Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VMN4

Protein Details
Accession A0A1Y1VMN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55DYVLRARDYNKKQKRLRALQLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-257KGRRRKVGTDKNGLPIYKWKQERKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSLRNAVHRREHRERSQLASRERLGLLEKHKDYVLRARDYNKKQKRLRALQLKAAFKNPDEFYFKMQSTKTKDGVHIAERNEKFSAEFLKLLKTQDKNYVNYQNSINKLKIEKLKNAMHFMEKGQEENDKYYDEETNNSNHTIFVDDDDEAKNFDAAKHFNTYPELLARKFNRPTKEIVKNAKLNVDDDVNVEKLVKSRSKNIRELLSRIEREKNLSSVQNEMDIQKALMGKGRRRKVGTDKNGLPIYKWKQERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.73
4 0.74
5 0.72
6 0.68
7 0.66
8 0.59
9 0.54
10 0.5
11 0.44
12 0.38
13 0.36
14 0.37
15 0.39
16 0.38
17 0.36
18 0.37
19 0.36
20 0.36
21 0.4
22 0.41
23 0.37
24 0.4
25 0.45
26 0.54
27 0.62
28 0.7
29 0.7
30 0.73
31 0.74
32 0.79
33 0.83
34 0.83
35 0.84
36 0.84
37 0.79
38 0.79
39 0.79
40 0.77
41 0.68
42 0.64
43 0.55
44 0.45
45 0.46
46 0.38
47 0.35
48 0.34
49 0.33
50 0.32
51 0.36
52 0.35
53 0.33
54 0.33
55 0.35
56 0.38
57 0.42
58 0.42
59 0.39
60 0.4
61 0.41
62 0.43
63 0.42
64 0.38
65 0.35
66 0.4
67 0.38
68 0.39
69 0.35
70 0.31
71 0.25
72 0.22
73 0.23
74 0.15
75 0.17
76 0.15
77 0.18
78 0.2
79 0.21
80 0.26
81 0.25
82 0.26
83 0.33
84 0.37
85 0.36
86 0.4
87 0.47
88 0.42
89 0.42
90 0.42
91 0.38
92 0.38
93 0.38
94 0.33
95 0.27
96 0.27
97 0.29
98 0.34
99 0.33
100 0.33
101 0.37
102 0.42
103 0.42
104 0.44
105 0.4
106 0.34
107 0.31
108 0.27
109 0.25
110 0.2
111 0.18
112 0.15
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.17
152 0.21
153 0.21
154 0.18
155 0.24
156 0.26
157 0.32
158 0.38
159 0.43
160 0.43
161 0.42
162 0.48
163 0.5
164 0.56
165 0.57
166 0.58
167 0.61
168 0.61
169 0.6
170 0.58
171 0.5
172 0.41
173 0.35
174 0.28
175 0.21
176 0.18
177 0.19
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.12
182 0.13
183 0.18
184 0.22
185 0.22
186 0.32
187 0.42
188 0.49
189 0.55
190 0.57
191 0.6
192 0.59
193 0.6
194 0.59
195 0.57
196 0.54
197 0.51
198 0.53
199 0.46
200 0.47
201 0.47
202 0.42
203 0.37
204 0.39
205 0.36
206 0.34
207 0.33
208 0.31
209 0.29
210 0.26
211 0.23
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.13
217 0.18
218 0.24
219 0.31
220 0.4
221 0.48
222 0.53
223 0.55
224 0.63
225 0.68
226 0.73
227 0.74
228 0.75
229 0.71
230 0.72
231 0.74
232 0.66
233 0.57
234 0.56
235 0.54
236 0.53
237 0.57