.36
72 0.41
73 0.41
74 0.45
75 0.47
76 0.5
77 0.44
78 0.43
79 0.44
80 0.43
81 0.44
82 0.39
83 0.36
84 0.33
85 0.3
86 0.26
87 0.19
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.19
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.17
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.2
109 0.2
110 0.2
111 0.26
112 0.27
113 0.35
114 0.36
115 0.35
116 0.35
117 0.35
118 0.32
119 0.25
120 0.2
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.2
129 0.22
130 0.22
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.21
135 0.19
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.11
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.19
186 0.17
187 0.19
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.16
196 0.18
197 0.16
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.23
202 0.26
203 0.26
204 0.28
205 0.31
206 0.29
207 0.3
208 0.29
209 0.27
210 0.31
211 0.25
212 0.21
213 0.18
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.11
225 0.12
226 0.17
227 0.22
228 0.24
229 0.24
230 0.25
231 0.26
232 0.24
233 0.24
234 0.22
235 0.18
236 0.16
237 0.19
238 0.17
239 0.15
240 0.2
241 0.23
242 0.23
243 0.29
244 0.33
245 0.32
246 0.35
247 0.44
248 0.46
249 0.51
250 0.51
251 0.5
252 0.52
253 0.5
254 0.48
255 0.4
256 0.33
257 0.24
258 0.21
259 0.17
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.2
277 0.22
278 0.29
279 0.36
280 0.41
281 0.51
282 0.6
283 0.7
284 0.74
285 0.81
286 0.84
287 0.82
288 0.83
289 0.84
290 0.83
291 0.78
292 0.72
293 0.69
294 0.64
295 0.58
296 0.49
297 0.39
298 0.31
299 0.26
300 0.22
301 0.19
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.18
308 0.2
309 0.2
310 0.19
311 0.18
312 0.17
313 0.2
314 0.21
315 0.2
316 0.19
317 0.16
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.09
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.17
360 0.2
361 0.21
362 0.26
363 0.33
364 0.38
365 0.45
366 0.52
367 0.47
368 0.45
369 0.45
370 0.4
371 0.39
372 0.37
373 0.35
374 0.38
375 0.41
376 0.42
377 0.44
378 0.44
379 0.37
380 0.37
381 0.37
382 0.31
383 0.33
384 0.33
385 0.3
386 0.31
387 0.3
388 0.25
389 0.24
390 0.22
391 0.24
392 0.32
393 0.41
394 0.5
395 0.6
396 0.7
397 0.77
398 0.87
399 0.89
400 0.9
401 0.88
402 0.88
403 0.85
404 0.78
405 0.75
406 0.65
407 0.61
408 0.52
409 0.44
410 0.36
411 0.34
412 0.35
413 0.28
414 0.27
415 0.28
416 0.31
417 0.37
418 0.42
419 0.43
420 0.43
421 0.52
422 0.61
423 0.65
424 0.66
425 0.64
426 0.63
427 0.64
428 0.66
429 0.61
430 0.53
431 0.51
432 0.49
433 0.46
434 0.41
435 0.35
436 0.27
437 0.24
438 0.23
439 0.17
440 0.15
441 0.15
442 0.15