FuNGI

A0A1Y1VG24

Protein Details

Accession

A0A1Y1VG24

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
472-495	EEKQKAMDSKKRGKHNKEKPDIIT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
383-386	KARK
481-488	KKRGKHNK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001656 PsdUridine_synth_TruD IPR020119 PsdUridine_synth_TruD_CS IPR011760 PsdUridine_synth_TruD_insert IPR042214 TruD_catalytic
Gene Ontology	GO:0031429 C:box H/ACA snoRNP complex GO:0005737 C:cytoplasm GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000455 P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis GO:1990481 P:mRNA pseudouridine synthesis GO:0031120 P:snRNA pseudouridine synthesis GO:0031119 P:tRNA pseudouridine synthesis
Pfam	View protein in Pfam PF01142 TruD
PROSITE	View protein in PROSITE PS50984 TRUD PS01268 UPF0024
CDD	cd02576 PseudoU_synth_ScPUS7

Amino Acid Sequences

MEDTDNKRKREDNSTNLNPENKKLKNEELIVINNETLNSLKKSNNFKNDFPYEKDVGITKFINENNPGFTVSLKQRYNDFLVNEIDEKGNVVHLTNLKYEKKKVESEVDDSLSQEEKDNKAFELLKDYIKDEEKIEKIKKIVKDNGKDNTVVTTEDIPNKEDRTKLHQFFRKHFSNRIETETKINTVQINIHWANGRNTDMRSSQKGDSYWKQLGGEFCQFTMFKTNKETMNAINIIAYTLYTTSRSLGIAGTKDKRGITVQNVTGYHMTPEKIEKANKHLLAQGIQLGNFKFVKKGLKLGDLKGNLFNITLRKLSIDDNNIIENAIKSLKNIGFINYFGMQRFGTTSLPTYEVGKAILKKNWRKAVDLILMEKIGESERVRKARKIWKDSHDPKKALEEMPKNCTAEISILKAFEKMDQINAYSNALLNIPRNLRMMYVHAYQSYIWNLAATYHIEKYGYKPAIGDLVITEEKQKAMDSKKRGKHNKEKPDIITSENIDKYTIYDVVLPMPGHDIIYPENEIKNYYEDLLKKDDIDPKDMKIINKEYFLPGSYRKLIVKPGNVEWNIIGYNDEDADLALTDLDKINGKEAPINIPDGKFKALQISFSLPTSSYATMALREVTKMDTSIKSIKESGEVIDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.75
3	0.74
4	0.76
5	0.67
6	0.65
7	0.65
8	0.59
9	0.57
10	0.55
11	0.58
12	0.58
13	0.6
14	0.57
15	0.53
16	0.53
17	0.5
18	0.45
19	0.38
20	0.31
21	0.27
22	0.23
23	0.19
24	0.18
25	0.18
26	0.2
27	0.24
28	0.31
29	0.41
30	0.5
31	0.59
32	0.6
33	0.61
34	0.66
35	0.7
36	0.68
37	0.64
38	0.61
39	0.53
40	0.48
41	0.46
42	0.41
43	0.34
44	0.33
45	0.28
46	0.23
47	0.26
48	0.28
49	0.32
50	0.32
51	0.32
52	0.3
53	0.31
54	0.3
55	0.24
56	0.23
57	0.24
58	0.27
59	0.35
60	0.34
61	0.34
62	0.36
63	0.4
64	0.45
65	0.43
66	0.36
67	0.31
68	0.32
69	0.32
70	0.3
71	0.27
72	0.23
73	0.18
74	0.17
75	0.14
76	0.14
77	0.11
78	0.11
79	0.14
80	0.17
81	0.2
82	0.24
83	0.31
84	0.35
85	0.4
86	0.45
87	0.49
88	0.51
89	0.54
90	0.54
91	0.57
92	0.55
93	0.55
94	0.54
95	0.49
96	0.44
97	0.39
98	0.35
99	0.27
100	0.23
101	0.22
102	0.21
103	0.2
104	0.24
105	0.24
106	0.23
107	0.26
108	0.28
109	0.25
110	0.28
111	0.27
112	0.27
113	0.28
114	0.28
115	0.28
116	0.29
117	0.29
118	0.25
119	0.29
120	0.3
121	0.37
122	0.39
123	0.38
124	0.4
125	0.45
126	0.49
127	0.51
128	0.56
129	0.57
130	0.62
131	0.65
132	0.68
133	0.64
134	0.58
135	0.5
136	0.43
137	0.35
138	0.27
139	0.21
140	0.19
141	0.19
142	0.24
143	0.24
144	0.23
145	0.25
146	0.27
147	0.28
148	0.26
149	0.27
150	0.31
151	0.39
152	0.43
153	0.5
154	0.54
155	0.57
156	0.61
157	0.66
158	0.66
159	0.61
160	0.63
161	0.6
162	0.61
163	0.59
164	0.59
165	0.54
166	0.46
167	0.48
168	0.42
169	0.37
170	0.3
171	0.28
172	0.22
173	0.2
174	0.2
175	0.15
176	0.21
177	0.19
178	0.2
179	0.21
180	0.23
181	0.24
182	0.25
183	0.27
184	0.21
185	0.22
186	0.24
187	0.25
188	0.27
189	0.29
190	0.31
191	0.3
192	0.31
193	0.32
194	0.35
195	0.36
196	0.38
197	0.36
198	0.34
199	0.32
200	0.31
201	0.32
202	0.29
203	0.3
204	0.23
205	0.21
206	0.22
207	0.21
208	0.19
209	0.25
210	0.22
211	0.19
212	0.23
213	0.26
214	0.26
215	0.28
216	0.29
217	0.22
218	0.26
219	0.25
220	0.21
221	0.17
222	0.15
223	0.13
224	0.11
225	0.1
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.16
239	0.18
240	0.18
241	0.2
242	0.2
243	0.2
244	0.2
245	0.22
246	0.22
247	0.25
248	0.26
249	0.29
250	0.29
251	0.29
252	0.28
253	0.24
254	0.2
255	0.16
256	0.14
257	0.11
258	0.12
259	0.15
260	0.18
261	0.21
262	0.22
263	0.27
264	0.34
265	0.34
266	0.33
267	0.32
268	0.29
269	0.27
270	0.26
271	0.23
272	0.16
273	0.15
274	0.15
275	0.13
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.11
280	0.13
281	0.17
282	0.16
283	0.22
284	0.21
285	0.28
286	0.3
287	0.32
288	0.36
289	0.33
290	0.33
291	0.29
292	0.27
293	0.19
294	0.17
295	0.16
296	0.11
297	0.12
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.13
303	0.15
304	0.16
305	0.16
306	0.16
307	0.17
308	0.16
309	0.15
310	0.13
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.12
317	0.12
318	0.15
319	0.15
320	0.16
321	0.14
322	0.15
323	0.17
324	0.14
325	0.14
326	0.12
327	0.13
328	0.11
329	0.1
330	0.11
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.1
336	0.12
337	0.12
338	0.13
339	0.12
340	0.11
341	0.12
342	0.13
343	0.15
344	0.17
345	0.2
346	0.27
347	0.32
348	0.4
349	0.47
350	0.46
351	0.46
352	0.45
353	0.49
354	0.46
355	0.41
356	0.35
357	0.27
358	0.26
359	0.23
360	0.2
361	0.13
362	0.08
363	0.09
364	0.08
365	0.14
366	0.2
367	0.28
368	0.3
369	0.32
370	0.4
371	0.47
372	0.56
373	0.58
374	0.6
375	0.6
376	0.69
377	0.76
378	0.78
379	0.78
380	0.69
381	0.62
382	0.6
383	0.56
384	0.48
385	0.47
386	0.44
387	0.4
388	0.44
389	0.46
390	0.4
391	0.37
392	0.34
393	0.26
394	0.21
395	0.19
396	0.17
397	0.15
398	0.15
399	0.15
400	0.16
401	0.16
402	0.14
403	0.16
404	0.13
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.17
409	0.18
410	0.17
411	0.13
412	0.13
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.13
418	0.14
419	0.16
420	0.17
421	0.17
422	0.17
423	0.17
424	0.19
425	0.18
426	0.2
427	0.19
428	0.18
429	0.19
430	0.18
431	0.2
432	0.18
433	0.15
434	0.11
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.11
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.16
446	0.24
447	0.23
448	0.21
449	0.2
450	0.2
451	0.23
452	0.22
453	0.19
454	0.1
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.14
463	0.15
464	0.23
465	0.31
466	0.39
467	0.48
468	0.55
469	0.65
470	0.75
471	0.79
472	0.82
473	0.85
474	0.86
475	0.85
476	0.86
477	0.79
478	0.77
479	0.68
480	0.6
481	0.54
482	0.45
483	0.43
484	0.37
485	0.33
486	0.26
487	0.24
488	0.22
489	0.2
490	0.18
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.14
495	0.16
496	0.15
497	0.12
498	0.14
499	0.14
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.11
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.16
508	0.16
509	0.18
510	0.18
511	0.19
512	0.17
513	0.17
514	0.2
515	0.21
516	0.24
517	0.28
518	0.27
519	0.26
520	0.3
521	0.36
522	0.33
523	0.38
524	0.36
525	0.33
526	0.4
527	0.42
528	0.39
529	0.39
530	0.44
531	0.41
532	0.41
533	0.41
534	0.36
535	0.35
536	0.34
537	0.3
538	0.27
539	0.3
540	0.31
541	0.32
542	0.32
543	0.33
544	0.41
545	0.44
546	0.46
547	0.45
548	0.47
549	0.53
550	0.51
551	0.5
552	0.41
553	0.36
554	0.3
555	0.25
556	0.2
557	0.11
558	0.12
559	0.11
560	0.11
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.05
568	0.06
569	0.07
570	0.08
571	0.11
572	0.12
573	0.14
574	0.16
575	0.17
576	0.2
577	0.22
578	0.26
579	0.25
580	0.3
581	0.3
582	0.3
583	0.34
584	0.31
585	0.33
586	0.28
587	0.27
588	0.31
589	0.29
590	0.29
591	0.29
592	0.32
593	0.3
594	0.3
595	0.31
596	0.22
597	0.24
598	0.25
599	0.22
600	0.17
601	0.18
602	0.18
603	0.18
604	0.18
605	0.18
606	0.16
607	0.16
608	0.16
609	0.17
610	0.18
611	0.18
612	0.21
613	0.21
614	0.25
615	0.31
616	0.32
617	0.33
618	0.34
619	0.34
620	0.33
621	0.32

A0A1Y1VG24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer