FuNGI

A0A1Y1VMS0

Protein Details

Accession

A0A1Y1VMS0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MSEIIFKKSSKKKSLRKKNNDLSIQDE	Hydrophilic
33-64	LPIKTVTQLKSEKKKKSQKQKKKIELSFGEPE	Hydrophilic
762-781	LSLKEFSKACHNKKSSRYIF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-18	KKSSKKKSLRKK
43-55	SEKKKKSQKQKKK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.833, cyto 7, cyto_mito 4.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012890 GCFC2-like IPR022783 GCFC_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF07842 GCFC PF15458 NTR2

Amino Acid Sequences

MSEIIFKKSSKKKSLRKKNNDLSIQDEENDDDLPIKTVTQLKSEKKKKSQKQKKKIELSFGEPEEGEDVFKIKKSSASRRLAKAKLNKNVYHDDLIDNNTEESNPYSLKNLNALKNSSLNRPPPSNIIKKSQEIYNKNHNVSNAVEEIKIPDATKIHEVKKLREARRNAKNTSNFIPLESDDLMMEDKKENDDDDDEVFEDYENNRILFGNTAIKEQEKKRKKDMKIDLINAQENDSEEEDKDELNKWESELIKQGRAAPEIMKVAKKKSEMAKNLIPEVCEIPSLDEVMRDFAASLYHIELKHSEDINEEAYLIEEIDKSKKNTENLQSDLKLSSDKYTYFQELRNYIIDLAEFLDEKFKEFNKINDDYLNLKKEKELFISNRIQSDLNDCFHDFVTGWNGLVFDKEGNNVYKYDLDQKENRKMLRKLRTKTQANKNIEKENKFKSELNDIEGYISNDDFDDKDQEVYDTKKAEILKKYNEFFNDTNENFKDLSLIKKNFENWKEKYPKEYNQGFGGLSMPGVFELFIKYELLMWEPLEDYKEFEEMIWHQEASTYGTSNMMELDNYDPEDEDNKLLIRLVEKFAIPKVKELVQLWNVFSIHQTKNLLRILMLLQDYVKSKDTFFVGVINEIENKFKSTIERMFSHNPIQKVTPQKNTSPYLYDQVNYWFWKIYKVYNNMFIFEKYISKENLQVMAFDQLLNHLLVPCLDIITIIYFASSELSQKNEQKELLKFEKICHYIPEKWLSNDFSVPNYLKPLELSLKEFSKACHNKKSSRYIFEGIVKLLVKLRSYDEASKLGKLYKIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.92
3	0.93
4	0.94
5	0.94
6	0.94
7	0.91
8	0.84
9	0.79
10	0.75
11	0.66
12	0.55
13	0.46
14	0.38
15	0.3
16	0.27
17	0.19
18	0.14
19	0.13
20	0.14
21	0.13
22	0.12
23	0.15
24	0.21
25	0.23
26	0.29
27	0.37
28	0.45
29	0.56
30	0.65
31	0.71
32	0.75
33	0.85
34	0.87
35	0.9
36	0.92
37	0.92
38	0.94
39	0.95
40	0.95
41	0.95
42	0.91
43	0.9
44	0.84
45	0.8
46	0.77
47	0.67
48	0.59
49	0.47
50	0.41
51	0.33
52	0.27
53	0.2
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.14
58	0.15
59	0.14
60	0.21
61	0.29
62	0.39
63	0.47
64	0.56
65	0.62
66	0.7
67	0.78
68	0.77
69	0.78
70	0.77
71	0.77
72	0.76
73	0.77
74	0.72
75	0.69
76	0.7
77	0.66
78	0.59
79	0.51
80	0.44
81	0.38
82	0.37
83	0.32
84	0.26
85	0.22
86	0.19
87	0.17
88	0.16
89	0.15
90	0.16
91	0.15
92	0.14
93	0.17
94	0.19
95	0.2
96	0.27
97	0.31
98	0.34
99	0.38
100	0.4
101	0.4
102	0.44
103	0.46
104	0.45
105	0.46
106	0.46
107	0.47
108	0.48
109	0.48
110	0.49
111	0.55
112	0.57
113	0.54
114	0.56
115	0.56
116	0.57
117	0.58
118	0.56
119	0.57
120	0.54
121	0.56
122	0.59
123	0.61
124	0.59
125	0.58
126	0.52
127	0.45
128	0.41
129	0.37
130	0.29
131	0.23
132	0.21
133	0.19
134	0.2
135	0.19
136	0.19
137	0.15
138	0.15
139	0.14
140	0.17
141	0.24
142	0.28
143	0.29
144	0.34
145	0.37
146	0.4
147	0.48
148	0.56
149	0.56
150	0.59
151	0.65
152	0.68
153	0.76
154	0.79
155	0.74
156	0.73
157	0.72
158	0.69
159	0.64
160	0.61
161	0.51
162	0.44
163	0.42
164	0.33
165	0.3
166	0.25
167	0.2
168	0.13
169	0.14
170	0.14
171	0.12
172	0.13
173	0.11
174	0.11
175	0.12
176	0.13
177	0.13
178	0.15
179	0.16
180	0.16
181	0.15
182	0.16
183	0.15
184	0.14
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.12
194	0.13
195	0.12
196	0.14
197	0.17
198	0.17
199	0.18
200	0.19
201	0.21
202	0.26
203	0.32
204	0.41
205	0.44
206	0.49
207	0.58
208	0.67
209	0.71
210	0.76
211	0.79
212	0.79
213	0.78
214	0.76
215	0.71
216	0.65
217	0.62
218	0.52
219	0.42
220	0.32
221	0.24
222	0.22
223	0.19
224	0.15
225	0.12
226	0.14
227	0.13
228	0.13
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.15
233	0.15
234	0.14
235	0.18
236	0.19
237	0.19
238	0.25
239	0.25
240	0.25
241	0.26
242	0.29
243	0.27
244	0.27
245	0.27
246	0.19
247	0.2
248	0.22
249	0.23
250	0.24
251	0.23
252	0.26
253	0.29
254	0.29
255	0.32
256	0.37
257	0.44
258	0.45
259	0.49
260	0.5
261	0.48
262	0.51
263	0.46
264	0.38
265	0.3
266	0.27
267	0.2
268	0.16
269	0.14
270	0.11
271	0.1
272	0.11
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.08
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.1
286	0.1
287	0.11
288	0.12
289	0.14
290	0.18
291	0.18
292	0.16
293	0.15
294	0.16
295	0.16
296	0.15
297	0.13
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.06
305	0.1
306	0.13
307	0.14
308	0.19
309	0.23
310	0.26
311	0.32
312	0.39
313	0.41
314	0.41
315	0.45
316	0.4
317	0.37
318	0.35
319	0.28
320	0.22
321	0.17
322	0.16
323	0.12
324	0.12
325	0.13
326	0.15
327	0.19
328	0.19
329	0.22
330	0.24
331	0.23
332	0.25
333	0.24
334	0.22
335	0.18
336	0.16
337	0.13
338	0.09
339	0.09
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.09
344	0.09
345	0.1
346	0.12
347	0.11
348	0.15
349	0.16
350	0.2
351	0.22
352	0.25
353	0.25
354	0.24
355	0.25
356	0.25
357	0.28
358	0.29
359	0.24
360	0.22
361	0.22
362	0.24
363	0.24
364	0.22
365	0.24
366	0.22
367	0.28
368	0.34
369	0.34
370	0.32
371	0.31
372	0.29
373	0.23
374	0.26
375	0.22
376	0.17
377	0.17
378	0.16
379	0.16
380	0.15
381	0.15
382	0.1
383	0.08
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.08
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.12
402	0.2
403	0.2
404	0.23
405	0.28
406	0.33
407	0.41
408	0.44
409	0.45
410	0.44
411	0.47
412	0.53
413	0.57
414	0.6
415	0.56
416	0.61
417	0.69
418	0.69
419	0.73
420	0.75
421	0.74
422	0.72
423	0.76
424	0.71
425	0.69
426	0.67
427	0.62
428	0.56
429	0.52
430	0.5
431	0.45
432	0.44
433	0.37
434	0.4
435	0.37
436	0.35
437	0.3
438	0.26
439	0.25
440	0.23
441	0.21
442	0.13
443	0.12
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.09
453	0.1
454	0.11
455	0.13
456	0.15
457	0.13
458	0.13
459	0.16
460	0.18
461	0.23
462	0.28
463	0.31
464	0.36
465	0.41
466	0.42
467	0.42
468	0.41
469	0.41
470	0.34
471	0.34
472	0.33
473	0.28
474	0.32
475	0.29
476	0.29
477	0.24
478	0.24
479	0.21
480	0.15
481	0.21
482	0.25
483	0.26
484	0.26
485	0.28
486	0.33
487	0.38
488	0.43
489	0.44
490	0.39
491	0.48
492	0.54
493	0.53
494	0.57
495	0.56
496	0.57
497	0.58
498	0.59
499	0.51
500	0.45
501	0.46
502	0.37
503	0.3
504	0.25
505	0.16
506	0.11
507	0.09
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.04
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.08
523	0.08
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.11
534	0.11
535	0.14
536	0.14
537	0.13
538	0.12
539	0.13
540	0.14
541	0.15
542	0.15
543	0.12
544	0.11
545	0.12
546	0.12
547	0.11
548	0.12
549	0.08
550	0.07
551	0.07
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.1
556	0.09
557	0.09
558	0.11
559	0.11
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.1
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.14
570	0.14
571	0.16
572	0.19
573	0.25
574	0.24
575	0.24
576	0.25
577	0.27
578	0.31
579	0.31
580	0.34
581	0.32
582	0.34
583	0.32
584	0.32
585	0.29
586	0.25
587	0.25
588	0.25
589	0.2
590	0.22
591	0.25
592	0.23
593	0.29
594	0.31
595	0.3
596	0.23
597	0.24
598	0.21
599	0.21
600	0.21
601	0.14
602	0.13
603	0.15
604	0.17
605	0.17
606	0.19
607	0.16
608	0.16
609	0.18
610	0.19
611	0.18
612	0.17
613	0.18
614	0.16
615	0.17
616	0.17
617	0.15
618	0.16
619	0.15
620	0.17
621	0.14
622	0.16
623	0.15
624	0.16
625	0.18
626	0.22
627	0.27
628	0.3
629	0.31
630	0.35
631	0.4
632	0.43
633	0.48
634	0.47
635	0.42
636	0.4
637	0.4
638	0.4
639	0.45
640	0.49
641	0.5
642	0.49
643	0.53
644	0.57
645	0.59
646	0.56
647	0.5
648	0.46
649	0.41
650	0.38
651	0.33
652	0.28
653	0.28
654	0.3
655	0.27
656	0.25
657	0.24
658	0.22
659	0.28
660	0.28
661	0.31
662	0.36
663	0.41
664	0.44
665	0.5
666	0.5
667	0.47
668	0.47
669	0.39
670	0.33
671	0.27
672	0.27
673	0.2
674	0.24
675	0.24
676	0.24
677	0.29
678	0.29
679	0.33
680	0.3
681	0.28
682	0.24
683	0.25
684	0.24
685	0.19
686	0.16
687	0.12
688	0.13
689	0.13
690	0.12
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.09
696	0.07
697	0.07
698	0.06
699	0.07
700	0.08
701	0.08
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.09
707	0.08
708	0.1
709	0.11
710	0.16
711	0.22
712	0.28
713	0.33
714	0.35
715	0.38
716	0.41
717	0.44
718	0.49
719	0.49
720	0.51
721	0.47
722	0.47
723	0.54
724	0.51
725	0.48
726	0.45
727	0.46
728	0.44
729	0.49
730	0.54
731	0.48
732	0.48
733	0.52
734	0.49
735	0.46
736	0.45
737	0.4
738	0.33
739	0.35
740	0.33
741	0.3
742	0.31
743	0.29
744	0.24
745	0.24
746	0.27
747	0.28
748	0.29
749	0.31
750	0.32
751	0.34
752	0.36
753	0.35
754	0.32
755	0.36
756	0.44
757	0.47
758	0.52
759	0.56
760	0.63
761	0.71
762	0.81
763	0.78
764	0.75
765	0.75
766	0.68
767	0.67
768	0.65
769	0.59
770	0.49
771	0.45
772	0.38
773	0.33
774	0.34
775	0.31
776	0.25
777	0.24
778	0.27
779	0.28
780	0.33
781	0.38
782	0.37
783	0.41
784	0.42
785	0.43
786	0.42
787	0.4

A0A1Y1VMS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer