Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0ESM3

Protein Details
Accession H0ESM3    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-57EVETIAKKTKKDKTKDRSKPRTKEKSGKEKSGKEKSGKKRKVEELSEEBasic
87-107SEESNKPSSKKRKPNVGEEIEHydrophilic
359-387GTDITKVKSEKKPKKRKVWCNRLNGRALRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-50KKTKKDKTKDRSKPRTKEKSGKEKSGKEKSGKKRK
117-138SKKALRALKKGKPLPPSKSGAE
143-149PEAKKAK
366-375KSEKKPKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGDSDGSEIEVETIAKKTKKDKTKDRSKPRTKEKSGKEKSGKEKSGKKRKVEELSEEPIPTSIPSPETSSALLEPDSEVQDEDVASSEESNKPSSKKRKPNVGEEIEVDITLPEPPSKKALRALKKGKPLPPSKSGAETTPEPEAKKAKAEVEKRSEHGIWIGNLAFHISKEDLRKFFVEKSDITDDLITRIHMPGPNDKKSANKVEERRNGKTVHNTGYAYVDFSTAEGATEAVELSEQLLGGRRVLIKNNKSFEGRPQKTKEESRNEGKPPSKRVFVGNLPFDATEAIIQSHYEKCGAIGTLKLATFEDSGKCKGYGWVTFDELEGAQNCVRGYVLVEEELSDDSESEDKSGSGDEGTDITKVKSEKKPKKRKVWCNRLNGRALRTEFAEDAQVRYKKRYGKDGTKQQAAAGSVEKATEPAQESHVIIPKVVEYRKEYAPRLTGGIVESKGKKFLFKGAFRQRHQYGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.26
4 0.34
5 0.43
6 0.53
7 0.62
8 0.7
9 0.74
10 0.83
11 0.9
12 0.92
13 0.94
14 0.95
15 0.95
16 0.95
17 0.95
18 0.94
19 0.93
20 0.92
21 0.93
22 0.91
23 0.91
24 0.89
25 0.87
26 0.88
27 0.88
28 0.86
29 0.83
30 0.85
31 0.85
32 0.87
33 0.86
34 0.84
35 0.83
36 0.85
37 0.86
38 0.82
39 0.79
40 0.76
41 0.72
42 0.67
43 0.57
44 0.48
45 0.38
46 0.31
47 0.24
48 0.18
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.18
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.19
59 0.18
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.18
78 0.21
79 0.24
80 0.34
81 0.44
82 0.52
83 0.59
84 0.67
85 0.75
86 0.78
87 0.84
88 0.84
89 0.79
90 0.71
91 0.63
92 0.58
93 0.47
94 0.4
95 0.3
96 0.2
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.12
103 0.18
104 0.2
105 0.22
106 0.3
107 0.39
108 0.46
109 0.55
110 0.63
111 0.64
112 0.72
113 0.76
114 0.74
115 0.74
116 0.72
117 0.68
118 0.65
119 0.63
120 0.55
121 0.53
122 0.49
123 0.42
124 0.38
125 0.33
126 0.29
127 0.29
128 0.3
129 0.25
130 0.27
131 0.29
132 0.26
133 0.28
134 0.28
135 0.28
136 0.34
137 0.4
138 0.45
139 0.49
140 0.51
141 0.49
142 0.52
143 0.45
144 0.37
145 0.34
146 0.28
147 0.21
148 0.2
149 0.18
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.11
158 0.17
159 0.22
160 0.22
161 0.24
162 0.26
163 0.26
164 0.28
165 0.29
166 0.26
167 0.22
168 0.26
169 0.28
170 0.26
171 0.25
172 0.23
173 0.19
174 0.17
175 0.17
176 0.11
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.21
183 0.28
184 0.31
185 0.32
186 0.32
187 0.34
188 0.38
189 0.44
190 0.4
191 0.41
192 0.44
193 0.52
194 0.6
195 0.62
196 0.61
197 0.57
198 0.54
199 0.5
200 0.51
201 0.45
202 0.41
203 0.37
204 0.34
205 0.3
206 0.3
207 0.27
208 0.19
209 0.15
210 0.11
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.16
235 0.23
236 0.27
237 0.33
238 0.35
239 0.36
240 0.37
241 0.37
242 0.41
243 0.45
244 0.43
245 0.45
246 0.47
247 0.5
248 0.53
249 0.6
250 0.59
251 0.56
252 0.59
253 0.58
254 0.6
255 0.58
256 0.59
257 0.57
258 0.53
259 0.52
260 0.5
261 0.47
262 0.41
263 0.41
264 0.4
265 0.4
266 0.41
267 0.35
268 0.32
269 0.29
270 0.28
271 0.25
272 0.2
273 0.14
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.19
304 0.21
305 0.21
306 0.22
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.23
311 0.21
312 0.17
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.13
351 0.14
352 0.22
353 0.3
354 0.4
355 0.5
356 0.61
357 0.72
358 0.79
359 0.88
360 0.91
361 0.94
362 0.94
363 0.95
364 0.93
365 0.92
366 0.91
367 0.88
368 0.86
369 0.79
370 0.72
371 0.68
372 0.61
373 0.52
374 0.45
375 0.4
376 0.31
377 0.27
378 0.3
379 0.22
380 0.23
381 0.29
382 0.32
383 0.31
384 0.35
385 0.4
386 0.41
387 0.46
388 0.53
389 0.55
390 0.61
391 0.7
392 0.76
393 0.79
394 0.78
395 0.74
396 0.64
397 0.59
398 0.49
399 0.41
400 0.32
401 0.25
402 0.18
403 0.18
404 0.17
405 0.14
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.16
410 0.19
411 0.21
412 0.22
413 0.26
414 0.32
415 0.28
416 0.25
417 0.24
418 0.24
419 0.29
420 0.3
421 0.3
422 0.29
423 0.34
424 0.42
425 0.48
426 0.48
427 0.48
428 0.5
429 0.47
430 0.45
431 0.4
432 0.34
433 0.28
434 0.31
435 0.26
436 0.28
437 0.31
438 0.3
439 0.35
440 0.34
441 0.36
442 0.33
443 0.41
444 0.44
445 0.46
446 0.55
447 0.61
448 0.7
449 0.7
450 0.78