Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VDB7

Protein Details
Accession A0A1Y1VDB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-100FLSKLPIHKNQSPKKNKSNNVNGISYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007846  RRM_NUP35_dom  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF14605  Nup35_RRM_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51472  RRM_NUP35  
Amino Acid Sequences MSIPLPVAGGKISFSDWPKNNQDNEQRLSNKEKVFSRISNKYQPFKNNSEKNHIQDPFNIEEENVDKSNEYVSSFLSKLPIHKNQSPKKNKSNNVNGISYGESYYKGVDGNLLYDGPPHVTLDELSSSPEKQPFSSKLKTMSFLPNFSNQDNNLLNSPINNNNLYNNNNNNDNKINSLFGNKIQSQINNNSNSINNNSNNNSIFNSTPLNINKNPLYSSPNRNHIVNPAISNDINKNLNSIVIYGYPTFLENDILNHFKSYGEISSYESLNENNWIIITYRNSYSTKNAMQKNKNPFFFKNNIMGIMTHYDYTQLLKSNQYNISNNSTNSIFQSNSTLAFQSTNPVHNNSTINNINSNSIFNTTNNSMSLWNNKAMSSTLNFTPSEKENSFSNSIGNINNESNMNVDNDISMNNHFSNLSTNSINSTFKVHNSSNNLFKKNTVLLNPQESIKKNSQLSNELLNSNSNSSNTHINNFDINPKPSIFSNSNNNNNIGKPLLNSSFSPGRNTTDNNVASSSTKPKVSFAMNINDETIQNKTVYNKNNPFINLLNEENNAKMNEEKTTNFNKRSSFFHNSHHSSSSLNEASSSITIPKIGSNKISKPKPSSSIVKDNNPGLLGKMVELVFGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.29
3 0.32
4 0.39
5 0.48
6 0.54
7 0.57
8 0.61
9 0.67
10 0.65
11 0.66
12 0.67
13 0.62
14 0.6
15 0.64
16 0.62
17 0.56
18 0.55
19 0.54
20 0.52
21 0.55
22 0.57
23 0.58
24 0.6
25 0.64
26 0.67
27 0.7
28 0.72
29 0.73
30 0.75
31 0.74
32 0.73
33 0.76
34 0.74
35 0.73
36 0.75
37 0.74
38 0.7
39 0.72
40 0.67
41 0.58
42 0.55
43 0.55
44 0.49
45 0.43
46 0.38
47 0.28
48 0.27
49 0.27
50 0.26
51 0.21
52 0.17
53 0.15
54 0.15
55 0.18
56 0.16
57 0.16
58 0.12
59 0.13
60 0.17
61 0.17
62 0.18
63 0.2
64 0.2
65 0.25
66 0.33
67 0.4
68 0.43
69 0.49
70 0.59
71 0.64
72 0.74
73 0.79
74 0.8
75 0.82
76 0.84
77 0.86
78 0.86
79 0.87
80 0.86
81 0.81
82 0.73
83 0.63
84 0.55
85 0.49
86 0.39
87 0.3
88 0.21
89 0.16
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.16
115 0.18
116 0.22
117 0.21
118 0.2
119 0.27
120 0.31
121 0.37
122 0.41
123 0.41
124 0.45
125 0.46
126 0.47
127 0.45
128 0.48
129 0.43
130 0.41
131 0.41
132 0.41
133 0.41
134 0.4
135 0.4
136 0.3
137 0.33
138 0.32
139 0.31
140 0.24
141 0.22
142 0.21
143 0.19
144 0.22
145 0.2
146 0.22
147 0.22
148 0.21
149 0.23
150 0.28
151 0.3
152 0.32
153 0.32
154 0.32
155 0.38
156 0.38
157 0.38
158 0.37
159 0.34
160 0.32
161 0.28
162 0.26
163 0.2
164 0.22
165 0.2
166 0.2
167 0.25
168 0.22
169 0.24
170 0.25
171 0.27
172 0.29
173 0.35
174 0.39
175 0.35
176 0.35
177 0.34
178 0.33
179 0.32
180 0.31
181 0.29
182 0.25
183 0.26
184 0.28
185 0.3
186 0.29
187 0.28
188 0.26
189 0.22
190 0.2
191 0.18
192 0.17
193 0.14
194 0.19
195 0.2
196 0.24
197 0.23
198 0.26
199 0.26
200 0.26
201 0.27
202 0.23
203 0.27
204 0.27
205 0.35
206 0.37
207 0.43
208 0.44
209 0.43
210 0.42
211 0.4
212 0.39
213 0.32
214 0.28
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.22
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.09
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.2
