Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VGD7

Protein Details
Accession A0A1Y1VGD7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-125QAQKLYQQKQQQQQQRQQQQQQQVLNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037794  TAF12  
IPR003228  TFIID_TAF12_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03847  TFIID_20kDa  
CDD cd07981  TAF12  
Amino Acid Sequences MSQPNKQPNYAQLQHLSLQRQLLLQQQQQQAQTVQNQTQNQLSLQYLPQNLAIQSQSNQLNGATLQLLQQRQQLAAVQQQQYMSKPNYIAQNQINIANLQAQKLYQQKQQQQQQRQQQQQQQVLNRQDNSLQLQKNQNLALTIINELKNVTTSLQQPNLSEIQKQELFKKKSSLEEVIVKIRLIQQQQKEKQMQFQMLQQSRPQQQQQQLANIYQQGLASSSNPNNITQLTQQAQQAQFLSNIANNPALLRQQQQIRLQKQQTSNMINSTNINSIPLQASVSNTSVIPTSSTLSSVTPNLPATSKIAIPLTQTKIEQKASTPTISISNMSSISNEVLNNKSNITVNMSQINNINTSSTPNFAPKSTIATPKQEITISSNLNLKTATISNNNINNLDKLSTKVKTTTETSVSLNATTTASNKKESPIQKQAELLKTQQQQLSPILNKKKESVISSTITKEALNSPYLNKANVNTVASSLITNTPKVTLQKSFSPLGKPTTSIISPANSIKTAKTPTQAPNEISTNIPTKIMTEVKKTQTPTSINNISVPSPLVNLANSRLINNGTNISVVQTAQTTNSLSNNDIKKDSTNFSGQITPTNSINQNFSPIGKPTFDPRLINNKSTPQTNSETTSNKYFSPKINSNLSNSVSSVNSNPSVINQQSLLVKNNIQLDTNKRAPYNNIADIKNNNNNNSMMINNNGLKVLESLKQYGTFTNIIHPKSPFQSTKIFTEVSSTNSITGPALKISGKLLEKRKREEKFHDMVINSNVSTKKRNIKQLVNEVSEKEKLSGYTEQVLFEIADDLIDQMTLFASKIAKHRNSTKIEAKDVQLSLERIWNMKLPGVDIQKNNSKKSNISNIFQQKVNHVRKDMRDRNLLKEMHIQEEQRKQKEIERIEKEKQNTSENATPVATPNTTPKAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.48
4 0.41
5 0.38
6 0.34
7 0.31
8 0.29
9 0.32
10 0.35
11 0.37
12 0.43
13 0.47
14 0.5
15 0.5
16 0.52
17 0.46
18 0.43
19 0.45
20 0.42
21 0.41
22 0.43
23 0.44
24 0.43
25 0.44
26 0.41
27 0.35
28 0.31
29 0.27
30 0.24
31 0.24
32 0.28
33 0.25
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.25
39 0.23
40 0.2
41 0.2
42 0.26
43 0.25
44 0.23
45 0.24
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.18
50 0.12
51 0.1
52 0.14
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.26
60 0.25
61 0.23
62 0.29
63 0.35
64 0.33
65 0.34
66 0.35
67 0.36
68 0.35
69 0.38
70 0.33
71 0.29
72 0.28
73 0.3
74 0.37
75 0.37
76 0.42
77 0.38
78 0.42
79 0.4
80 0.4
81 0.38
82 0.29
83 0.28
84 0.28
85 0.25
86 0.19
87 0.19
88 0.17
89 0.22
90 0.3
91 0.33
92 0.33
93 0.42
94 0.49
95 0.58
96 0.68
97 0.72
98 0.74
99 0.79
100 0.83
101 0.84
102 0.85
103 0.85
104 0.84
105 0.83
106 0.8
107 0.78
108 0.75
109 0.73
110 0.72
111 0.7
112 0.63
113 0.55
114 0.49
115 0.46
116 0.44
117 0.43
118 0.37
119 0.36
120 0.43
121 0.45
122 0.47
123 0.45
124 0.4
125 0.32
126 0.31
127 0.27
128 0.19
129 0.18
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.15
137 0.13
138 0.13
139 0.18
140 0.24
141 0.29
142 0.3
143 0.29
144 0.33
145 0.37
146 0.34
147 0.31
148 0.26
149 0.28
150 0.31
151 0.33
152 0.37
153 0.42
154 0.45
155 0.46
156 0.52
157 0.48
158 0.5
159 0.55
160 0.51
161 0.45
162 0.48
163 0.48
164 0.46
165 0.44
166 0.36
167 0.32
168 0.33
169 0.33
170 0.32
171 0.36
172 0.39
173 0.49
174 0.55
175 0.62
176 0.65
177 0.61
178 0.63
179 0.62
180 0.58
181 0.49
182 0.49
183 0.5
184 0.46
185 0.47
186 0.42
187 0.44
188 0.45
189 0.5
190 0.49
191 0.46
192 0.5
193 0.56
