Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VED5

Protein Details
Accession A0A1Y1VED5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-212NQEYYKTKNFRKNAKKNFEQSLKHydrophilic
647-668NKLFIINKIKSKNKKLNSIDEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039495  TAF1A  
IPR007224  TIF_Rrn11  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000120  C:RNA polymerase I transcription regulator complex  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
PF14929  TAF1_subA  
Amino Acid Sequences MNKSVSKSKKPLFGTSIPGTSSMDFFDFQRRRYFKGYNKSQLLIILKELLQKKKFELATRVALIIFKDSDTSIEMLWKIGMEILRNKKNSNSYCQRFFNQLLSLNSSHNEEILLEYIFYCIKTEQYEEGINKLSEFIFLSPYKENSILVGYTGILYFILWEKSLPDNLVNKFQMFDSSNMDNDDKDEFVNQEYYKTKNFRKNAKKNFEQSLKLNPYNDFILQYYIKILVFEKNFEEAYVNLKNFCDINPNNIISLRLFLKFIKAYSPGDTKWIEVTENIIKIDNFCDRETIFLPLINHYFKLYYKAALKEGLKSYPSKTSSLHYIKLIEKLLVERLDFEIGNTQLWKKLSKALYIINEKYLDVDNNIWKSRRDWWKSFHFENKEIKFESTEDSEFFVYRAICSVYIYGKNVDLKSNYVYNISEKLETIIKDHGFTEKEIYPECSNKELKQYKNSYKNEIINGNIKDKSNKENYNNILEVKTILGRKVVPCLRNYIIRRKTSMTEIVDEKIKAYLERISYEVDCLNKVYSPNLLKNPEYQKDIYEFRDLVLSRLPKLKSFYKNYRNINVFQILINYGVSIFHLEFLDFEYKHPDEAKYFEILKDKLLKLDENQFKKLNPAVIFVKQNNNSGFITEDPLIENKNKNQENKLFIINKIKSKNKKLNSIDEEIVDNYIDLNSNLSKNDQEIDDINDLISQCHDICIKHSIPNYIIKYIFGIQYLTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.59
3 0.56
4 0.48
5 0.44
6 0.38
7 0.31
8 0.27
9 0.21
10 0.18
11 0.15
12 0.16
13 0.26
14 0.28
15 0.29
16 0.39
17 0.4
18 0.44
19 0.5
20 0.58
21 0.57
22 0.64
23 0.72
24 0.72
25 0.74
26 0.7
27 0.64
28 0.61
29 0.55
30 0.46
31 0.37
32 0.3
33 0.26
34 0.31
35 0.37
36 0.39
37 0.39
38 0.4
39 0.42
40 0.46
41 0.5
42 0.49
43 0.5
44 0.48
45 0.51
46 0.51
47 0.48
48 0.4
49 0.37
50 0.31
51 0.27
52 0.21
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.11
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.22
70 0.31
71 0.39
72 0.41
73 0.43
74 0.46
75 0.55
76 0.56
77 0.58
78 0.59
79 0.59
80 0.65
81 0.68
82 0.65
83 0.61
84 0.59
85 0.53
86 0.47
87 0.46
88 0.4
89 0.41
90 0.39
91 0.34
92 0.33
93 0.31
94 0.27
95 0.2
96 0.18
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.14
111 0.15
112 0.18
113 0.24
114 0.23
115 0.26
116 0.28
117 0.26
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.14
122 0.15
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.18
127 0.19
128 0.21
129 0.23
130 0.22
131 0.21
132 0.17
133 0.19
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.17
153 0.23
154 0.25
155 0.32
156 0.31
157 0.29
158 0.28
159 0.27
160 0.27
161 0.23
162 0.23
163 0.21
164 0.21
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.12
176 0.16
177 0.15
178 0.18
179 0.2
180 0.22
181 0.27
182 0.33
183 0.4
184 0.44
185 0.51
186 0.58
187 0.67
188 0.75
189 0.8
190 0.83
191 0.83
192 0.81
193 0.83
194 0.78
195 0.72
196 0.64
197 0.63
198 0.61
199 0.55
200 0.51
201 0.43
202 0.38
203 0.36
204 0.33
205 0.24
206 0.17
207 0.18
208 0.16
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.12
224 0.16
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.2
233 0.16
234 0.21
235 0.25
236 0.26
237 0.25
238 0.25
239 0.26
240 0.17
241 0.19
242 0.16
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.21
253 0.25
254 0.21
255 0.24
256 0.24
257 0.22
258 0.21
259 0.2
260 0.16
261 0.12
262 0.16
263 0.15
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.15
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.15
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.18
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.14
287 0.12
