Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V040

Protein Details
Accession A0A1Y1V040    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MPKVKKNKRRNLSYKDINNEEPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
IPR002942  S4_RNA-bd  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MPKVKKNKRRNLSYKDINNEEPPSNAKYYFENGLRKVQPYFFTYKTFTKGRWYEKSIYSIFCKEFQDHTPEYYKKAIETGKIKVNNKIVSPDYLLKNGDVVSHSIHRHEPPVTSQKIEIVKKTDDFLIINKPSSIPVHPSGRYNHNTVLHILMNEYGYKKLYPSNRLDRLTSGLNIICLNPERAKAMEYNLRHKTILKEYLARVVGNFPDEEIVCNEPILTVSFKLGLNSVSPDGKPCTTIFKKLHFNGKTSLVLCKPLTGRTHQIRVHLQYLGYPIANDPLYCNTDIWGQQCGKGGVNKEGIDKVIGNMMAMGFPNLECPDTNKSISTENHESENKQETDQNPSQNDVNQEKEKPSWFVESCDDCIHPKSDPKPHQMCIWLHAYSYSKDAWSFKTSLPDWAREDFVEDC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.86
3 0.82
4 0.75
5 0.7
6 0.65
7 0.56
8 0.48
9 0.43
10 0.39
11 0.36
12 0.32
13 0.28
14 0.27
15 0.29
16 0.34
17 0.37
18 0.39
19 0.39
20 0.47
21 0.49
22 0.48
23 0.48
24 0.45
25 0.42
26 0.4
27 0.44
28 0.37
29 0.39
30 0.41
31 0.42
32 0.43
33 0.43
34 0.39
35 0.43
36 0.48
37 0.52
38 0.56
39 0.58
40 0.59
41 0.61
42 0.66
43 0.59
44 0.54
45 0.5
46 0.48
47 0.43
48 0.41
49 0.39
50 0.35
51 0.36
52 0.35
53 0.38
54 0.34
55 0.36
56 0.4
57 0.39
58 0.4
59 0.41
60 0.38
61 0.31
62 0.35
63 0.34
64 0.32
65 0.35
66 0.37
67 0.41
68 0.48
69 0.49
70 0.5
71 0.54
72 0.51
73 0.48
74 0.47
75 0.41
76 0.36
77 0.38
78 0.38
79 0.33
80 0.33
81 0.32
82 0.27
83 0.26
84 0.23
85 0.2
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.18
90 0.19
91 0.2
92 0.23
93 0.23
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.26
98 0.34
99 0.34
100 0.32
101 0.31
102 0.33
103 0.39
104 0.4
105 0.37
106 0.33
107 0.33
108 0.33
109 0.34
110 0.29
111 0.23
112 0.21
113 0.2
114 0.24
115 0.23
116 0.23
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.17
123 0.2
124 0.26
125 0.27
126 0.3
127 0.32
128 0.38
129 0.4
130 0.38
131 0.38
132 0.36
133 0.35
134 0.33
135 0.32
136 0.25
137 0.22
138 0.19
139 0.15
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.15
148 0.2
149 0.25
150 0.32
151 0.41
152 0.47
153 0.49
154 0.49
155 0.45
156 0.43
157 0.38
158 0.3
159 0.23
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.12
173 0.15
174 0.19
175 0.2
176 0.27
177 0.3
178 0.31
179 0.3
180 0.31
181 0.31
182 0.31
183 0.35
184 0.28
185 0.29
186 0.28
187 0.33
188 0.32
189 0.28
190 0.22
191 0.18
192 0.16
193 0.13
194 0.13
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.21
226 0.22
227 0.3
228 0.31
229 0.36
230 0.43
231 0.45
232 0.55
233 0.47
234 0.48
235 0.43
236 0.44
237 0.4
238 0.33
239 0.34
240 0.25
241 0.27
242 0.25
243 0.25
244 0.22
245 0.23
246 0.25
247 0.25
248 0.32
249 0.33
250 0.41
251 0.39
252 0.44
253 0.45
254 0.46
255 0.45
256 0.38
257 0.32
258 0.26
259 0.27
260 0.23
261 0.17
262 0.13
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.11
267 0.1
268 0.13
269 0.15
270 0.16
271 0.15
272 0.13
273 0.16
274 0.18
275 0.18
276 0.2
277 0.18
278 0.2
279 0.23
280 0.24
281 0.22
282 0.23
283 0.25
284 0.24
285 0.28
286 0.27
287 0.26
288 0.26
289 0.24
290 0.22
291 0.2
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.05
302 0.05
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.13
308 0.19
309 0.22
310 0.23
311 0.22
312 0.23
313 0.29
314 0.3
315 0.35
316 0.35
317 0.33
318 0.38
319 0.38
320 0.38
321 0.37
322 0.43
323 0.36
324 0.31
325 0.34
326 0.3
327 0.37
328 0.41
329 0.44
330 0.37
331 0.38
332 0.39
333 0.37
334 0.42
335 0.37
336 0.39
337 0.38
338 0.39
339 0.4
340 0.42
341 0.42
342 0.39
343 0.37
344 0.38
345 0.34
346 0.35
347 0.39
348 0.39
349 0.39
350 0.38
351 0.36
352 0.3
353 0.33
354 0.31
355 0.26
356 0.3
357 0.35
358 0.43
359 0.5
360 0.58
361 0.62
362 0.63
363 0.65
364 0.65
365 0.59
366 0.53
367 0.5
368 0.41
369 0.34
370 0.35
371 0.33
372 0.26
373 0.27
374 0.24
375 0.2
376 0.23
377 0.26
378 0.27
379 0.3
380 0.32
381 0.31
382 0.39
383 0.38
384 0.45
385 0.46
386 0.47
387 0.46
388 0.45
389 0.46
390 0.37