Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VH23

Protein Details
Accession A0A1Y1VH23    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-273INNSDNSRKRKRTNHMSEEEHydrophilic
393-418ISLDTPSKTKNQKNNKDNKIKNDDSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-213R
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MSSSIKNNKYHFFKLENDELNNNKIYIWTYWKLNIDNIENKNFNNNSEVFEIIISDGERLWNQTIKVKDILSYVKNIKEKDYYELMKKALSYTIQDKKEKFLYNWNLKDDISNFSIKLEISNSNNNSQNKFQYHLGNIDLLPIKKENKKKIYQLIYDDTINEYQKLKDENSLLSTANASLQKVQKEFSEQMEEIIKDKKKIEEFRELLNEKKRKIKNLMTTLKRKEEIINEYKRLNENQLNNSNEKVFGNNNEINNSDNSRKRKRTNHMSEEENEYEYEKDRLLNNKKSLKKGVNIDSKSNEKVVNEFNIDSNNDIDKFKNNNKKLNNNEDDDDTVTNNSSSNNNENNNMIKKENNSDSDSDISVLNLIPNIEVRTYTGSNKLPTLNNSVGLISLDTPSKTKNQKNNKDNKIKNDDSSTDDDIDKLLDMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.63
3 0.6
4 0.56
5 0.56
6 0.54
7 0.53
8 0.47
9 0.39
10 0.3
11 0.25
12 0.24
13 0.21
14 0.26
15 0.26
16 0.28
17 0.33
18 0.37
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.4
23 0.45
24 0.46
25 0.49
26 0.46
27 0.45
28 0.5
29 0.45
30 0.4
31 0.37
32 0.33
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.13
40 0.13
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.16
49 0.17
50 0.23
51 0.26
52 0.28
53 0.31
54 0.28
55 0.27
56 0.28
57 0.33
58 0.28
59 0.32
60 0.33
61 0.37
62 0.41
63 0.4
64 0.4
65 0.4
66 0.4
67 0.39
68 0.42
69 0.39
70 0.41
71 0.44
72 0.41
73 0.36
74 0.34
75 0.3
76 0.26
77 0.23
78 0.21
79 0.26
80 0.34
81 0.39
82 0.44
83 0.44
84 0.46
85 0.52
86 0.52
87 0.45
88 0.47
89 0.51
90 0.56
91 0.6
92 0.58
93 0.52
94 0.48
95 0.49
96 0.4
97 0.34
98 0.26
99 0.23
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.17
108 0.25
109 0.27
110 0.31
111 0.38
112 0.39
113 0.4
114 0.39
115 0.42
116 0.36
117 0.37
118 0.36
119 0.34
120 0.33
121 0.32
122 0.3
123 0.26
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.22
131 0.27
132 0.36
133 0.41
134 0.47
135 0.53
136 0.59
137 0.66
138 0.69
139 0.66
140 0.64
141 0.59
142 0.53
143 0.46
144 0.4
145 0.32
146 0.27
147 0.23
148 0.19
149 0.15
150 0.13
151 0.16
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.2
158 0.21
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.12
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.14
167 0.16
168 0.19
169 0.19
170 0.2
171 0.17
172 0.22
173 0.23
174 0.21
175 0.24
176 0.21
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.19
181 0.24
182 0.23
183 0.19
184 0.21
185 0.24
186 0.27
187 0.33
188 0.37
189 0.4
190 0.41
191 0.42
192 0.48
193 0.45
194 0.44
195 0.46
196 0.45
197 0.38
198 0.45
199 0.45
200 0.43
201 0.49
202 0.52
203 0.52
204 0.58
205 0.65
206 0.63
207 0.69
208 0.67
209 0.64
210 0.57
211 0.49
212 0.42
213 0.38
214 0.39
215 0.39
216 0.4
217 0.37
218 0.38
219 0.39
220 0.38
221 0.34
222 0.31
223 0.28
224 0.28
225 0.33
226 0.4
227 0.4
228 0.39
229 0.39
230 0.34
231 0.3
232 0.25
233 0.19
234 0.14
235 0.13
236 0.19
237 0.22
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.22
243 0.23
244 0.22
245 0.24
246 0.32
247 0.4
248 0.47
249 0.53
250 0.61
251 0.68
252 0.74
253 0.79
254 0.81
255 0.76
256 0.73
257 0.68
258 0.65
259 0.56
260 0.46
261 0.35
262 0.27
263 0.22
264 0.19
265 0.18
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.24
270 0.31
271 0.39
272 0.45
273 0.53
274 0.58
275 0.61
276 0.66
277 0.61
278 0.59
279 0.59
280 0.61
281 0.62
282 0.59
283 0.58
284 0.55
285 0.54
286 0.49
287 0.43
288 0.35
289 0.26
290 0.26
291 0.25
292 0.25
293 0.23
294 0.22
295 0.21
296 0.22
297 0.22
298 0.19
299 0.18
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.19
305 0.26
306 0.34
307 0.42
308 0.46
309 0.53
310 0.6
311 0.69
312 0.71
313 0.75
314 0.72
315 0.66
316 0.62
317 0.56
318 0.5
319 0.43
320 0.35
321 0.25
322 0.2
323 0.16
324 0.14
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.15
329 0.2
330 0.25
331 0.27
332 0.28
333 0.3
334 0.36
335 0.39
336 0.38
337 0.33
338 0.3
339 0.32
340 0.38
341 0.42
342 0.4
343 0.38
344 0.37
345 0.39
346 0.38
347 0.35
348 0.28
349 0.22
350 0.17
351 0.15
352 0.13
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.26
366 0.29
367 0.3
368 0.33
369 0.36
370 0.34
371 0.36
372 0.41
373 0.36
374 0.34
375 0.33
376 0.3
377 0.25
378 0.22
379 0.19
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.14
385 0.16
386 0.24
387 0.32
388 0.4
389 0.49
390 0.58
391 0.68
392 0.78
393 0.86
394 0.89
395 0.91
396 0.89
397 0.9
398 0.88
399 0.83
400 0.78
401 0.74
402 0.66
403 0.61
404 0.6
405 0.53
406 0.46
407 0.41
408 0.35
409 0.28
410 0.26