Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VKE6

Protein Details
Accession A0A1Y1VKE6    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-362GLNIKDKRPKRQIKAVQHLEPHydrophilic
594-616VQSKARQLKKKAKRLAKSLNINSHydrophilic
638-659NNTNKLLKRRSSKSKLNKSYIPHydrophilic
672-706EIQTSKKKSKISQKVIKKVNKRTIKTETKGRKRTQHydrophilic
760-793IPIKMKNRINPPLKKERKTKTKAKGKNKEIGRGABasic
856-886LYKLYNYVKKVSKPKCSKKKENKNEETSSDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
599-608RQLKKKAKRL
677-704KKKSKISQKVIKKVNKRTIKTETKGRKR
763-799KMKNRINPPLKKERKTKTKAKGKNKEIGRGAKSKQPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR018359  Bromodomain_CS  
IPR027353  NET_dom  
IPR038336  NET_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF17035  BET  
PF00439  Bromodomain  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00633  BROMODOMAIN_1  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS51525  NET  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSIEEEPTPINTNEKNETVDNQIKSIPEKTKIHLKNIKPNILSPPDTPQINLKKEINIPDKKSENSSEIIINIKNDISDSKVELNTNNIEIEENNSNDINKIENKENIIESDRNKSNQDLSENINENKEIIQKEKNNNNNTNINNNNNININNDKEKLNRENENNEKDESTKFVENESKDEIINNDSSKVQKADCNKVIVKVDNINKVNPNEKEKSHKMPRSEINICTDITRSLQLHPRSFPFLKPVDPVLLNIPDYLIIIKHPMDLSTIMAKIKNNKYKDINEYICDVQLMFNNCFTYNPPENPVHIAGLALNDYFIEQLRRLSPEVQASLKILNEDENNGLNIKDKRPKRQIKAVQHLEPEYHLPKKMKVVHKYTNEDTKEENLSKSLNDESNDKKEIIHLSKSKSIKSEEPNITTKTTIKKLIATTRATNILDSIKVKNKKNQIKNENDVEEDDVEEIDSEEQLEEGKSEIEDYEDEDEEEEDDDDDEFVENDADSLRRKTNSLIRASRKVLSRMKSKDSHSKIRKITTQTGSISKKSSKSKLFKSLTKIPTLTSDQIYSMDPVDDLVERQINNLTICLQNVTKQLELLQVQSKARQLKKKAKRLAKSLNINSYDYQSESDNIEELLNQTNLLTNNTNKLLKRRSSKSKLNKSYIPDVKELEEDDLEDEIQTSKKKSKISQKVIKKVNKRTIKTETKGRKRTQEISKENSYDIKRVCEYCGDTDTPMWRRGPNGKGTLCNKCGVKWKGGKIYQGEEIPIKMKNRINPPLKKERKTKTKAKGKNKEIGRGAKSKQPKVAEITYNQKKELSEMINYLSEEKISGVVDIIRSSIPDIKDSQEEIELDIETIDPATLYKLYNYVKKVSKPKCSKKKENKNEETSSDESSVESSDSEDETSDSDSEPNQFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.34
4 0.36
5 0.39
6 0.43
7 0.39
8 0.36
9 0.36
10 0.34
11 0.36
12 0.4
13 0.37
14 0.38
15 0.41
16 0.44
17 0.52
18 0.56
19 0.63
20 0.65
21 0.67
22 0.69
23 0.75
24 0.79
25 0.7
26 0.68
27 0.66
28 0.64
29 0.6
30 0.51
31 0.49
32 0.45
33 0.44
34 0.42
35 0.42
36 0.44
37 0.45
38 0.49
39 0.44
40 0.45
41 0.5
42 0.58
43 0.59
44 0.58
45 0.59
46 0.62
47 0.64
48 0.61
49 0.61
50 0.56
51 0.49
52 0.43
53 0.4
54 0.33
55 0.29
56 0.3
57 0.26
58 0.22
59 0.21
60 0.19
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.18
67 0.22
68 0.24
69 0.25
70 0.25
71 0.29
72 0.28
73 0.27
74 0.24
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.21
79 0.21
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.2
88 0.23
89 0.26
90 0.29
91 0.32
92 0.34
93 0.35
94 0.34
95 0.34
96 0.34
97 0.31
98 0.37
99 0.39
100 0.38
101 0.39
102 0.39
103 0.39
104 0.39
105 0.41
106 0.35
107 0.35
108 0.41
109 0.44
110 0.43
111 0.38
112 0.34
113 0.3
114 0.29
115 0.3
116 0.24
117 0.23
118 0.31
119 0.37
120 0.46
121 0.55
122 0.61
123 0.65
124 0.69
125 0.71
126 0.69
127 0.64
128 0.64
129 0.6
130 0.56
131 0.53
132 0.48
133 0.44
134 0.39
135 0.37
136 0.32
137 0.3
138 0.3
139 0.29
140 0.3
141 0.3
142 0.31
143 0.38
144 0.4
145 0.43
146 0.46
147 0.47
148 0.55
149 0.61
150 0.65
151 0.6
152 0.55
153 0.49
154 0.44
155 0.39
156 0.33
157 0.29
158 0.27
159 0.24
160 0.27
161 0.32
162 0.31
163 0.34
164 0.34
165 0.3
166 0.26
167 0.27
168 0.24
169 0.21
170 0.23
171 0.2
172 0.17
173 0.18
174 0.19
175 0.21
176 0.22
177 0.2
178 0.21
179 0.28
180 0.36
181 0.38
182 0.43
183 0.41
184 0.44
185 0.46
186 0.44
187 0.41
188 0.39
189 0.4
190 0.43
191 0.43
192 0.42
193 0.43
194 0.43
195 0.48
196 0.44
197 0.46
198 0.41
199 0.43
200 0.49
201 0.5
202 0.57
203 0.6
204 0.61
205 0.59
206 0.62
207 0.66
208 0.66
209 0.65
210 0.57
211 0.53
212 0.49
213 0.45
214 0.37
215 0.31
216 0.23
217 0.2
218 0.21
219 0.16
220 0.18
221 0.26
222 0.31
223 0.33
224 0.35
225 0.36
226 0.4
227 0.41
228 0.38
229 0.36
230 0.33
231 0.31
232 0.31
233 0.3
234 0.26
235 0.25
236 0.25
237 0.22
238 0.22
239 0.2
240 0.18
241 0.16
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.07
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.15
259 0.17
260 0.24
261 0.33
262 0.39
263 0.39
264 0.44
265 0.49
266 0.53
267 0.58
268 0.58
269 0.51
270 0.45
271 0.46
272 0.4
273 0.34
274 0.29
275 0.22
276 0.14
277 0.15
278 0.18
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.17
284 0.18
285 0.22
286 0.23
287 0.23
288 0.26
289 0.27
290 0.28
291 0.31
292 0.29
293 0.22
294 0.17
295 0.16
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.07
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.08
308 0.1
309 0.13
310 0.14
311 0.15
312 0.18
313 0.2
314 0.22
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.14
331 0.16
332 0.2
333 0.27
334 0.3
335 0.4
336 0.5
337 0.6
338 0.61
339 0.7
340 0.74
341 0.77
342 0.83
343 0.81
344 0.75
345 0.68
346 0.62
347 0.51
348 0.42
349 0.36
350 0.28
351 0.23
352 0.23
353 0.21
354 0.22
355 0.29
356 0.36
357 0.4
358 0.45
359 0.51
360 0.55
361 0.61
362 0.65
363 0.62
364 0.62
365 0.55
366 0.49
367 0.43
368 0.37
369 0.34
370 0.3
371 0.26
372 0.19
373 0.18
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.14
378 0.14
379 0.17
380 0.2
381 0.24
382 0.26
383 0.24
384 0.22
385 0.22
386 0.27
387 0.26
388 0.28
389 0.27
390 0.29
391 0.36
392 0.38
393 0.37
394 0.34
395 0.34
396 0.34
397 0.34
398 0.4
399 0.38
400 0.4
401 0.42
402 0.41
403 0.39
404 0.34
405 0.32
406 0.27
407 0.27
408 0.26
409 0.23
410 0.24
411 0.27
412 0.32
413 0.35
414 0.33
415 0.32
416 0.3
417 0.33
418 0.3
419 0.26
420 0.21
421 0.16
422 0.15
423 0.15
424 0.16
425 0.2
426 0.26
427 0.29
428 0.34
429 0.42
430 0.5
431 0.57
432 0.64
433 0.66
434 0.68
435 0.7
436 0.7
437 0.61
438 0.53
439 0.44
440 0.35
441 0.26
442 0.18
443 0.13
444 0.08
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.04
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.08
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.04
476 0.05
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.06
486 0.08
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.16
491 0.22
492 0.28
493 0.35
494 0.41
495 0.44
496 0.49
497 0.51
498 0.52
499 0.48
500 0.48
501 0.46
502 0.44
503 0.47
504 0.46
505 0.5
506 0.51
507 0.52
508 0.55
509 0.56
510 0.61
511 0.59
512 0.63
513 0.61
514 0.61
515 0.63
516 0.58
517 0.6
518 0.53
519 0.51
520 0.45
521 0.48
522 0.46
523 0.42
524 0.39
525 0.34
526 0.37
527 0.38
528 0.43
529 0.45
530 0.49
531 0.54
532 0.62
533 0.63
534 0.62
535 0.63
536 0.66
537 0.6
538 0.57
539 0.5
540 0.4
541 0.4
542 0.39
543 0.33
544 0.25
545 0.22
546 0.19
547 0.19
548 0.19
549 0.15
550 0.12
551 0.09
552 0.08
553 0.07
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.11
562 0.12
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.11
567 0.11
568 0.12
569 0.11
570 0.13
571 0.16
572 0.18
573 0.17
574 0.16
575 0.17
576 0.19
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.2
581 0.2
582 0.23
583 0.26
584 0.3
585 0.35
586 0.4
587 0.45
588 0.53
589 0.63
590 0.71
591 0.76
592 0.78
593 0.79
594 0.81
595 0.82
596 0.8
597 0.8
598 0.76
599 0.74
600 0.67
601 0.62
602 0.53
603 0.45
604 0.37
605 0.28
606 0.23
607 0.16
608 0.14
609 0.13
610 0.13
611 0.11
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.09
616 0.11
617 0.1
618 0.09
619 0.09
620 0.11
621 0.12
622 0.14
623 0.16
624 0.14
625 0.18
626 0.21
627 0.25
628 0.24
629 0.31
630 0.36
631 0.41
632 0.49
633 0.53
634 0.61
635 0.66
636 0.75
637 0.78
638 0.82
639 0.84
640 0.82
641 0.79
642 0.73
643 0.75
644 0.71
645 0.63
646 0.55
647 0.47
648 0.42
649 0.38
650 0.33
651 0.25
652 0.18
653 0.15
654 0.13
655 0.12
656 0.1
657 0.09
658 0.08
659 0.08
660 0.1
661 0.11
662 0.13
663 0.18
664 0.23
665 0.28
666 0.35
667 0.45
668 0.54
669 0.63
670 0.7
671 0.75
672 0.8
673 0.85
674 0.86
675 0.85
676 0.84
677 0.83
678 0.83
679 0.77
680 0.75
681 0.75
682 0.77
683 0.73
684 0.73
685 0.74
686 0.75
687 0.8
688 0.79
689 0.78
690 0.75
691 0.79
692 0.79
693 0.79
694 0.75
695 0.73
696 0.74
697 0.66
698 0.6
699 0.58
700 0.5
701 0.45
702 0.39
703 0.37
704 0.34
705 0.33
706 0.33
707 0.31
708 0.32
709 0.3
710 0.32
711 0.29
712 0.26
713 0.28
714 0.33
715 0.31
716 0.32
717 0.31
718 0.28
719 0.31
720 0.38
721 0.42
722 0.43
723 0.47
724 0.46
725 0.52
726 0.57
727 0.61
728 0.55
729 0.54
730 0.47
731 0.42
732 0.49
733 0.45
734 0.48
735 0.47
736 0.53
737 0.58
738 0.61
739 0.63
740 0.57
741 0.57
742 0.53
743 0.47
744 0.41
745 0.33
746 0.3
747 0.26
748 0.27
749 0.25
750 0.27
751 0.29
752 0.34
753 0.42
754 0.51
755 0.58
756 0.63
757 0.69
758 0.74
759 0.8
760 0.81
761 0.82
762 0.83
763 0.84
764 0.84
765 0.86
766 0.85
767 0.86
768 0.88
769 0.9
770 0.9
771 0.87
772 0.87
773 0.83
774 0.81
775 0.78
776 0.77
777 0.72
778 0.69
779 0.64
780 0.64
781 0.67
782 0.63
783 0.62
784 0.58
785 0.56
786 0.54
787 0.59
788 0.57
789 0.53
790 0.58
791 0.6
792 0.58
793 0.55
794 0.51
795 0.43
796 0.4
797 0.42
798 0.35
799 0.29
800 0.28
801 0.3
802 0.3
803 0.31
804 0.29
805 0.22
806 0.18
807 0.15
808 0.14
809 0.12
810 0.1
811 0.1
812 0.09
813 0.1
814 0.11
815 0.11
816 0.12
817 0.1
818 0.1
819 0.13
820 0.17
821 0.16
822 0.18
823 0.2
824 0.22
825 0.26
826 0.27
827 0.27
828 0.25
829 0.24
830 0.23
831 0.22
832 0.19
833 0.15
834 0.14
835 0.12
836 0.08
837 0.08
838 0.07
839 0.05
840 0.05
841 0.07
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.17
846 0.21
847 0.28
848 0.31
849 0.37
850 0.43
851 0.51
852 0.6
853 0.63
854 0.69
855 0.74
856 0.82
857 0.85
858 0.89
859 0.92
860 0.93
861 0.95
862 0.95
863 0.96
864 0.95
865 0.93
866 0.9
867 0.82
868 0.78
869 0.69
870 0.63
871 0.53
872 0.42
873 0.33
874 0.27
875 0.24
876 0.17
877 0.14
878 0.11
879 0.11
880 0.12
881 0.12
882 0.12
883 0.11
884 0.12
885 0.14
886 0.14
887 0.13
888 0.13
889 0.14