FuNGI

A0A1Y1V4U0

Protein Details

Accession

A0A1Y1V4U0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
71-90	CLTNEKDKKKKDLTLRKLSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019680 Mediator_Med1
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10744 Med1

Amino Acid Sequences

MENLEEKKIDDILKDIHNDFMDYFENIDIPKEGSTSFHDLNNKISIYELENNFHQSINLVRESLTKFKDICLTNEKDKKKKDLTLRKLSLILKEQNRNRQISKEWNSTCSDCLESLRQVCKIDKFQIMKKSLIELADVLKLEHFCDSYAKGLSSERISIYGKVIVIDIAVLLKNNLRENNIQKFYEILSNLAYLDKYSNGDYDLFHNIQCIENTLTSLYEAESKNRTIPDVIQYGHGYPLISVSRFGPSSIYWGTPSALRQINWSEFSKAEDEEKATIMNLGFYKANISIINTKGNSFFLTTAHKNYIKTDNDMTEDGVTTSIVKTPLSEFQFITSIKDLKPLNGKTYCLTLDPPIIATTEMENLILNVLHANDEPDKKYDFVDNNIQMFNSQLFKNSQLYIENLLIYDKFCDNFSSMSDLSEINKSFYIKKNNMYPQQYMFNDSNVHGIVVRHIPFTDPSQIYSIYKILRQQLVFNTLFQSCMDSNNKNEDPTKPIKNYLEEFHIILEVYCPNAPNEITIIFNHPSKPGIINVTITIPLDNPEKNLKVHYNEKSLLDNDMSLPTGFGDMHDEKLKPEKLTQFSLSYSAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.3
3	0.31
4	0.3
5	0.3
6	0.26
7	0.25
8	0.22
9	0.18
10	0.18
11	0.14
12	0.15
13	0.14
14	0.15
15	0.13
16	0.12
17	0.12
18	0.12
19	0.12
20	0.13
21	0.19
22	0.24
23	0.25
24	0.29
25	0.34
26	0.34
27	0.38
28	0.41
29	0.35
30	0.28
31	0.28
32	0.25
33	0.24
34	0.31
35	0.3
36	0.28
37	0.29
38	0.34
39	0.33
40	0.31
41	0.26
42	0.19
43	0.21
44	0.23
45	0.23
46	0.19
47	0.18
48	0.24
49	0.28
50	0.34
51	0.32
52	0.31
53	0.3
54	0.32
55	0.39
56	0.35
57	0.37
58	0.38
59	0.42
60	0.48
61	0.56
62	0.62
63	0.64
64	0.68
65	0.71
66	0.71
67	0.73
68	0.74
69	0.77
70	0.79
71	0.81
72	0.8
73	0.73
74	0.72
75	0.66
76	0.61
77	0.57
78	0.55
79	0.52
80	0.57
81	0.61
82	0.65
83	0.68
84	0.68
85	0.63
86	0.6
87	0.58
88	0.6
89	0.61
90	0.61
91	0.57
92	0.55
93	0.57
94	0.53
95	0.48
96	0.4
97	0.33
98	0.24
99	0.25
100	0.25
101	0.25
102	0.29
103	0.31
104	0.31
105	0.32
106	0.34
107	0.37
108	0.39
109	0.4
110	0.42
111	0.44
112	0.48
113	0.54
114	0.54
115	0.5
116	0.46
117	0.43
118	0.38
119	0.34
120	0.28
121	0.2
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.14
126	0.13
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.11
131	0.09
132	0.11
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.15
137	0.15
138	0.16
139	0.18
140	0.17
141	0.18
142	0.16
143	0.17
144	0.18
145	0.18
146	0.19
147	0.18
148	0.16
149	0.15
150	0.14
151	0.11
152	0.09
153	0.08
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.07
160	0.1
161	0.13
162	0.14
163	0.17
164	0.23
165	0.29
166	0.38
167	0.4
168	0.38
169	0.35
170	0.35
171	0.33
172	0.32
173	0.26
174	0.17
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.13
179	0.12
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.11
188	0.11
189	0.13
190	0.17
191	0.16
192	0.16
193	0.16
194	0.15
195	0.16
196	0.15
197	0.15
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.07
206	0.11
207	0.12
208	0.14
209	0.16
210	0.17
211	0.19
212	0.19
213	0.2
214	0.16
215	0.17
216	0.19
217	0.19
218	0.19
219	0.19
220	0.19
221	0.19
222	0.18
223	0.17
224	0.12
225	0.09
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.1
235	0.09
236	0.13
237	0.14
238	0.13