194 0.57
195 0.56
196 0.53
197 0.48
198 0.45
199 0.39
200 0.33
201 0.25
202 0.21
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.15
208 0.15
209 0.19
210 0.2
211 0.2
212 0.21
213 0.21
214 0.21
215 0.18
216 0.22
217 0.2
218 0.22
219 0.23
220 0.28
221 0.28
222 0.28
223 0.27
224 0.22
225 0.2
226 0.18
227 0.17
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.15
238 0.18
239 0.23
240 0.3
241 0.38
242 0.46
243 0.48
244 0.56
245 0.57
246 0.59
247 0.59
248 0.59
249 0.57
250 0.53
251 0.5
252 0.44
253 0.41
254 0.35
255 0.32
256 0.28
257 0.23
258 0.18
259 0.17
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.13
295 0.16
296 0.21
297 0.22
298 0.22
299 0.23
300 0.25
301 0.28
302 0.3
303 0.28
304 0.23
305 0.26
306 0.26
307 0.26
308 0.23
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.2
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.18
331 0.18
332 0.18
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.23
337 0.23
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.1
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.15
347 0.16
348 0.16
349 0.18
350 0.15
351 0.21
352 0.22
353 0.29
354 0.29
355 0.32
356 0.33
357 0.32
358 0.33
359 0.27
360 0.24
361 0.21
362 0.24
363 0.2
364 0.2
365 0.23
366 0.21
367 0.21
368 0.2
369 0.16
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.16
375 0.2
376 0.23
377 0.24
378 0.23
379 0.23
380 0.2
381 0.18
382 0.17
383 0.13
384 0.12
385 0.15
386 0.15
387 0.16
388 0.18
389 0.18
390 0.2
391 0.23
392 0.24
393 0.23
394 0.23
395 0.23
396 0.23
397 0.22
398 0.19
399 0.16
400 0.14
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.13
405 0.14
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.23
410 0.27
411 0.33
412 0.38
413 0.38
414 0.38
415 0.42
416 0.45
417 0.42
418 0.39
419 0.33
420 0.31
421 0.32
422 0.34
423 0.31
424 0.27
425 0.25
426 0.26
427 0.29
428 0.25
429 0.29
430 0.32
431 0.33
432 0.34
433 0.33
434 0.34
435 0.32
436 0.31
437 0.29
438 0.26
439 0.26
440 0.27
441 0.26
442 0.23
443 0.21
444 0.18
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.18
452 0.19
453 0.19
454 0.17
455 0.16
456 0.17
457 0.19
458 0.18
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.11
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.12
471 0.14
472 0.16
473 0.15
474 0.17
475 0.21
476 0.24
477 0.26
478 0.26
479 0.27
480 0.27
481 0.28
482 0.25
483 0.23
484 0.2
485 0.2
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.13
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.15
497 0.17
498 0.17
499 0.18
500 0.22
501 0.27
502 0.34
503 0.36
504 0.34
505 0.34
506 0.34
507 0.33
508 0.28
509 0.25
510 0.2
511 0.17
512 0.16
513 0.13
514 0.12
515 0.14
516 0.19
517 0.18
518 0.22
519 0.27
520 0.31
521 0.35
522 0.36
523 0.34
524 0.36
525 0.37
526 0.34
527 0.36
528 0.35
529 0.32
530 0.32
531 0.31
532 0.26
533 0.23
534 0.2
535 0.13
536 0.1
537 0.1
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.13
546 0.14
547 0.15
548 0.15
549 0.14
550 0.1
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.11
565 0.12
566 0.18
567 0.2
568 0.21
569 0.22
570 0.22
571 0.22
572 0.25
573 0.26
574 0.22
575 0.23
576 0.22
577 0.22
578 0.25
579 0.22
580 0.24
581 0.24
582 0.22
583 0.2
584 0.23
585 0.24
586 0.22
587 0.24
588 0.19
589 0.21
590 0.2
591 0.2
592 0.19
593 0.18
594 0.19
595 0.18
596 0.19
597 0.19
598 0.26
599 0.27
600 0.26
601 0.28
602 0.37
603 0.39
604 0.42
605 0.4
606 0.41
607 0.4
608 0.42
609 0.39
610 0.33
611 0.35
612 0.34
613 0.35
614 0.32
615 0.33
616 0.32
617 0.36
618 0.32
619 0.29
620 0.31
621 0.3
622 0.3
623 0.36
624 0.39
625 0.39
626 0.45
627 0.46
628 0.46
629 0.48
630 0.45
631 0.37
632 0.32
633 0.29
634 0.21
635 0.21
636 0.18
637 0.16
638 0.15
639 0.14
640 0.13
641 0.13
642 0.18
643 0.17
644 0.17
645 0.14
646 0.15
647 0.19
648 0.21
649 0.22
650 0.19
651 0.2
652 0.22
653 0.27
654 0.26
655 0.23
656 0.24
657 0.28
658 0.33
659 0.38
660 0.38
661 0.33
662 0.34
663 0.36
664 0.41
665 0.41
666 0.41
667 0.41
668 0.39
669 0.42
670 0.44
671 0.48
672 0.48
673 0.45
674 0.39
675 0.36
676 0.36
677 0.33
678 0.31
679 0.25
680 0.19
681 0.17
682 0.19
683 0.17
684 0.17
685 0.16
686 0.15
687 0.14
688 0.14
689 0.15
690 0.15
691 0.16
692 0.17
693 0.18
694 0.2
695 0.2
696 0.2
697 0.21
698 0.19
699 0.17
700 0.23
701 0.28
702 0.27
703 0.3
704 0.31
705 0.3
706 0.32
707 0.39
708 0.33
709 0.31
710 0.38
711 0.38
712 0.4
713 0.4
714 0.37
715 0.3
716 0.32
717 0.3
718 0.25
719 0.27
720 0.23
721 0.2
722 0.2
723 0.21
724 0.16
725 0.17
726 0.14
727 0.11
728 0.13
729 0.12
730 0.13
731 0.13
732 0.19
733 0.21
734 0.28
735 0.37
736 0.44
737 0.5
738 0.58
739 0.67
740 0.68
741 0.72
742 0.73
743 0.73
744 0.69
745 0.69
746 0.66
747 0.57
748 0.53
749 0.48
750 0.42
751 0.32
752 0.31
753 0.28
754 0.25
755 0.3
756 0.33
757 0.39
758 0.45
759 0.55
760 0.59
761 0.64
762 0.71
763 0.77
764 0.78
765 0.73
766 0.68
767 0.6
768 0.55
769 0.49
770 0.41
771 0.32
772 0.25
773 0.21
774 0.23
775 0.25
776 0.24
777 0.28
778 0.28
779 0.27
780 0.26
781 0.26
782 0.21
783 0.17
784 0.16
785 0.08
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.06
790 0.06
791 0.05
792 0.04
793 0.05
794 0.05
795 0.05
796 0.07
797 0.08
798 0.12
799 0.19
800 0.29
801 0.34
802 0.4
803 0.49
804 0.57
805 0.62
806 0.67
807 0.69
808 0.65
809 0.67
810 0.65
811 0.59
812 0.56
813 0.5
814 0.44
815 0.39
816 0.35
817 0.29
818 0.31
819 0.29
820 0.23
821 0.25
822 0.26
823 0.23
824 0.25
825 0.24
826 0.2
827 0.27
828 0.33
829 0.37
830 0.36
831 0.41
832 0.48
833 0.53
834 0.56
835 0.55
836 0.51
837 0.5
838 0.56
839 0.61
840 0.58
841 0.55
842 0.61
843 0.63
844 0.64
845 0.62
846 0.55
847 0.53
848 0.57
849 0.62
850 0.58
851 0.55
852 0.59
853 0.65
854 0.75
855 0.75
856 0.72
857 0.73
858 0.71
859 0.73
860 0.74
861 0.65
862 0.57
863 0.58
864 0.53
865 0.49
866 0.5
867 0.45
868 0.45
869 0.54
870 0.6
871 0.55
872 0.57
873 0.53
874 0.56
875 0.62
876 0.63
877 0.63
878 0.64
879 0.67
880 0.71
881 0.76
882 0.74
883 0.73
884 0.68
885 0.64
886 0.58
887 0.58
888 0.57
889 0.51
890 0.49
891 0.41
892 0.37
893 0.33
894 0.34
895 0.27
896 0.22
897 0.28