FuNGI

A0A1Y1VGM7

Protein Details

Accession

A0A1Y1VGM7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
249-272	EQKDKNSKTANNKKTNNKNAKPIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
262-276	KTNNKNAKPIVKAKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 15.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C
Gene Ontology	GO:0055087 C:Ski complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030968 P:endoplasmic reticulum unfolded protein response GO:0070478 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay GO:0070481 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MDLNEKHKKWAHKVDITDSFPEFYDLIPEMAHEFPFELDVFQKQAIFHLENGDSVFIAAHTSAGKTVVADYAIALAQKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFHNTFEDIGIITGDVKINQNASCLIMTTEILRSMLYKGADVIRDVEFVIFDEVHYINDSERGVVWEEVIIMLPEHVKLILLSATVPNTMEFAEWIGRTKKKNIYVISTLKRPVPLEHYLFVKNNIFKIVDAQQNFLKNNYDAANEALTGEQKDKNSKTANNKKTNNKNAKPIVKAKKPISKMQTTRNMYNHMVGFLAKNELLPVVVFTFSKKKCEEYADGLINKDLLNDANKRSIIYSFISNSLSRLKGSDKDLPQINRMKELLSRGIGVHHSGLLPIMKEVVEILFSKGLVKVLFATETFAMGVNMPARAVVFSELRKHDGQKFRDLLSNEYIQMSGRAGRRGLDDTGVVIIATLDKLPEIQTINNVVLGKSQKLESQFRLTYNMILNLLRVETLRVEEMIKRSFSENVSQAALPEQQQEYEKNNEILKNMEELSCVICKIDIDLYYNYTKDILGLNKQIHGKVISSSNNQRIFCAGRVLIINNEKYHRSIAVILKVSTKIHNNIIMSSEEDKKLIHCLIVHEDIDPDQQIKMLYNPIVNGKLKISEINNVKSTIQALTYVDIELITSIIIKIDQDSILNHNESVISSVQQELIRIAKSFNDSEQIEECSWKKIKDIEFQESHKNKTLLLEKIKSFKCNNCPDFKDHYNIISEKKKIESKINKLFINLSENNLQLLPDYNQRIDVLKFLRYIDDNLTVQLKGKIACEISTCDELLLTELVLDNFFAEFDLAESAALLSCFIFQEKSQNEPALTSNLEKGIAKIKDMALNIADIQRSFNIDISTQDYVNTVNIGLVEVVYEWAKGVPFKQITELTDVLEGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.76
3	0.71
4	0.65
5	0.56
6	0.47
7	0.39
8	0.36
9	0.27
10	0.18
11	0.18
12	0.16
13	0.15
14	0.13
15	0.13
16	0.14
17	0.15
18	0.16
19	0.12
20	0.11
21	0.11
22	0.13
23	0.13
24	0.11
25	0.11
26	0.13
27	0.15
28	0.16
29	0.17
30	0.15
31	0.18
32	0.23
33	0.23
34	0.22
35	0.26
36	0.25
37	0.25
38	0.25
39	0.23
40	0.16
41	0.14
42	0.13
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.08
49	0.09
50	0.1
51	0.1
52	0.09
53	0.1
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.09
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.1
62	0.09
63	0.13
64	0.14
65	0.15
66	0.16
67	0.17
68	0.17
69	0.2
70	0.23
71	0.27
72	0.29
73	0.3
74	0.29
75	0.31
76	0.31
77	0.35
78	0.41
79	0.42
80	0.5
81	0.51
82	0.56
83	0.57
84	0.59
85	0.64
86	0.56
87	0.5
88	0.48
89	0.47
90	0.4
91	0.37
92	0.35
93	0.24
94	0.22
95	0.17
96	0.1
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.11
102	0.12
103	0.14
104	0.14
105	0.16
106	0.15
107	0.16
108	0.15
109	0.14
110	0.13
111	0.11
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.11
116	0.12
117	0.11
118	0.11
119	0.12
120	0.15
121	0.14
122	0.12
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.18
127	0.19
128	0.16
129	0.16
130	0.17
131	0.14
132	0.11
133	0.11
134	0.12
135	0.1
136	0.08
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.13
141	0.12
142	0.1
143	0.13
144	0.13
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.14
149	0.13
150	0.13
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.08
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.08
178	0.1
179	0.1
180	0.14
181	0.2
182	0.24
183	0.28
184	0.35