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.15
245	0.16
246	0.16
247	0.17
248	0.2
249	0.22
250	0.24
251	0.25
252	0.21
253	0.18
254	0.2
255	0.19
256	0.17
257	0.16
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.09
264	0.1
265	0.08
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.08
273	0.09
274	0.07
275	0.09
276	0.11
277	0.13
278	0.16
279	0.15
280	0.16
281	0.15
282	0.16
283	0.15
284	0.12
285	0.11
286	0.09
287	0.14
288	0.15
289	0.16
290	0.2
291	0.22
292	0.21
293	0.24
294	0.3
295	0.27
296	0.28
297	0.28
298	0.25
299	0.25
300	0.25
301	0.23
302	0.15
303	0.14
304	0.11
305	0.09
306	0.08
307	0.06
308	0.05
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.09
314	0.14
315	0.16
316	0.18
317	0.16
318	0.17
319	0.2
320	0.2
321	0.21
322	0.17
323	0.16
324	0.15
325	0.2
326	0.19
327	0.19
328	0.27
329	0.26
330	0.3
331	0.3
332	0.31
333	0.27
334	0.3
335	0.27
336	0.2
337	0.2
338	0.15
339	0.15
340	0.14
341	0.13
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.07
360	0.1
361	0.13
362	0.14
363	0.16
364	0.17
365	0.17
366	0.18
367	0.22
368	0.2
369	0.22
370	0.29
371	0.31
372	0.31
373	0.31
374	0.29
375	0.24
376	0.23
377	0.2
378	0.14
379	0.11
380	0.12
381	0.13
382	0.16
383	0.19
384	0.19
385	0.18
386	0.17
387	0.19
388	0.19
389	0.18
390	0.16
391	0.13
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.09
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.12
402	0.13
403	0.16
404	0.15
405	0.15
406	0.16
407	0.15
408	0.15
409	0.19
410	0.19
411	0.15
412	0.16
413	0.17
414	0.21
415	0.27
416	0.35
417	0.35
418	0.39
419	0.47
420	0.54
421	0.61
422	0.61
423	0.57
424	0.52
425	0.55
426	0.51
427	0.47
428	0.39
429	0.33
430	0.3
431	0.27
432	0.26
433	0.18
434	0.17
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.17
439	0.18
440	0.16
441	0.16
442	0.17
443	0.18
444	0.21
445	0.27
446	0.22
447	0.22
448	0.24
449	0.26
450	0.25
451	0.25
452	0.25
453	0.19
454	0.2
455	0.23
456	0.27
457	0.3
458	0.3
459	0.33
460	0.33
461	0.39
462	0.37
463	0.34
464	0.31
465	0.26
466	0.26
467	0.21
468	0.22
469	0.15
470	0.2
471	0.25
472	0.25
473	0.28
474	0.36
475	0.38
476	0.36
477	0.39
478	0.36
479	0.38
480	0.42
481	0.48
482	0.42
483	0.47
484	0.49
485	0.52
486	0.52
487	0.48
488	0.47
489	0.4
490	0.38
491	0.31
492	0.27
493	0.21
494	0.18
495	0.16
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.14
502	0.14
503	0.13
504	0.14
505	0.13
506	0.14
507	0.15
508	0.19
509	0.19
510	0.21
511	0.22
512	0.21
513	0.21
514	0.21
515	0.22
516	0.21
517	0.23
518	0.23
519	0.23
520	0.23
521	0.24
522	0.23
523	0.21
524	0.19
525	0.14
526	0.15
527	0.17
528	0.17
529	0.18
530	0.24
531	0.27
532	0.28
533	0.33
534	0.37
535	0.4
536	0.48
537	0.52
538	0.52
539	0.53
540	0.54
541	0.53
542	0.48
543	0.44
544	0.36
545	0.3
546	0.24
547	0.23
548	0.22
549	0.17
550	0.16
551	0.12
552	0.13
553	0.11
554	0.1
555	0.16
556	0.16
557	0.2
558	0.25
559	0.25
560	0.26
561	0.35
562	0.39
563	0.34
564	0.4
565	0.45
566	0.46
567	0.52
568	0.54
569	0.48
570	0.45

A0A1Y1V4U0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer