Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V1J9

Protein Details
Accession A0A1Y1V1J9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-362NDEGKKDKGKRKLEDNDDDDAcidic
370-401SDDDSDEDKKKKKKKKAKKAKRGIGGTHKTSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-394KKKKKKKKAKKAKRGIG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.833, cyto 6.5, cyto_mito 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDGNPPKKLTFNSQVFDLAFHPKNEIVAAGLLTGEVFCYKYSVEKENELKYQLSEHKKSCRSIEFSLDGNKLYTASLDQSIIEYDANTGKKIYLNSEAHDSPINKILCLNENVMASGDDDGIVKLWDVRENKSIMQWQENEDYISDMKFVPEKRNLLVSGADGYFSVFDIRKKDVYARSDNLDDELLSITLVKNKSKVIVGTQEGILNIFSYGDWGDVSDRFPGHPKSIDALCTIDENTICTGSSDGLIRVISILPNKLVGVIGSHDDYPIEQLKLTHDGKFMGSCSHDNSIKFWDIDYFFNDDGDDEEEEDNYEFAGFAGGSDDDDDDDDEDGEEEDDDDDNDEGKKDKGKRKLEDNDDDDDDSDDDDSDDDSDEDKKKKKKKKAKKAKRGIGGTHKTSGNSFFAGLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.44
3 0.42
4 0.36
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.29
9 0.25
10 0.26
11 0.24
12 0.22
13 0.15
14 0.13
15 0.13
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.07
21 0.06
22 0.05
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.08
27 0.13
28 0.18
29 0.24
30 0.27
31 0.35
32 0.41
33 0.46
34 0.49
35 0.46
36 0.43
37 0.37
38 0.4
39 0.41
40 0.45
41 0.46
42 0.48
43 0.55
44 0.6
45 0.63
46 0.63
47 0.62
48 0.59
49 0.56
50 0.57
51 0.5
52 0.47
53 0.5
54 0.44
55 0.37
56 0.31
57 0.27
58 0.2
59 0.18
60 0.15
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.17
78 0.18
79 0.2
80 0.24
81 0.25
82 0.27
83 0.32
84 0.31
85 0.3
86 0.34
87 0.31
88 0.24
89 0.29
90 0.28
91 0.21
92 0.23
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.24
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.16
102 0.13
103 0.11
104 0.09
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.12
114 0.14
115 0.17
116 0.21
117 0.23
118 0.24
119 0.26
120 0.3
121 0.27
122 0.3
123 0.29
124 0.28
125 0.29
126 0.29
127 0.26
128 0.21
129 0.2
130 0.15
131 0.14
132 0.11
133 0.08
134 0.09
135 0.12
136 0.13
137 0.17
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.24
145 0.19
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.09
156 0.11
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.21
161 0.25
162 0.3
163 0.34
164 0.33
165 0.34
166 0.34
167 0.33
168 0.29
169 0.23
170 0.17
171 0.12
172 0.1
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.13
186 0.17
187 0.18
188 0.17
189 0.18
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.12
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.16
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.13
262 0.2
263 0.22
264 0.21
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.21
269 0.2
270 0.15
271 0.16
272 0.15
273 0.17
274 0.2
275 0.22
276 0.22
277 0.23
278 0.26
279 0.26
280 0.25
281 0.22
282 0.22
283 0.21
284 0.22
285 0.22
286 0.22
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.13
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.12
334 0.19
335 0.27
336 0.35
337 0.45
338 0.54
339 0.6
340 0.69
341 0.77
342 0.8
343 0.8
344 0.76
345 0.72
346 0.66
347 0.59
348 0.49
349 0.41
350 0.31
351 0.22
352 0.18
353 0.12
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.14
362 0.2
363 0.26
364 0.34
365 0.43
366 0.52
367 0.62
368 0.72
369 0.78
370 0.84
371 0.89
372 0.92
373 0.95
374 0.96
375 0.97
376 0.96
377 0.95
378 0.92
379 0.89
380 0.89
381 0.86
382 0.8
383 0.75
384 0.67
385 0.58
386 0.52
387 0.47
388 0.39
389 0.31