Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EPG4

Protein Details
Accession H0EPG4    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26AGNPNMQKIGKRKNQPPREKADWLFHydrophilic
28-53ASDPSKTTSKQPQAQKTKQEKKLATEHydrophilic
134-160NATKTSTKEKEPKKTKAEKVKQAKAQPHydrophilic
434-457DPPLPPEPVKKNTKKSNAPFSRIPHydrophilic
484-511LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-157EKEPKKTKAEKVKQAK
224-236ASPKPKAKSLKRK
491-503GFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGNPNMQKIGKRKNQPPREKADWLFPASDPSKTTSKQPQAQKTKQEKKLATELLKRAAGTSATMPSSQLLDLVGAFLSEHEFTGTSRTLLTERRQRGEPASHSSPNTPPLTTIFDEWVALKETKPAVVEVVNNATKTSTKEKEPKKTKAEKVKQAKAQPAKSSSSDSDSSESEASDVEMADAPPVKKGSSRKSASSSSSSSDSSSSSDSDADDEKEVPSTKAASPKPKAKSLKRKASSPSDSSSAADSSSEDEAPKTKKAKVAVSASSDSSSSDSSSDSSSEEEETGKKETVKGDADSSSSDSSDSSSDSESGSDGKVKVEKGAKTSESSDSDSSSSSDSDSDSDSDSSTQSNAQKVALPDSESESSDSDSDMEDEAKVTGTSDTSATLSDGAKKSASSDSDSDSSSSSESDTDPKPAKTKKTVVITTAMAIDPPLPPEPVKKNTKKSNAPFSRIPKDTVVDERLASNAYVPYDYAQKAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVEGKKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.84
3 0.88
4 0.88
5 0.86
6 0.85
7 0.84
8 0.76
9 0.75
10 0.7
11 0.63
12 0.57
13 0.47
14 0.47
15 0.41
16 0.41
17 0.32
18 0.3
19 0.33
20 0.32
21 0.39
22 0.41
23 0.5
24 0.55
25 0.63
26 0.7
27 0.74
28 0.81
29 0.85
30 0.85
31 0.86
32 0.87
33 0.87
34 0.81
35 0.76
36 0.78
37 0.75
38 0.72
39 0.7
40 0.67
41 0.63
42 0.61
43 0.54
44 0.45
45 0.39
46 0.31
47 0.24
48 0.22
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.16
56 0.13
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.2
78 0.28
79 0.34
80 0.39
81 0.43
82 0.46
83 0.47
84 0.51
85 0.53
86 0.51
87 0.49
88 0.5
89 0.5
90 0.48
91 0.49
92 0.46
93 0.44
94 0.41
95 0.32
96 0.27
97 0.25
98 0.29
99 0.27
100 0.25
101 0.21
102 0.19
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.17
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.16
116 0.17
117 0.15
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.18
124 0.21
125 0.26
126 0.24
127 0.3
128 0.39
129 0.48
130 0.58
131 0.66
132 0.71
133 0.74
134 0.8
135 0.82
136 0.84
137 0.85
138 0.85
139 0.86
140 0.85
141 0.82
142 0.78
143 0.78
144 0.75
145 0.71
146 0.67
147 0.61
148 0.56
149 0.5
150 0.48
151 0.41
152 0.37
153 0.33
154 0.28
155 0.26
156 0.23
157 0.23
158 0.19
159 0.17
160 0.13
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.1
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.15
175 0.21
176 0.28
177 0.35
178 0.38
179 0.4
180 0.45
181 0.48
182 0.48
183 0.46
184 0.4
185 0.33
186 0.32
187 0.29
188 0.25
189 0.21
190 0.18
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.2
210 0.24
211 0.3
212 0.35
213 0.42
214 0.46
215 0.51
216 0.58
217 0.6
218 0.68
219 0.7
220 0.76
221 0.71
222 0.73
223 0.7
224 0.71
225 0.67
226 0.59
227 0.51
228 0.43
229 0.4
230 0.35
231 0.3
232 0.21
233 0.15
234 0.12
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.22
247 0.25
248 0.28
249 0.31
250 0.34
251 0.32
252 0.34
253 0.33
254 0.3
255 0.27
256 0.24
257 0.18
258 0.14
259 0.12
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.14
279 0.17
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.18
285 0.17
286 0.18
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.17
308 0.22
309 0.23
310 0.23
311 0.28
312 0.27
313 0.27
314 0.3
315 0.29
316 0.27
317 0.28
318 0.26
319 0.23
320 0.22
321 0.2
322 0.19
323 0.15
324 0.12
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.13
339 0.14
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.19
344 0.19
345 0.23
346 0.2
347 0.19
348 0.17
349 0.21
350 0.22
351 0.19
352 0.2
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.1
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.17
382 0.16
383 0.18
384 0.21
385 0.22
386 0.2
387 0.21
388 0.23
389 0.25
390 0.26
391 0.24
392 0.2
393 0.19
394 0.16
395 0.14
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.15
400 0.15
401 0.21
402 0.24
403 0.26
404 0.34
405 0.39
406 0.45
407 0.48
408 0.54
409 0.56
410 0.61
411 0.62
412 0.57
413 0.55
414 0.48
415 0.41
416 0.36
417 0.28
418 0.18
419 0.15
420 0.14
421 0.1
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.2
427 0.28
428 0.35
429 0.45
430 0.52
431 0.6
432 0.69
433 0.78
434 0.82
435 0.82
436 0.85
437 0.83
438 0.81
439 0.79
440 0.78
441 0.77
442 0.69
443 0.65
444 0.57
445 0.51
446 0.48
447 0.46
448 0.42
449 0.34
450 0.32
451 0.29
452 0.27
453 0.25
454 0.21
455 0.16
456 0.14
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.14
461 0.18
462 0.19
463 0.18
464 0.17
465 0.19
466 0.2
467 0.21
468 0.22
469 0.18
470 0.18
471 0.24
472 0.27
473 0.25
474 0.25
475 0.26
476 0.25
477 0.29
478 0.34
479 0.37
480 0.44
481 0.55
482 0.64
483 0.73
484 0.82
485 0.85
486 0.9
487 0.91
488 0.9
489 0.91
490 0.88
491 0.86
492 0.84
493 0.79
494 0.68
495 0.58
496 0.57
497 0.46
498 0.42
499 0.34
500 0.27
501 0.23