Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VIM9

Protein Details
Accession A0A1Y1VIM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1110-1133ELKAKIDAYKKERQQKKNKLANSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1125-1126KK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MIEQNEQNETNQDSIRQKRLLRLNQLEAKIENKSEDSENNEDKTPKEEPKTIPKKVEPKVETPIKQNVFSTLSSMKNSQNSSSSSINLQKKKSKVEAIVLFLSQTEDEWDDQQYKKIFKCTLDNNDTKENEELKFLKELSEDLISENLPLKITTNIIERLLVARLSLDDNANDNAVPLFDYLVNCWRALCEVQRKTNKLLLEKDITEMQKNELNNKVNKRIERLNSAKELIVSYSGFVISTLAEMFPQPQRIIDLGPKCIAIKLLNSNAFELENQLPTLFFDEFIKRFSDNIEEIFDPILKYIMDEMNKQNLNKNYLPPLNAVSKLLTNKLIAAIVPTLNYWNPESVTAKEIEDKTFLGVFYSKVSAFPDSDSGISQAYFSNRNSFSYSTAYENNINGFEIGSRNPDDVKASQNSLCSLVENVQSTLFSMTMSIIRAGLSSREAVLKFFGDTITKNQSREKIQIDRKEVSTDGLMYSLTRVCHKLCEPFLDPGYKKIGLIDLDYFSYTKRIDITEHTRILFDLNQSKEYSEKWNKEHPETPKPNFVTEMFYLTMAVYHYGFLSTVRFYQRMVSQIEEIRKQVKKMNAEKNSGVWANLGIRRVVNEQLLIRYQTQLDVMIDHKLAMDAILLNKTILVDVFKFYNLVMTWIIKLILNKSGMVASTTNINWAQLSRGDISGNIDLRKLPDEAPDAFKALPEWIIDDICEFLVFVCRNKATIFEVVSRDELMTFIMVLMNNSNYIKNPYLKAKFAEILSCFTVPLYRDALGHTSGHLNLIFEMHPLAKDLLVEDMMKFYIDIEQTGMHSQFYDKFNIRYNISQVLKCVWDDANHRKQVINQSKNTEFFVHFANLLMNDTTYLLDEALAKLSEIHVIQKEMTDAQNWNSKTDQYRSERENLLRMDERQAISYMSLGNETVHMLNYMTSDPQIIQPFMEPEIVERLAAMMDYNLTALVGPKCTELKVAEPEKYRFNPKKLLTELIDIYIHLSNRQEFINAVARDGRSYRKEIFLKAHQILRKNGLKGQNDLTKLLNFVENVEKEVNNINLEDEIDQDIPDEFLDPLLYTLMDDPVILPTSHQTVDRSTIKSHLLSDSHDPFNRQPLTIDMVTPNVELKAKIDAYKKERQQKKNKLANSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.46
3 0.49
4 0.5
5 0.55
6 0.64
7 0.67
8 0.69
9 0.7
10 0.72
11 0.74
12 0.73
13 0.68
14 0.59
15 0.53
16 0.46
17 0.4
18 0.32
19 0.26
20 0.26
21 0.27
22 0.28
23 0.32
24 0.37
25 0.4
26 0.4
27 0.43
28 0.41
29 0.39
30 0.4
31 0.4
32 0.4
33 0.41
34 0.46
35 0.49
36 0.58
37 0.67
38 0.7
39 0.72
40 0.72
41 0.76
42 0.75
43 0.79
44 0.73
45 0.69
46 0.72
47 0.73
48 0.68
49 0.64
50 0.67
51 0.6
52 0.57
53 0.52
54 0.47
55 0.41
56 0.37
57 0.36
58 0.31
59 0.3
60 0.31
61 0.34
62 0.34
63 0.36
64 0.39
65 0.37
66 0.36
67 0.36
68 0.38
69 0.37
70 0.34
71 0.34
72 0.4
73 0.46
74 0.48
75 0.53
76 0.55
77 0.59
78 0.66
79 0.67
80 0.66
81 0.63
82 0.65
83 0.63
84 0.61
85 0.57
86 0.49
87 0.41
88 0.33
89 0.29
90 0.2
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.14
96 0.16
97 0.2
98 0.21
99 0.27
100 0.29
101 0.33
102 0.35
103 0.41
104 0.42
105 0.42
106 0.5
107 0.53
108 0.58
109 0.62
110 0.63
111 0.61
112 0.65
113 0.61
114 0.55
115 0.51
116 0.44
117 0.36
118 0.37
119 0.34
120 0.28
121 0.31
122 0.28
123 0.25
124 0.22
125 0.22
126 0.2
127 0.21
128 0.18
129 0.16
130 0.17
131 0.15
132 0.16
133 0.18
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.18
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.17
149 0.12
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.17
175 0.2
176 0.25
177 0.3
178 0.36
179 0.45
180 0.54
181 0.58
182 0.6
183 0.62
184 0.58
185 0.54
186 0.53
187 0.49
188 0.46
189 0.43
190 0.41
191 0.42
192 0.4
193 0.36
194 0.32
195 0.28
196 0.26
197 0.26
198 0.29
199 0.31
200 0.36
201 0.4
202 0.46
203 0.53
204 0.56
205 0.58
206 0.59
207 0.6
208 0.59
209 0.61
210 0.61
211 0.58
212 0.55
213 0.54
214 0.49
215 0.41
216 0.36
217 0.27
218 0.23
219 0.17
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.11
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.16
238 0.17
239 0.19
240 0.23
241 0.24
242 0.24
243 0.25
244 0.25
245 0.23
246 0.23
247 0.22
248 0.16
249 0.17
250 0.21
251 0.27
252 0.3
253 0.31
254 0.31
255 0.3
256 0.29
257 0.24
258 0.22
259 0.17
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.15
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.2
273 0.17
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.17
278 0.18
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.18
283 0.18
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.12
291 0.13
292 0.17
293 0.2
294 0.27
295 0.3
296 0.3
297 0.34
298 0.35
299 0.4
300 0.39
301 0.39
302 0.39
303 0.39
304 0.4
305 0.35
306 0.34
307 0.31
308 0.29
309 0.27
310 0.2
311 0.21
312 0.21
313 0.22
314 0.2
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.15
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.13
332 0.15
333 0.15
334 0.17
335 0.17
336 0.16
337 0.2
338 0.21
339 0.2
340 0.19
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.13
367 0.13
368 0.19
369 0.2
370 0.22
371 0.24
372 0.23
373 0.24
374 0.24
375 0.25
376 0.21
377 0.22
378 0.23
379 0.22
380 0.22
381 0.2
382 0.17
383 0.16
384 0.12
385 0.11
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.2
400 0.21
401 0.21
402 0.2
403 0.19
404 0.15
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.08
438 0.09
439 0.13
440 0.2
441 0.22
442 0.23
443 0.26
444 0.3
445 0.33
446 0.37
447 0.38
448 0.39
449 0.45
450 0.51
451 0.53
452 0.51
453 0.48
454 0.45
455 0.4
456 0.32
457 0.25
458 0.18
459 0.13
460 0.1
461 0.09
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.11
468 0.11
469 0.14
470 0.16
471 0.21
472 0.2
473 0.25
474 0.26
475 0.27
476 0.28
477 0.31
478 0.29
479 0.26
480 0.29
481 0.24
482 0.21
483 0.19
484 0.2
485 0.14
486 0.15
487 0.15
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.11
494 0.09
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.16
500 0.23
501 0.27
502 0.29
503 0.29
504 0.28
505 0.27
506 0.27
507 0.22
508 0.18
509 0.18
510 0.17
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.25
517 0.27
518 0.3
519 0.32
520 0.39
521 0.42
522 0.45
523 0.5
524 0.47
525 0.5
526 0.53
527 0.52
528 0.53
529 0.51
530 0.47
531 0.43
532 0.37
533 0.31
534 0.24
535 0.24
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.12
540 0.12
541 0.08
542 0.08
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.08
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.13
556 0.15
557 0.17
558 0.18
559 0.17
560 0.17
561 0.2
562 0.23
563 0.21
564 0.21
565 0.23
566 0.23
567 0.23
568 0.26
569 0.27
570 0.33
571 0.41
572 0.5
573 0.5
574 0.53
575 0.52
576 0.48
577 0.46
578 0.38
579 0.29
580 0.19
581 0.14
582 0.13
583 0.14
584 0.14
585 0.11
586 0.11
587 0.12
588 0.14
589 0.14
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.12
594 0.14
595 0.14
596 0.12
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.07
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.05
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.06
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.1
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.12
645 0.11
646 0.12
647 0.11
648 0.07
649 0.09
650 0.09
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.09
655 0.09
656 0.1
657 0.09
658 0.11
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.11
663 0.13
664 0.15
665 0.16
666 0.14
667 0.13
668 0.13
669 0.14
670 0.15
671 0.14
672 0.12
673 0.13
674 0.16
675 0.17
676 0.21
677 0.21
678 0.2
679 0.19
680 0.18
681 0.16
682 0.13
683 0.12
684 0.08
685 0.09
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.05
694 0.04
695 0.09
696 0.1
697 0.1
698 0.13
699 0.13
700 0.14
701 0.15
702 0.16
703 0.14
704 0.17
705 0.18
706 0.18
707 0.2
708 0.2
709 0.21
710 0.2
711 0.17
712 0.14
713 0.12
714 0.08
715 0.06
716 0.05
717 0.04
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.08
724 0.08
725 0.09
726 0.08
727 0.12
728 0.15
729 0.17
730 0.2
731 0.27
732 0.3
733 0.32
734 0.33
735 0.32
736 0.32
737 0.3
738 0.31
739 0.24
740 0.23
741 0.23
742 0.21
743 0.18
744 0.15
745 0.16
746 0.13
747 0.14
748 0.14
749 0.12
750 0.13
751 0.14
752 0.16
753 0.15
754 0.15
755 0.13
756 0.13
757 0.12
758 0.13
759 0.12
760 0.1
761 0.09
762 0.1
763 0.09
764 0.08
765 0.09
766 0.08
767 0.08
768 0.09
769 0.09
770 0.08
771 0.08
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.09
776 0.07
777 0.08
778 0.08
779 0.08
780 0.07
781 0.06
782 0.09
783 0.09
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.1
788 0.13
789 0.13
790 0.09
791 0.1
792 0.11
793 0.15
794 0.17
795 0.21
796 0.21
797 0.23
798 0.3
799 0.33
800 0.35
801 0.32
802 0.33
803 0.36
804 0.37
805 0.35
806 0.3
807 0.28
808 0.27
809 0.24
810 0.24
811 0.16
812 0.17
813 0.24
814 0.32
815 0.39
816 0.41
817 0.42
818 0.4
819 0.44
820 0.51
821 0.55
822 0.53
823 0.49
824 0.53
825 0.56
826 0.57
827 0.54
828 0.46
829 0.36
830 0.29
831 0.28
