Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VD08

Protein Details
Accession A0A1Y1VD08    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-63SEEEKPKPAPKVNQKPKAPKLTKHydrophilic
199-228LEITNKQKAQAKKKKTPKKATIKQAYDNDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-81KPKPAPKVNQKPKAPKLTKAQQRKAEEERKKREREER
206-218KAQAKKKKTPKKA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MDDWENEDFDNIKLPAVKNQWDDEDVESEEEVKDSWDLSESEEEKPKPAPKVNQKPKAPKLTKAQQRKAEEERKKREREERERLENETIEERKLREAKLVQDADFQNTLDLFGADATPRRLTADDASDGEVEGEEKVLIEDMKPKTKDEFKKYGEAVYEEISKYEKNQFYNAMLETLVKKIAEPMEIANVRKLISALQLEITNKQKAQAKKKKTPKKATIKQAYDNDIISDSMKFNYDDGADDYDFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.27
3 0.31
4 0.37
5 0.35
6 0.38
7 0.4
8 0.37
9 0.38
10 0.33
11 0.3
12 0.25
13 0.23
14 0.2
15 0.17
16 0.16
17 0.14
18 0.11
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.12
26 0.19
27 0.2
28 0.23
29 0.3
30 0.3
31 0.3
32 0.34
33 0.37
34 0.36
35 0.41
36 0.47
37 0.52
38 0.63
39 0.72
40 0.77
41 0.8
42 0.84
43 0.86
44 0.88
45 0.8
46 0.76
47 0.75
48 0.75
49 0.76
50 0.76
51 0.76
52 0.74
53 0.76
54 0.75
55 0.75
56 0.76
57 0.76
58 0.76
59 0.77
60 0.78
61 0.78
62 0.78
63 0.78
64 0.78
65 0.79
66 0.79
67 0.77
68 0.77
69 0.74
70 0.71
71 0.64
72 0.54
73 0.45
74 0.41
75 0.33
76 0.25
77 0.24
78 0.21
79 0.24
80 0.26
81 0.24
82 0.23
83 0.25
84 0.27
85 0.34
86 0.35
87 0.3
88 0.33
89 0.33
90 0.3
91 0.28
92 0.24
93 0.16
94 0.14
95 0.14
96 0.08
97 0.07
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.11
128 0.13
129 0.2
130 0.21
131 0.22
132 0.26
133 0.35
134 0.42
135 0.44
136 0.51
137 0.47
138 0.53
139 0.53
140 0.51
141 0.43
142 0.37
143 0.3
144 0.23
145 0.22
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.14
151 0.2
152 0.22
153 0.22
154 0.24
155 0.26
156 0.27
157 0.29
158 0.27
159 0.2
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.1
166 0.09
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.2
180 0.12
181 0.14
182 0.15
183 0.13
184 0.14
185 0.17
186 0.17
187 0.22
188 0.26
189 0.25
190 0.23
191 0.27
192 0.33
193 0.39
194 0.49
195 0.54
196 0.6
197 0.68
198 0.79
199 0.85
200 0.89
201 0.92
202 0.91
203 0.92
204 0.92
205 0.92
206 0.92
207 0.88
208 0.86
209 0.82
210 0.77
211 0.68
212 0.59
213 0.49
214 0.39
215 0.33
216 0.25
217 0.2
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.21