272 0.23
273 0.27
274 0.32
275 0.38
276 0.43
277 0.49
278 0.55
279 0.63
280 0.65
281 0.63
282 0.6
283 0.56
284 0.53
285 0.5
286 0.47
287 0.41
288 0.35
289 0.31
290 0.27
291 0.25
292 0.2
293 0.18
294 0.15
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.13
304 0.14
305 0.19
306 0.22
307 0.24
308 0.25
309 0.26
310 0.31
311 0.29
312 0.28
313 0.25
314 0.22
315 0.2
316 0.19
317 0.18
318 0.12
319 0.1
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.15
331 0.16
332 0.18
333 0.18
334 0.2
335 0.21
336 0.18
337 0.22
338 0.21
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.19
343 0.18
344 0.18
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.11
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.14
355 0.14
356 0.19
357 0.17
358 0.18
359 0.18
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.17
364 0.13
365 0.14
366 0.13
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.18
371 0.19
372 0.23
373 0.21
374 0.21
375 0.2
376 0.24
377 0.26
378 0.23
379 0.21
380 0.17
381 0.18
382 0.17
383 0.17
384 0.15
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.13
405 0.14
406 0.16
407 0.14
408 0.14
409 0.16
410 0.18
411 0.19
412 0.15
413 0.18
414 0.16
415 0.18
416 0.23
417 0.22
418 0.26
419 0.33
420 0.36
421 0.41
422 0.46
423 0.48
424 0.42
425 0.42
426 0.4
427 0.37
428 0.37
429 0.31
430 0.3
431 0.31
432 0.35
433 0.36
434 0.34
435 0.35
436 0.34
437 0.36
438 0.35
439 0.37
440 0.36
441 0.39
442 0.41
443 0.4
444 0.4
445 0.41
446 0.39
447 0.33
448 0.31
449 0.28
450 0.25
451 0.23
452 0.22
453 0.16
454 0.15
455 0.16
456 0.22
457 0.22
458 0.24
459 0.23
460 0.23
461 0.25
462 0.25
463 0.31
464 0.29
465 0.3
466 0.29
467 0.28
468 0.28
469 0.26
470 0.32
471 0.27
472 0.27
473 0.34
474 0.41
475 0.49
476 0.49
477 0.51
478 0.47
479 0.44
480 0.41
481 0.33
482 0.25
483 0.18
484 0.21
485 0.21
486 0.21
487 0.21
488 0.25
489 0.3
490 0.3
491 0.33
492 0.3
493 0.31
494 0.32
495 0.35
496 0.33
497 0.34
498 0.35
499 0.32
500 0.31
501 0.29
502 0.27
503 0.27
504 0.3
505 0.25
506 0.27
507 0.26
508 0.27
509 0.3
510 0.32
511 0.34
512 0.33
513 0.39
514 0.37
515 0.38
516 0.38
517 0.34
518 0.31
519 0.27
520 0.24
521 0.16
522 0.14
523 0.15
524 0.19
525 0.25
526 0.32
527 0.41
528 0.47
529 0.5
530 0.55
531 0.54
532 0.53
533 0.48
534 0.46
535 0.4
536 0.35
537 0.33
538 0.3
539 0.29
540 0.26
541 0.27
542 0.22
543 0.19
544 0.2
545 0.18
546 0.21
547 0.23
548 0.24
549 0.28
550 0.38
551 0.45
552 0.47
553 0.5
554 0.5
555 0.5
556 0.54
557 0.56
558 0.54
559 0.49
560 0.52
561 0.58
562 0.59
563 0.61
564 0.57
565 0.49
566 0.42
567 0.4
568 0.4
569 0.31
570 0.25
571 0.22
572 0.2
573 0.21
574 0.21
575 0.2
576 0.14
577 0.12
578 0.13
579 0.13
580 0.18
581 0.2
582 0.23
583 0.29
584 0.35
585 0.43
586 0.52
587 0.6
588 0.63
589 0.66
590 0.7
591 0.69
592 0.69
593 0.69
594 0.67
595 0.71
596 0.7
597 0.71
598 0.69
599 0.65
600 0.61
601 0.52
602 0.44
603 0.35
604 0.31
605 0.23
606 0.18
607 0.2
608 0.17