Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VNX7

Protein Details
Accession A0A1Y1VNX7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
434-454DIMRIHKERINKANKRRTIMSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MAGKNDNSYYYDENSSYYNKDSGKGGDKYDSRYYDDSQYYDDSKYYDKGNDSRYYDDSQYYDDKRRSNGRYDSQYYDNSQYYDDSQYYDDRGESRYDDSRYDDSRYDDSRYDDSRYADSRYDDSRYDDSQYYDDRRDDKGGYKNSSKPRDSVSEFNAYYDDDDYNDPPRGESQDPPRGDSSRNYDDSRYDDGYSRYDDSRYDRDSRYDSRYDDDTYRDSRYDSRYAYDDGYNDSRYDDNYRDSRYDSRYDDRYNDNRYDDNNNNKEPSRDVDDLNKKMDDMKLNNKDGKEENICYSCGNPIKGKAHPKNGHVYCAKDYVMLFAPRCKKCQKPIKGETVCALGNKYHKACFSCITCNTPFPDKSFYVFNNNPVCRRHYHQLNNSLCTKCDEPIEGPCAEVIEGRFHPKCFVCTVCQVPLTGLYYNYQGEAYCEEDIMRIHKERINKANKRRTIMSYIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.27
4 0.26
5 0.28
6 0.25
7 0.27
8 0.29
9 0.32
10 0.37
11 0.38
12 0.38
13 0.41
14 0.43
15 0.47
16 0.53
17 0.5
18 0.46
19 0.47
20 0.47
21 0.46
22 0.47
23 0.41
24 0.37
25 0.37
26 0.35
27 0.32
28 0.3
29 0.24
30 0.23
31 0.24
32 0.24
33 0.25
34 0.28
35 0.33
36 0.39
37 0.45
38 0.45
39 0.47
40 0.48
41 0.48
42 0.44
43 0.41
44 0.36
45 0.32
46 0.36
47 0.36
48 0.41
49 0.41
50 0.42
51 0.46
52 0.54
53 0.54
54 0.56
55 0.6
56 0.61
57 0.65
58 0.67
59 0.66
60 0.61
61 0.6
62 0.55
63 0.51
64 0.44
65 0.36
66 0.31
67 0.27
68 0.26
69 0.26
70 0.22
71 0.18
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.19
76 0.18
77 0.15
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.2
82 0.24
83 0.25
84 0.25
85 0.29
86 0.33
87 0.33
88 0.35
89 0.33
90 0.31
91 0.35
92 0.36
93 0.34
94 0.31
95 0.32
96 0.34
97 0.34
98 0.35
99 0.33
100 0.32
101 0.33
102 0.33
103 0.32
104 0.29
105 0.29
106 0.28
107 0.28
108 0.29
109 0.25
110 0.28
111 0.28
112 0.27
113 0.29
114 0.27
115 0.26
116 0.26
117 0.29
118 0.29
119 0.28
120 0.3
121 0.29
122 0.3
123 0.31
124 0.3
125 0.32
126 0.37
127 0.4
128 0.43
129 0.46
130 0.51
131 0.57
132 0.63
133 0.58
134 0.52
135 0.49
136 0.51
137 0.49
138 0.47
139 0.42
140 0.41
141 0.39
142 0.38
143 0.34
144 0.27
145 0.24
146 0.2
147 0.16
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.14
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.19
158 0.23
159 0.28
160 0.34
161 0.35
162 0.37
163 0.38
164 0.36
165 0.35
166 0.34
167 0.34
168 0.32
169 0.35
170 0.34
171 0.33
172 0.32
173 0.35
174 0.35
175 0.3
176 0.24
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.24
181 0.22
182 0.18
183 0.17
184 0.17
185 0.2
186 0.24
187 0.26
188 0.28
189 0.27
190 0.29
191 0.33
192 0.36
193 0.37
194 0.34
195 0.32
196 0.3
197 0.31
198 0.31
199 0.28
200 0.26
201 0.23
202 0.22
203 0.23
204 0.2
205 0.19
206 0.2
207 0.23
208 0.24
209 0.22
210 0.21
211 0.21
212 0.23
213 0.23
214 0.21
215 0.17
216 0.16
217 0.18
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.16
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.23
230 0.26
231 0.26
232 0.29
233 0.29
234 0.31
235 0.33
236 0.34
237 0.35
238 0.38
239 0.4
240 0.41
241 0.4
242 0.37
243 0.34
244 0.34
245 0.38
246 0.37
247 0.41
248 0.41
249 0.39
250 0.4
251 0.39
252 0.38
253 0.32
254 0.3
255 0.27
256 0.24
257 0.23
258 0.3
259 0.38
260 0.39
261 0.4
262 0.37
263 0.3
264 0.3
265 0.32
266 0.28
267 0.24
268 0.32
269 0.38
270 0.42
271 0.45
272 0.43
273 0.43
274 0.39
275 0.4
276 0.35
277 0.29
278 0.29
279 0.27
280 0.28
281 0.25
282 0.24
283 0.23
284 0.22
285 0.22
286 0.2
287 0.24
288 0.27
289 0.33
290 0.43
291 0.44
292 0.52
293 0.54
294 0.57
295 0.61
296 0.59
297 0.6
298 0.52
299 0.49
300 0.4
301 0.39
302 0.35
303 0.26
304 0.25
305 0.21
306 0.23
307 0.23
308 0.21
309 0.24
310 0.34
311 0.34
312 0.39
313 0.41
314 0.44
315 0.51
316 0.61
317 0.64
318 0.66
319 0.72
320 0.79
321 0.76
322 0.71
323 0.63
324 0.56
325 0.47
326 0.37
327 0.3
328 0.22
329 0.22
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.28
334 0.3
335 0.31
336 0.33
337 0.34
338 0.35
339 0.36
340 0.39
341 0.38
342 0.38
343 0.4
344 0.41
345 0.38
346 0.34
347 0.37
348 0.33
349 0.33
350 0.35
351 0.33
352 0.36
353 0.37
354 0.41
355 0.44
356 0.46
357 0.48
358 0.46
359 0.47
360 0.43
361 0.48
362 0.5
363 0.51
364 0.58
365 0.62
366 0.7
367 0.72
368 0.71
369 0.71
370 0.62
371 0.53
372 0.47
373 0.4
374 0.32
375 0.29
376 0.28
377 0.24
378 0.28
379 0.31
380 0.26
381 0.25
382 0.23
383 0.21
384 0.18
385 0.17
386 0.13
387 0.15
388 0.17
389 0.24
390 0.26
391 0.26
392 0.31
393 0.31
394 0.32
395 0.31
396 0.33
397 0.31
398 0.35
399 0.4
400 0.39
401 0.38
402 0.36
403 0.32
404 0.32
405 0.3
406 0.24
407 0.2
408 0.17
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.16
413 0.13
414 0.14
415 0.15
416 0.17
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.16
422 0.18
423 0.21
424 0.21
425 0.24
426 0.27
427 0.35
428 0.43
429 0.52
430 0.6
431 0.65
432 0.73
433 0.79
434 0.83
435 0.82
436 0.8
437 0.76