288 0.17
289 0.15
290 0.16
291 0.2
292 0.21
293 0.22
294 0.26
295 0.26
296 0.25
297 0.26
298 0.25
299 0.23
300 0.22
301 0.23
302 0.25
303 0.27
304 0.24
305 0.23
306 0.23
307 0.31
308 0.33
309 0.33
310 0.27
311 0.28
312 0.28
313 0.31
314 0.29
315 0.2
316 0.17
317 0.16
318 0.18
319 0.15
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.11
335 0.17
336 0.18
337 0.19
338 0.21
339 0.23
340 0.28
341 0.32
342 0.32
343 0.27
344 0.26
345 0.24
346 0.23
347 0.2
348 0.14
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.17
354 0.17
355 0.17
356 0.18
357 0.26
358 0.34
359 0.37
360 0.38
361 0.43
362 0.52
363 0.57
364 0.59
365 0.59
366 0.53
367 0.53
368 0.57
369 0.53
370 0.47
371 0.42
372 0.39
373 0.31
374 0.28
375 0.24
376 0.18
377 0.17
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.18
403 0.17
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.15
417 0.16
418 0.16
419 0.18
420 0.16
421 0.17
422 0.19
423 0.16
424 0.17
425 0.18
426 0.21
427 0.2
428 0.22
429 0.23
430 0.24
431 0.24
432 0.25
433 0.34
434 0.37
435 0.39
436 0.46
437 0.52
438 0.57
439 0.65
440 0.66
441 0.63
442 0.62
443 0.62
444 0.57
445 0.5
446 0.43
447 0.4
448 0.39
449 0.36
450 0.32
451 0.29
452 0.29
453 0.29
454 0.33
455 0.35
456 0.39
457 0.4
458 0.45
459 0.48
460 0.5
461 0.49
462 0.43
463 0.35
464 0.29
465 0.25
466 0.18
467 0.18
468 0.13
469 0.12
470 0.13
471 0.14
472 0.15
473 0.23
474 0.27
475 0.27
476 0.27
477 0.32
478 0.33
479 0.39
480 0.43
481 0.45
482 0.48
483 0.48
484 0.51
485 0.48
486 0.48
487 0.44
488 0.48
489 0.39
490 0.35
491 0.34
492 0.32
493 0.32
494 0.3
495 0.25
496 0.2
497 0.18
498 0.14
499 0.13
500 0.16
501 0.15
502 0.16
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.19
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.17
516 0.21
517 0.26
518 0.31
519 0.35
520 0.34
521 0.41
522 0.48
523 0.46
524 0.46
525 0.41
526 0.37
527 0.38
528 0.4
529 0.35
530 0.32
531 0.28
532 0.24
533 0.29
534 0.26
535 0.23
536 0.26
537 0.24
538 0.22
539 0.29
540 0.29
541 0.27
542 0.32
543 0.39
544 0.42
545 0.5
546 0.58
547 0.61
548 0.69
549 0.73
550 0.76
551 0.72
552 0.65
553 0.62
554 0.54
555 0.44
556 0.36
557 0.31
558 0.23
559 0.19
560 0.17
561 0.11
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.08
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.12
572 0.17
573 0.15
574 0.16
575 0.21
576 0.21
577 0.23
578 0.25
579 0.24
580 0.2
581 0.23
582 0.25
583 0.23
584 0.24
585 0.25
586 0.29
587 0.28
588 0.3
589 0.35
590 0.33
591 0.33
592 0.34
593 0.34
594 0.31
595 0.41
596 0.45
597 0.43
598 0.47
599 0.45
600 0.43
601 0.46
602 0.46
603 0.43
604 0.35
605 0.35
606 0.34
607 0.37
608 0.43
609 0.42
610 0.47
611 0.44
612 0.49
613 0.45
614 0.44
615 0.38
616 0.33
617 0.32
618 0.23
619 0.24
620 0.19
621 0.18
622 0.16
623 0.18
624 0.2
625 0.22
626 0.26
627 0.27
628 0.37
629 0.42
630 0.45
631 0.53
632 0.57
633 0.59
634 0.57
635 0.6
636 0.54
637 0.52
638 0.57
639 0.54
640 0.55
641 0.58
642 0.64
643 0.65
644 0.72
645 0.78
646 0.76
647 0.81
648 0.8
649 0.82
650 0.8
651 0.76
652 0.68
653 0.59
654 0.53
655 0.43
656 0.37
657 0.26
658 0.19
659 0.13
660 0.11
661 0.1
662 0.08
663 0.1
664 0.12
665 0.14
666 0.15
667 0.16
668 0.17
669 0.18
670 0.21
671 0.19
672 0.19
673 0.19
674 0.23
675 0.24
676 0.22
677 0.21
678 0.2
679 0.2
680 0.17
681 0.16
682 0.13
683 0.11
684 0.14
685 0.16
686 0.15
687 0.18
688 0.25
689 0.26
690 0.3
691 0.33
692 0.36
693 0.37
694 0.46
695 0.46
696 0.44
697 0.43
698 0.37
699 0.37
700 0.35
701 0.33
702 0.25