832 0.22
833 0.18
834 0.17
835 0.16
836 0.13
837 0.13
838 0.12
839 0.09
840 0.08
841 0.08
842 0.08
843 0.08
844 0.08
845 0.06
846 0.07
847 0.07
848 0.07
849 0.08
850 0.08
851 0.07
852 0.07
853 0.08
854 0.1
855 0.09
856 0.12
857 0.13
858 0.14
859 0.14
860 0.15
861 0.16
862 0.15
863 0.16
864 0.15
865 0.15
866 0.17
867 0.24
868 0.23
869 0.24
870 0.24
871 0.26
872 0.29
873 0.32
874 0.38
875 0.37
876 0.43
877 0.45
878 0.5
879 0.53
880 0.5
881 0.52
882 0.45
883 0.45
884 0.41
885 0.39
886 0.38
887 0.37
888 0.35
889 0.3
890 0.29
891 0.24
892 0.2
893 0.2
894 0.16
895 0.11
896 0.11
897 0.1
898 0.09
899 0.09
900 0.1
901 0.1
902 0.09
903 0.09
904 0.08
905 0.09
906 0.1
907 0.1
908 0.09
909 0.09
910 0.09
911 0.1
912 0.14
913 0.17
914 0.16
915 0.16
916 0.17
917 0.18
918 0.18
919 0.19
920 0.14
921 0.12
922 0.17
923 0.17
924 0.15
925 0.13
926 0.12
927 0.11
928 0.11
929 0.09
930 0.04
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.05
937 0.08
938 0.09
939 0.1
940 0.11
941 0.13
942 0.15
943 0.15
944 0.18
945 0.16
946 0.2
947 0.28
948 0.31
949 0.35
950 0.4
951 0.42
952 0.48
953 0.5
954 0.56
955 0.55
956 0.56
957 0.6
958 0.59
959 0.66
960 0.61
961 0.63
962 0.56
963 0.53
964 0.48
965 0.42
966 0.37
967 0.27
968 0.26
969 0.22
970 0.2
971 0.16
972 0.17
973 0.16
974 0.18
975 0.18
976 0.16
977 0.14
978 0.18
979 0.26
980 0.23
981 0.23
982 0.26
983 0.26
984 0.27
985 0.3
986 0.32
987 0.28
988 0.33
989 0.34
990 0.39
991 0.43
992 0.45
993 0.5
994 0.51
995 0.56
996 0.55
997 0.59
998 0.54
999 0.56
1000 0.57
1001 0.58
1002 0.56
1003 0.5
1004 0.52
1005 0.54
1006 0.53
1007 0.52
1008 0.55
1009 0.53
1010 0.48
1011 0.47
1012 0.43
1013 0.36
1014 0.33
1015 0.3
1016 0.26
1017 0.19
1018 0.19
1019 0.26
1020 0.23
1021 0.26
1022 0.27
1023 0.25
1024 0.24
1025 0.29
1026 0.28
1027 0.22
1028 0.21
1029 0.19
1030 0.17
1031 0.18
1032 0.17
1033 0.13
1034 0.14
1035 0.13
1036 0.13
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.11
1040 0.11
1041 0.1
1042 0.07
1043 0.07
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.08
1047 0.08
1048 0.08
1049 0.07
1050 0.08
1051 0.09
1052 0.08
1053 0.08
1054 0.08
1055 0.11
1056 0.13
1057 0.12
1058 0.11
1059 0.13
1060 0.17
1061 0.18
1062 0.2
1063 0.19
1064 0.2
1065 0.28
1066 0.34
1067 0.34
1068 0.32
1069 0.35
1070 0.37
1071 0.37
1072 0.37
1073 0.35
1074 0.3
1075 0.31
1076 0.38
1077 0.39
1078 0.42
1079 0.43
1080 0.44
1081 0.41
1082 0.49
1083 0.47
1084 0.4
1085 0.35
1086 0.32
1087 0.36
1088 0.33
1089 0.33
1090 0.25
1091 0.25
1092 0.26
1093 0.25
1094 0.22
1095 0.17
1096 0.18
1097 0.16
1098 0.16
1099 0.21
1100 0.22
1101 0.27
1102 0.33
1103 0.4
1104 0.46
1105 0.56
1106 0.63
1107 0.66
1108 0.74
1109 0.79
1110 0.84
1111 0.86
1112 0.9
1113 0.9