Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VDP4

Protein Details
Accession A0A1Y1VDP4    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MKKHYLPLESKRIKNENKKNCKFEKNIYVDHydrophilic
273-296ESKPVKIISKPSKKKQSVKNIDLCHydrophilic
474-499LEEEKKKHLFKKKKFSFQKYLNKENLHydrophilic
635-662NNNSIYVSKKNFKKRKLNKPYSSFSFLNHydrophilic
749-768WIEFKNKEKNNVKNYRNSLMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
478-487KKKHLFKKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015350  Beta-trefoil_DNA-bd_dom  
IPR036358  BTD_sf  
IPR040159  CLS_fam  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR015351  RBP-J/Cbf11/Cbf12_DNA-bd  
IPR037095  RBP-J/Cbf11_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09271  LAG1-DNAbind  
Amino Acid Sequences MKKHYLPLESKRIKNENKKNCKFEKNIYVDWKNNNKEIFRDLIENFLKYHSNEVTIVLSHSKVAQKSYGSEKRFFCPPPSCRLFGSFWNFNGIINSGISKTNQDNILLKDKNIYHHQTSDMLSPFTLPKLYLSLMSEKEFYQQNNSNNRNINQQNFSICGDLIIEPTRISLKRIIHQKELNEIEQNYNKLIIGSKLKESSNSLINNLKNMELSKTSRYSLNSSLLKKSTDLNIETIGKCLFKQLFISDSDKRKFFSIFVKIMSSDGTHFGTFESKPVKIISKPSKKKQSVKNIDLCITSGSTVALFNRVRSQTISTRYWCLNNDNNFIITSTSDWEEFIIIAANDIDRVIYRQMKKELDYFLYSSISNNNSHSTNYKNNRELLNYILENYEEYYNRYTNYFTKNHLYKTNLEFFPYNFYLIKQRLKSLPLNYLNSQDYIPIRYNQEIVLQHSSTKLISSVFIIRKIEGKTRVVLEEEKKKHLFKKKKFSFQKYLNKENLENLDTVDRKNQDNEVYIQLQRKNYDQNYNPDTYIGDPLSQLHKVALQVKEDPSLYLCAVNEKIGWIRGFGVNKVSAKKKKIDDIIVYEDIPESAVWTIVGTEQMKYSFILPLNNINNNDNEKSESDSKAFDYLTNNNNSIYVSKKNFKKRKLNKPYSSFSFLNSQLQKFKFHISYPLNCIPKIFKVTLHENKKIITVKGKNFLYGNLNASSKILLQNSLKGFLGPFMVLNTEIKSDEIIIIHIPHYLYEWIEFKNKEKNNVKNYRNSLMMTDYQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.82
4 0.85
5 0.89
6 0.9
7 0.89
8 0.89
9 0.85
10 0.84
11 0.83
12 0.8
13 0.78
14 0.78
15 0.77
16 0.73
17 0.75
18 0.76
19 0.7
20 0.68
21 0.65
22 0.57
23 0.53
24 0.51
25 0.46
26 0.39
27 0.39
28 0.34
29 0.38
30 0.38
31 0.35
32 0.32
33 0.3
34 0.3
35 0.25
36 0.31
37 0.23
38 0.24
39 0.23
40 0.24
41 0.23
42 0.21
43 0.22
44 0.18
45 0.17
46 0.15
47 0.18
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.26
52 0.25
53 0.3
54 0.4
55 0.44
56 0.44
57 0.5
58 0.5
59 0.49
60 0.55
61 0.53
62 0.5
63 0.51
64 0.51
65 0.54
66 0.57
67 0.56
68 0.5
69 0.52
70 0.48
71 0.46
72 0.5
73 0.45
74 0.4
75 0.43
76 0.41
77 0.37
78 0.35
79 0.28
80 0.21
81 0.17
82 0.17
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.17
88 0.21
89 0.22
90 0.24
91 0.27
92 0.3
93 0.39
94 0.36
95 0.34
96 0.36
97 0.36
98 0.39
99 0.43
100 0.44
101 0.39
102 0.41
103 0.43
104 0.4
105 0.4
106 0.4
107 0.34
108 0.28
109 0.24
110 0.23
111 0.22
112 0.19
113 0.18
114 0.13
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.17
120 0.21
121 0.22
122 0.24
123 0.24
124 0.22
125 0.25
126 0.26
127 0.24
128 0.27
129 0.31
130 0.38
131 0.47
132 0.5
133 0.52
134 0.55
