Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VPE4

Protein Details
Accession A0A1Y1VPE4    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-84VCPFNKKHIVSRKNYEKHRRRCELIHydrophilic
232-260QLYAEQRDYKRRRKSYRAKNIKITKRSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-254KRRRKSYRAKNIKI
287-296KKQKIRKNKH
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022776  TRM13/UPF0224_CHHC_Znf_dom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05253  zf-U11-48K  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51800  ZF_CHHC_U11_48K  
Amino Acid Sequences MLSNFVSSEDNINNNKRNEISKLNNQIHDLEIEFENVLNKYDLNINLLLNKQSKIDDRIVCPFNKKHIVSRKNYEKHRRRCELISKGINTKLSLPNPPSSQFFYSNTNTISLLTRNINDDDNNDNKDKNDKNIEFRKEYESSDIIPSYVIKKYENDKHIICNINNPLKSKNEVQEQTVQERLNEYINDLSLSRKIESEFIDKNKNVSNFEEIMDIVEERKAQMEKSEKSKAQLYAEQRDYKRRRKSYRAKNIKITKRSATQIQKDIIESFSKDYNLYLQVQSELQAKKQKIRKNKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.43
4 0.44
5 0.44
6 0.47
7 0.48
8 0.51
9 0.6
10 0.63
11 0.62
12 0.6
13 0.56
14 0.48
15 0.42
16 0.33
17 0.25
18 0.19
19 0.17
20 0.15
21 0.14
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.17
33 0.2
34 0.22
35 0.25
36 0.22
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.26
41 0.28
42 0.34
43 0.34
44 0.35
45 0.42
46 0.45
47 0.44
48 0.46
49 0.44
50 0.44
51 0.48
52 0.46
53 0.48
54 0.54
55 0.61
56 0.62
57 0.7
58 0.73
59 0.72
60 0.81
61 0.83
62 0.83
63 0.84
64 0.87
65 0.84
66 0.78
67 0.78
68 0.78
69 0.75
70 0.74
71 0.71
72 0.64
73 0.61
74 0.59
75 0.53
76 0.44
77 0.4
78 0.37
79 0.32
80 0.34
81 0.32
82 0.34
83 0.35
84 0.36
85 0.34
86 0.31
87 0.32
88 0.3
89 0.29
90 0.3
91 0.3
92 0.3
93 0.27
94 0.24
95 0.21
96 0.19
97 0.18
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.18
108 0.2
109 0.22
110 0.21
111 0.2
112 0.2
113 0.26
114 0.25
115 0.26
116 0.32
117 0.31
118 0.38
119 0.46
120 0.5
121 0.46
122 0.46
123 0.47
124 0.39
125 0.38
126 0.33
127 0.26
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.12
139 0.18
140 0.26
141 0.28
142 0.29
143 0.28
144 0.3
145 0.35
146 0.37
147 0.31
148 0.3
149 0.33
150 0.35
151 0.36
152 0.35
153 0.32
154 0.3
155 0.33
156 0.31
157 0.3
158 0.32
159 0.31
160 0.32
161 0.38
162 0.38
163 0.37
164 0.38
165 0.33
166 0.25
167 0.25
168 0.23
169 0.18
170 0.15
171 0.14
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.18
184 0.22
185 0.25
186 0.27
187 0.34
188 0.33
189 0.34
190 0.37
191 0.36
192 0.33
193 0.3
194 0.31
195 0.25
196 0.25
197 0.24
198 0.19
199 0.17
200 0.15
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.17
210 0.24
211 0.28
212 0.35
213 0.43
214 0.42
215 0.44
216 0.5
217 0.47
218 0.44
219 0.46
220 0.45
221 0.46
222 0.51
223 0.56
224 0.53
225 0.6
226 0.64
227 0.67
228 0.71
229 0.72
230 0.75
231 0.78
232 0.87
233 0.88
234 0.9
235 0.92
236 0.9
237 0.9
238 0.91
239 0.9
240 0.87
241 0.82
242 0.77
243 0.72
244 0.69
245 0.68
246 0.68
247 0.65
248 0.65
249 0.62
250 0.57
251 0.53
252 0.49
253 0.42
254 0.34
255 0.28
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.21
260 0.2
261 0.21
262 0.22
263 0.23
264 0.22
265 0.2
266 0.21
267 0.21
268 0.22
269 0.26
270 0.24
271 0.27
272 0.34
273 0.36
274 0.43
275 0.5
276 0.57