Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G3AFJ7

Protein Details
Accession G3AFJ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-301SIFLKSKRPAPPPVKRTPEKKKVLEQSPTKIKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-291RKRKSAPSIFLKSKRPAPPPVKRTPEKKKV
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG spaa:SPAPADRAFT_58109  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MDQLFEDKGPSLPRSNVPTLVHLCISCLRKNTSQIQDVGPTPYHLLEPVLERMSAKQLNQLETASPQLIPFSDKLWVKLIEREFPDRPGKLPLDIKSSMPYKTLFERYVKDREEFKQDSAMRLRNITHKLERKKLQNKVVKLDQVLKDPTIRRRPSRESWSTMTSAQNKGSILSKVRRDMQSRSIMFTKSPAMKRYDPFDVFKTQPERIRSVKTTPVKRTTFFDGSNDKPTINTTTTTNNTTTTKSESPPSENKPIVVPVLRKRKSAPSIFLKSKRPAPPPVKRTPEKKKVLEQSPTKIKQIKSSIFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.45
4 0.42
5 0.46
6 0.45
7 0.44
8 0.4
9 0.32
10 0.31
11 0.31
12 0.34
13 0.31
14 0.32
15 0.34
16 0.37
17 0.44
18 0.51
19 0.52
20 0.53
21 0.52
22 0.5
23 0.49
24 0.45
25 0.43
26 0.34
27 0.28
28 0.24
29 0.22
30 0.19
31 0.15
32 0.15
33 0.12
34 0.15
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.24
41 0.25
42 0.22
43 0.25
44 0.28
45 0.3
46 0.31
47 0.3
48 0.24
49 0.23
50 0.25
51 0.19
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.16
60 0.16
61 0.18
62 0.22
63 0.24
64 0.23
65 0.29
66 0.3
67 0.3
68 0.33
69 0.37
70 0.34
71 0.37
72 0.42
73 0.36
74 0.35
75 0.35
76 0.33
77 0.32
78 0.36
79 0.33
80 0.33
81 0.34
82 0.33
83 0.31
84 0.32
85 0.28
86 0.24
87 0.23
88 0.19
89 0.23
90 0.27
91 0.25
92 0.27
93 0.3
94 0.33
95 0.39
96 0.39
97 0.37
98 0.37
99 0.37
100 0.42
101 0.4
102 0.36
103 0.37
104 0.36
105 0.38
106 0.38
107 0.4
108 0.31
109 0.31
110 0.32
111 0.3
112 0.33
113 0.33
114 0.36
115 0.4
116 0.46
117 0.52
118 0.57
119 0.6
120 0.65
121 0.68
122 0.7
123 0.68
124 0.66
125 0.64
126 0.62
127 0.55
128 0.48
129 0.47
130 0.39
131 0.36
132 0.34
133 0.28
134 0.27
135 0.28
136 0.34
137 0.36
138 0.39
139 0.39
140 0.45
141 0.51
142 0.54
143 0.6
144 0.57
145 0.53
146 0.52
147 0.51
148 0.46
149 0.41
150 0.38
151 0.33
152 0.3
153 0.26
154 0.24
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.17
159 0.18
160 0.21
161 0.24
162 0.26
163 0.31
164 0.35
165 0.36
166 0.38
167 0.41
168 0.45
169 0.42
170 0.42
171 0.39
172 0.35
173 0.32
174 0.3
175 0.28
176 0.25
177 0.28
178 0.28
179 0.32
180 0.35
181 0.37
182 0.4
183 0.42
184 0.38
185 0.37
186 0.37
187 0.36
188 0.33
189 0.37
190 0.37
191 0.34
192 0.36
193 0.37
194 0.39
195 0.37
196 0.43
197 0.4
198 0.4
199 0.45
200 0.48
201 0.53
202 0.56
203 0.62
204 0.58
205 0.57
206 0.57
207 0.55
208 0.52
209 0.44
210 0.42
211 0.39
212 0.4
213 0.44
214 0.4
215 0.32
216 0.28
217 0.29
218 0.28
219 0.23
220 0.21
221 0.17
222 0.24
223 0.26
224 0.29
225 0.28
226 0.26
227 0.27
228 0.28
229 0.28
230 0.28
231 0.28
232 0.27
233 0.32
234 0.33
235 0.38
236 0.44
237 0.48
238 0.5
239 0.47
240 0.46
241 0.42
242 0.41
243 0.38
244 0.35
245 0.35
246 0.36
247 0.46
248 0.48
249 0.48
250 0.5
251 0.56
252 0.59
253 0.6
254 0.59
255 0.58
256 0.65
257 0.72
258 0.75
259 0.73
260 0.7
261 0.72
262 0.72
263 0.68
264 0.69
265 0.7
266 0.74
267 0.75
268 0.8
269 0.81
270 0.8
271 0.85
272 0.85
273 0.85
274 0.85
275 0.83
276 0.83
277 0.83
278 0.84
279 0.84
280 0.8
281 0.8
282 0.81
283 0.77
284 0.75
285 0.71
286 0.64
287 0.64
288 0.66