135 0.55
136 0.56
137 0.55
138 0.53
139 0.47
140 0.46
141 0.42
142 0.38
143 0.38
144 0.3
145 0.24
146 0.18
147 0.16
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.16
155 0.15
156 0.17
157 0.21
158 0.24
159 0.3
160 0.4
161 0.44
162 0.47
163 0.51
164 0.51
165 0.54
166 0.54
167 0.49
168 0.44
169 0.4
170 0.38
171 0.38
172 0.37
173 0.29
174 0.25
175 0.23
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.2
180 0.21
181 0.24
182 0.27
183 0.27
184 0.28
185 0.31
186 0.3
187 0.3
188 0.29
189 0.28
190 0.3
191 0.3
192 0.32
193 0.29
194 0.26
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.18
199 0.21
200 0.23
201 0.25
202 0.25
203 0.27
204 0.29
205 0.31
206 0.31
207 0.36
208 0.37
209 0.37
210 0.41
211 0.39
212 0.38
213 0.34
214 0.32
215 0.29
216 0.28
217 0.27
218 0.23
219 0.25
220 0.28
221 0.27
222 0.26
223 0.22
224 0.18
225 0.16
226 0.2
227 0.16
228 0.13
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.19
233 0.25
234 0.26
235 0.34
236 0.36
237 0.35
238 0.35
239 0.34
240 0.32
241 0.29
242 0.3
243 0.3
244 0.29
245 0.29
246 0.3
247 0.28
248 0.28
249 0.26
250 0.19
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.15
260 0.16
261 0.14
262 0.16
263 0.17
264 0.2
265 0.19
266 0.29
267 0.36
268 0.44
269 0.52
270 0.61
271 0.7
272 0.75
273 0.81
274 0.81
275 0.82
276 0.81
277 0.81
278 0.79
279 0.72
280 0.66
281 0.57
282 0.48
283 0.38
284 0.27
285 0.2
286 0.12
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.24
299 0.24
300 0.3
301 0.33
302 0.29
303 0.32
304 0.32
305 0.33
306 0.31
307 0.31
308 0.32
309 0.32
310 0.34
311 0.31
312 0.3
313 0.28
314 0.26
315 0.21
316 0.14
317 0.1
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.05
336 0.07
337 0.13
338 0.15
339 0.2
340 0.25
341 0.27
342 0.28
343 0.3
344 0.3
345 0.27
346 0.27
347 0.23
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.14
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.24
362 0.31
363 0.36
364 0.37
365 0.39
366 0.4
367 0.4
368 0.37
369 0.3
370 0.26
371 0.2
372 0.18
373 0.15
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.16
386 0.21
387 0.22
388 0.22
389 0.29
390 0.32
391 0.34
392 0.36
393 0.35
394 0.34
395 0.37
396 0.42
397 0.34
398 0.33
399 0.31
400 0.27
401 0.3
402 0.26
403 0.23
404 0.15
405 0.16
406 0.2
407 0.23
408 0.28
409 0.23
410 0.26
411 0.26
412 0.3
413 0.34
414 0.31
415 0.37
416 0.36
417 0.39
418 0.37
419 0.39
420 0.35
421 0.32
422 0.29
423 0.22
424 0.17
425 0.16
426 0.17
427 0.15
428 0.17
429 0.16
430 0.17
431 0.15
432 0.2
433 0.18
434 0.2
435 0.22
436 0.2
437 0.19
438 0.19
439 0.19
440 0.14
441 0.13
442 0.1
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.15
447 0.15
448 0.18
449 0.19
450 0.18
451 0.22
452 0.24
453 0.28
454 0.26
455 0.26
456 0.25
457 0.26
458 0.27
459 0.24
460 0.27
461 0.27
462 0.33
463 0.34
464 0.38
465 0.39
466 0.41
467 0.47
468 0.53
469 0.58
470 0.58
471 0.66
472 0.69
473 0.78
474 0.85
475 0.86
476 0.85
477 0.85
478 0.86
479 0.82
480 0.81
481 0.76
482 0.69
483 0.61
484 0.55
485 0.48
486 0.39
487 0.32
488 0.24
489 0.24
490 0.22
491 0.22
492 0.23
493 0.21
494 0.21
495 0.22
496 0.24
497 0.21
498 0.23
499 0.24
500 0.24
501 0.24
502 0.26
503 0.29
504 0.3
505 0.31
506 0.3
507 0.3
508 0.34
509 0.35
510 0.41
511 0.4
512 0.45
513 0.47
514 0.48
515 0.45
516 0.38
517 0.35
518 0.27
519 0.26
520 0.18
521 0.13
522 0.11
523 0.13
524 0.16
525 0.15
526 0.14
527 0.11
528 0.12
529 0.14
530 0.2
531 0.21
532 0.2
533 0.24
534 0.25
535 0.27
536 0.25
537 0.23
538 0.18
539 0.18
540 0.16
541 0.14
542 0.13
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.13
547 0.12
548 0.13
549 0.15
550 0.15
551 0.12
552 0.14
553 0.17
554 0.19
555 0.18
556 0.2
557 0.21
558 0.24
559 0.29
560 0.35
561 0.38
562 0.41
563 0.48
564 0.49
565 0.53
566 0.57
567 0.58
568 0.54
569 0.53
570 0.56
571 0.5
572 0.45
573 0.37
574 0.31
575 0.24
576 0.19
577 0.13
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.1
586 0.09
587 0.1
588 0.11
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.14
594 0.15
595 0.17
596 0.17
597 0.25
598 0.29
599 0.33
600 0.34
601 0.31
602 0.34
603 0.36
604 0.36
605 0.29
606 0.27
607 0.23
608 0.27
609 0.3
610 0.29
611 0.25
612 0.25
613 0.25
614 0.25
615 0.25
616 0.21
617 0.21
618 0.25
619 0.3
620 0.32
621 0.32
622 0.29
623 0.29
624 0.28
625 0.25
626 0.23
627 0.24
628 0.26
629 0.34
630 0.42
631 0.53
632 0.61
633 0.7
634 0.77
635 0.8
636 0.85
637 0.88
638 0.91
639 0.9
640 0.9
641 0.88
642 0.84
643 0.81
644 0.7
645 0.61
646 0.56
647 0.48
648 0.49
649 0.45
650 0.41
651 0.41
652 0.42
653 0.44
654 0.4
655 0.44
656 0.39
657 0.36
658 0.42
659 0.41
660 0.45
661 0.49
662 0.55
663 0.52
664 0.48
665 0.48
666 0.42
667 0.42
668 0.42
669 0.35
670 0.31
671 0.34
672 0.45
673 0.53
674 0.58
675 0.58
676 0.53
677 0.53
678 0.56
679 0.54
680 0.48
681 0.48
682 0.48
683 0.49
684 0.57
685 0.57
686 0.53
687 0.49
688 0.49
689 0.45
690 0.39
691 0.36
692 0.3
693 0.3
694 0.27
695 0.27
696 0.24
697 0.2
698 0.22
699 0.19
700 0.21
701 0.22
702 0.29
703 0.3
704 0.32
705 0.3
706 0.26
707 0.25
708 0.21
709 0.21
710 0.14
711 0.13
712 0.11
713 0.12
714 0.13
715 0.14
716 0.14
717 0.14
718 0.14
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.14
723 0.13
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.13
728 0.15
729 0.14
730 0.12
731 0.14
732 0.15
733 0.14
734 0.16
735 0.18
736 0.19
737 0.26
738 0.28
739 0.3
740 0.39
741 0.42
742 0.49
743 0.56
744 0.63
745 0.67
746 0.75
747 0.78
748 0.78
749 0.8
750 0.75
751 0.7
752 0.62
753 0.54
754 0.49