185	0.41
186	0.45
187	0.52
188	0.52
189	0.53
190	0.57
191	0.63
192	0.61
193	0.58
194	0.53
195	0.48
196	0.47
197	0.41
198	0.36
199	0.33
200	0.34
201	0.33
202	0.33
203	0.34
204	0.35
205	0.35
206	0.35
207	0.35
208	0.3
209	0.28
210	0.28
211	0.25
212	0.21
213	0.24
214	0.27
215	0.27
216	0.26
217	0.28
218	0.29
219	0.33
220	0.33
221	0.3
222	0.28
223	0.22
224	0.24
225	0.22
226	0.2
227	0.16
228	0.17
229	0.16
230	0.13
231	0.13
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.12
236	0.14
237	0.15
238	0.22
239	0.23
240	0.29
241	0.34
242	0.39
243	0.48
244	0.56
245	0.64
246	0.67
247	0.74
248	0.78
249	0.83
250	0.87
251	0.87
252	0.81
253	0.8
254	0.79
255	0.78
256	0.74
257	0.74
258	0.73
259	0.7
260	0.73
261	0.71
262	0.7
263	0.68
264	0.69
265	0.66
266	0.66
267	0.63
268	0.65
269	0.67
270	0.64
271	0.66
272	0.62
273	0.6
274	0.51
275	0.5
276	0.41
277	0.31
278	0.26
279	0.2
280	0.17
281	0.13
282	0.13
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.08
294	0.17
295	0.18
296	0.23
297	0.23
298	0.25
299	0.28
300	0.33
301	0.35
302	0.33
303	0.39
304	0.39
305	0.39
306	0.37
307	0.34
308	0.29
309	0.24
310	0.18
311	0.12
312	0.08
313	0.1
314	0.13
315	0.15
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.19
320	0.19
321	0.17
322	0.16
323	0.17
324	0.14
325	0.16
326	0.18
327	0.17
328	0.18
329	0.19
330	0.18
331	0.15
332	0.15
333	0.16
334	0.18
335	0.23
336	0.29
337	0.27
338	0.31
339	0.37
340	0.37
341	0.4
342	0.43
343	0.39
344	0.35
345	0.34
346	0.3
347	0.26
348	0.28
349	0.25
350	0.19
351	0.19
352	0.15
353	0.17
354	0.16
355	0.15
356	0.12
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.09
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.07
383	0.09
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.08
400	0.09
401	0.14
402	0.15
403	0.19
404	0.2
405	0.22
406	0.28
407	0.35
408	0.36
409	0.39
410	0.4
411	0.38
412	0.42
413	0.4
414	0.35
415	0.3
416	0.28
417	0.21
418	0.19
419	0.18
420	0.13
421	0.12
422	0.1
423	0.11
424	0.12
425	0.13
426	0.12
427	0.13
428	0.15
429	0.17
430	0.17
431	0.13
432	0.11
433	0.1
434	0.1
435	0.09
436	0.07
437	0.05
438	0.04
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.04
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.1
451	0.1
452	0.12
453	0.12
454	0.1
455	0.12
456	0.13
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.16
462	0.19
463	0.19
464	0.24
465	0.25
466	0.25
467	0.29
468	0.27
469	0.25
470	0.23
471	0.21
472	0.16
473	0.14
474	0.14
475	0.1
476	0.1
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.09
486	0.12
487	0.14
488	0.14
489	0.14
490	0.15
491	0.17
492	0.17
493	0.19
494	0.18
495	0.17
496	0.18
497	0.17
498	0.16
499	0.15
500	0.15
501	0.12
502	0.12
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.14
507	0.16
508	0.19
509	0.2
510	0.2
511	0.22
512	0.22
513	0.21
514	0.21
515	0.18
516	0.16
517	0.15
518	0.13
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.1
523	0.1
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.07
528	0.09
529	0.08
530	0.11
531	0.11
532	0.14
533	0.15
534	0.16
535	0.15
536	0.13
537	0.12
538	0.1
539	0.12
540	0.11
541	0.13
542	0.18
543	0.18
544	0.22
545	0.23
546	0.23
547	0.21
548	0.2
549	0.18
550	0.15
551	0.19
552	0.19
553	0.23
554	0.28
555	0.35
556	0.39
557	0.39
558	0.37
559	0.34
560	0.33
561	0.29
562	0.27
563	0.19
564	0.15
565	0.16
566	0.16
567	0.18
568	0.19
569	0.21
570	0.19
571	0.21
572	0.2
573	0.21
574	0.21
575	0.17
576	0.15
577	0.18
578	0.2
579	0.24
580	0.26
581	0.25
582	0.26
583	0.27
584	0.27
585	0.24
586	0.24
587	0.21
588	0.21
589	0.24
590	0.23
591	0.22
592	0.23
593	0.21
594	0.2
595	0.2
596	0.2
597	0.17
598	0.17
599	0.16
600	0.15
601	0.17
602	0.15
603	0.13
604	0.11
605	0.13
606	0.18
607	0.21
608	0.2
609	0.17
610	0.17
611	0.17
612	0.17
613	0.15
614	0.11
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.1
620	0.12
621	0.13
622	0.13
623	0.14
624	0.16
625	0.2
626	0.21
627	0.2
628	0.18
629	0.18
630	0.18
631	0.21
632	0.19
633	0.22
634	0.26
635	0.3
636	0.31
637	0.3
638	0.3
639	0.27
640	0.27
641	0.2
642	0.15
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.11
648	0.09
649	0.08
650	0.08
651	0.06
652	0.05
653	0.04
654	0.04
655	0.03
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.05
660	0.07
661	0.07
662	0.08
663	0.09
664	0.12
665	0.15
666	0.16
667	0.15
668	0.13
669	0.13
670	0.13
671	0.14
672	0.11
673	0.09
674	0.09
675	0.1
676	0.13
677	0.13
678	0.13
679	0.12
680	0.14
681	0.14
682	0.14
683	0.14
684	0.14
685	0.17
686	0.18
687	0.17
688	0.21
689	0.2
690	0.22
691	0.24
692	0.24
693	0.21
694	0.23
695	0.23
696	0.24
697	0.27
698	0.24
699	0.25
700	0.28
701	0.33
702	0.39
703	0.45
704	0.46
705	0.49
706	0.52
707	0.6
708	0.57
709	0.56
710	0.54
711	0.48
712	0.4
713	0.41
714	0.44
715	0.42
716	0.46
717	0.47
718	0.44
719	0.52
720	0.54
721	0.54
722	0.52
723	0.52
724	0.54
725	0.59
726	0.61
727	0.61
728	0.62
729	0.63
730	0.66
731	0.62
732	0.58
733	0.49
734	0.46
735	0.43
736	0.41
737	0.42
738	0.4
739	0.39
740	0.36
741	0.4
742	0.43
743	0.41
744	0.5
745	0.53
746	0.56
747	0.64
748	0.68
749	0.63
750	0.59
751	0.59
752	0.51
753	0.49
754	0.4
755	0.34
756	0.3
757	0.3
758	0.29
759	0.26
760	0.23
761	0.15
762	0.17
763	0.15
764	0.18
765	0.22
766	0.21
767	0.22
768	0.23
769	0.26
770	0.23
771	0.27
772	0.23
773	0.23
774	0.24
775	0.23
776	0.26
777	0.25
778	0.27
779	0.25
780	0.28
781	0.25
782	0.25
783	0.26
784	0.23
785	0.23
786	0.23
787	0.21
788	0.17
789	0.18
790	0.2
791	0.19
792	0.2
793	0.21
794	0.22
795	0.24
796	0.25
797	0.24
798	0.2
799	0.19
800	0.17
801	0.17
802	0.13
803	0.08
804	0.07
805	0.08
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.05
814	0.05
815	0.06
816	0.07
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.07
822	0.07
823	0.06
824	0.05
825	0.06
826	0.07
827	0.08
828	0.09
829	0.09
830	0.19
831	0.21
832	0.26
833	0.3
834	0.32
835	0.32
836	0.32
837	0.34
838	0.29
839	0.28
840	0.26
841	0.23
842	0.21
843	0.23
844	0.21
845	0.21
846	0.26
847	0.24
848	0.24
849	0.25
850	0.27
851	0.3
852	0.31
853	0.31
854	0.23
855	0.24
856	0.24
857	0.23
858	0.21
859	0.17
860	0.18
861	0.17
862	0.2
863	0.2
864	0.2
865	0.19
866	0.18
867	0.21
868	0.24
869	0.25
870	0.21
871	0.2
872	0.18
873	0.18
874	0.18
875	0.16
876	0.11
877	0.09
878	0.09
879	0.09
880	0.09
881	0.07
882	0.07
883	0.06
884	0.08
885	0.08
886	0.07
887	0.07
888	0.08
889	0.1
890	0.11
891	0.12
892	0.2
893	0.22
894	0.24
895	0.29
896	0.32
897	0.33
898	0.38
899	0.38
900	0.3

A0A1Y1VGM7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer